黃元御對溫病的理論貢獻(xiàn)，集中體現(xiàn)在“以六氣統(tǒng)六經(jīng)、以氣機(jī)升降辨溫病”這一獨(dú)特體系中，與葉天士、吳鞠通等“衛(wèi)氣營血”“三焦”說并立而自成一家。其要點(diǎn)可概括為以下四條：
六氣樞軸—把“傷寒/溫病”統(tǒng)一在六氣框架內(nèi)
黃氏認(rèn)為一切外感皆本于“六氣”（風(fēng)、熱、暑、濕、燥、寒）之偏，溫病并非獨(dú)立于傷寒之外，而是“感溫?zé)嶂畾饧窗l(fā)者為溫病，由寒化熱者亦歸于溫”。他以“少陽相火—厥陰風(fēng)木”為樞軸，火郁發(fā)則為熱，風(fēng)煽則化溫，故溫病之要在于“火郁”“風(fēng)動”與“土濕”三者交搏。
病機(jī)核心—土濕、木郁、火遏
黃元御提出“百病率由土濕”，脾土一濕，清陽不升，則肝木郁遏；木郁則化火，火遏于中焦，遂成“溫”。因此溫病初起即見“中氣痞塞、升降失司”之象：身熱、口苦、脘悶、頭眩、溺黃等，皆屬“土濕木郁，火遏陽明”。
辨證綱領(lǐng)—六經(jīng)仍為綱，重在“氣機(jī)升降”
他不取衛(wèi)氣營血分層辨證，而是沿《傷寒論》六經(jīng)名目，但賦予“升降出人”的新內(nèi)涵：
太陽：寒水之經(jīng)，郁而化熱→“開玄府，發(fā)陽郁”；
陽明：燥金之經(jīng)，火邪順降→“清降肺胃，瀉熱救陰”；
少陽：相火之經(jīng)，火郁發(fā)之→“升散木火，兼滲脾濕”；
太陰：濕土之經(jīng)，濕熱交蒸→“燥土利濕，溫運(yùn)脾陽”；
少陰：水火之經(jīng)，陰傷火亢→“扶陽益陰，導(dǎo)火下行”；
厥陰：風(fēng)木之經(jīng)，風(fēng)火相煽→“平木息風(fēng)，瀉火潤燥”。
總以“升清降濁、復(fù)其中樞”為急務(wù)，而不獨(dú)執(zhí)“滋陰清熱”一法。
治療要?jiǎng)t—首重“轉(zhuǎn)中樞、開郁火、瀉濕熱”
(1) 轉(zhuǎn)中樞：幾乎每方必用茯苓、甘草、干姜（或人參）以復(fù)中陽，使“一氣周流”。
(2) 開郁火：喜用梔子、黃芩、竹葉、連翹輕宣郁熱，忌早投苦寒直折。
(3) 瀉濕熱：熱重于濕者，仿茵陳蒿、梔子大黃輩；濕重于熱者，用五苓、苓桂術(shù)甘；濕熱并重者，主以甘草茵陳湯加滑石、澤瀉，使“從小便而泄”。
(4) 忌滋陰過早：“重以滋陰助濕，敗其脾腎微陽，十病九死”，必待“中陽復(fù)、濕火退”后才可酌加麥門冬、沙參之屬。
簡言之，黃元御眼中最關(guān)鍵的“溫病”不是“熱傷陰液”，而是“土濕—木郁—火遏”導(dǎo)致的氣機(jī)升降失常。因此他的溫病理論可歸結(jié)為一句話：
“治溫勿徒清熱，首當(dāng)運(yùn)中化濕、升清降濁；濕去火自散，中樞一轉(zhuǎn)，溫邪乃解?！?/div>
