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國自然的前期“工作基礎(chǔ)”部分,也是國自然項目判斷延續(xù)性最重要的部分。
需要注意的是,該部分有兩個關(guān)鍵點:
那么我們就今年審閱的幾百份標書,總結(jié)出來的“工作基礎(chǔ)”問題給大家陳述一下: (一)預實驗體量不足 這個問題最為突出,可想而知,本身作為臨床醫(yī)生,科研只是附帶做做,哪有精力跟大家一起“卷”,所以最后形成的本子中的預實驗,往往只有大量的“生信圖”和少量的柱狀圖、WB結(jié)果。 而除了精力問題導致預實驗不足以外,還有一個認知問題也很嚴重,就是申請人設(shè)計的國自然假說太簡單導致,殊不知別人的本子不僅思路“卷”、預實驗也“卷”,所以這就導致“瞎子摸象”的困局,始終摸不到國自然的“真象”,那么距離國自然中標也就十分遙遠。 為什么預實驗要足夠多?①專家挑刺時,不會以證據(jù)鏈不足秒殺你;②預實驗多可以彌補一下“文章不夠好”的短板;③預實驗多,證明你花了很多經(jīng)費,那你并不是白嫖的態(tài)度來對待國自然,專家也能看到你的努力。 有些童鞋會問:會不會因為預實驗多,專家覺得你都做完了而不予資助? 既然國自然本子包含多方面顧慮,存在各種心理維度的博弈,青椒哥在面對這個問題時,更愿意相信專家喜歡“預實驗充足”的本子。 兩害相權(quán)取其輕,永遠是國自然本子的正解。 所以預實驗應該包括3-4張組圖: ① 第一張:證明你的細胞系和動物模型,成功; ② 第二張:生信分析、分子信號軸關(guān)鍵分子和臨床問題的相關(guān)性,驗證關(guān)鍵分子在臨床樣本、細胞系和動物模型中的表達趨勢; ③ 第三張:過表達或者沉默干預后,觀察細胞和動物模型的表型,檢測一下XXX通路的激活情況; ④ 第四張:數(shù)據(jù)庫預測以及分子對接分析;加一個分子互作的實驗圖,證明分子機制的假說成立。 (二)圖注(legend)不詳實、預實驗圖模糊不清 字面意思,就是圖注缺失,或者描述過于粗糙,沒有介紹單圖的實驗方法和分組情況。 而有些童鞋的預實驗圖非常模糊,圖像像素極低,這又不利于專家審閱,不美觀 (三)對照組缺失 對照組包括空白對照、陰性對照、陽性對照,但一般來講,至少要有陰性對照,空白對照可以忽略。陽性對照大部分情況不是必須的,但是藥物實驗中陽性對照卻是必須的。 而過表達和敲低這種實驗,陰性對照組一定需要,切不可省略。一般用“空白質(zhì)?!薄皊crambles”“sh-NC”“si-NC”“Mock”作為陰性對照組。
(四)內(nèi)參前后文不一致 全細胞WB內(nèi)參一般有GAPDH、β-actin、β-tubulin等,但有時候因為代表作屬于早幾年發(fā)表的,所以和現(xiàn)在預實驗之間的內(nèi)參可能會存在差異,這種都可以理解,但最好是內(nèi)參保持一致。但有時候同一批預實驗中內(nèi)參也有不一致的情況,還望前后保持一致。 (五)沒有統(tǒng)計顯著性標注 預實驗按理來講都是要做到技術(shù)性重復和生物學重復,因此每個實驗務必形成一個統(tǒng)計學分析結(jié)果,并且附帶顯著性標注“***”“ns(不具有統(tǒng)計學意義)”等。 當然如果預實驗太多,可以選擇性進行統(tǒng)計分析。 (六)WB條帶背景不均一或者分子量(kDa)沒標注 有些WB看起來比較假,因為背景不均衡,不均一,像是不同實驗條件下產(chǎn)生的,而且有時候單圖的邊緣有明顯的的切割的痕跡。 另外一個經(jīng)常出現(xiàn)的問題就是:WB結(jié)果不標注分子量。這不是一個特別規(guī)范的學術(shù)行為。
(七)分子機制的結(jié)果缺失 分子機制的證據(jù)鏈往往成本很高,畢竟CO-IP、pulldown、ChIP、熒光素酶報告實驗等的成本不低,而且往往做了也不一定有陽性結(jié)果,所以很多本子并沒有放分子機制的預實驗結(jié)果圖,這也是很多國自然本子的通病之一。解決方案就是用數(shù)據(jù)庫預測、motif預測、各種炫酷的分子對接分析來彌補了。
(八)腫瘤本子預實驗只有一株細胞系 強烈建議腫瘤類的本子,預實驗中最好使用兩株細胞系做功能實驗,并且腫瘤類的本子一定含有體內(nèi)實驗。 (九)已取得工作成績部分 已取得工作成績部分要簡明扼要,一般的格式是
而有些童鞋,把各種實驗圖都抖出來,羅列出10-20張小圖,光圖片的序號都排到了10幾,這樣的閱讀感受非常不好,專家讀著累,打分不會太高。
科研者之家旗下的青椒醫(yī)學,開啟了總第11期訓練營(即2023年國自然絕密班),絕密班的目標很明確,即通過80項國自然中標經(jīng)驗分享+7大國自然熱點標書模板針對性解析,自4月7日開始,通過2.5個月的系統(tǒng)化訓練,讓大家能夠在“實戰(zhàn)化”場景中,真正掌握課題設(shè)計的邏輯精妙和標書撰寫技巧,提高標書水平和質(zhì)量,大幅增加被審稿專家認可的概率。
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