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RNA按照能否編碼蛋白可分為：編碼蛋白的RNA和非編碼RNA。(百度百科：RNA可根據(jù)結(jié)構(gòu)和功能的不同分為信使RNA和非編碼RNA。） 我們之前高中階段學(xué)到的信使RNA(mRNA)、轉(zhuǎn)運(yùn)RNA(tRNA)和核糖體RNA(rRNA)三種RNA僅為在蛋白質(zhì)的合成過程中起著明顯作用的RNA。其中mRNA便是編碼蛋白的RNA，tRNA和rRNA便是非編碼RNA。然而還有許多非編碼RNA也有重要作用并未被確證并寫進(jìn)高中課本中，如今天提及的非編碼RNA。 非編碼RNA又可以分為結(jié)構(gòu)性的ncRNA以及調(diào)控性的ncRNA。 對于結(jié)構(gòu)性的ncRNA。就是常規(guī)參與到整個常規(guī)的翻譯過程當(dāng)中，屬于正常的過程，包括tRNA和rRNA。 目前研究的主要關(guān)注點(diǎn)還是在于調(diào)控性的ncRNA,按照核苷酸鏈的長度可以將調(diào)控性的非編碼RNA分為小、中和長非編碼RNA。 小非編碼RNA:miRNA，piRNA，siRNA，cisRNA，telsRNA被認(rèn)為是短的非編碼RNA，大小在20-50個核苷酸之間。 miRNA(microRNA)：是一個長度差不多22nt的核苷酸序列。它的主要功能是通過在轉(zhuǎn)錄過程中通過堿基互補(bǔ)配對來降低mRNA的表達(dá)。研究熱點(diǎn)！ piRNA(PIWI-inteeracting RNA)：是一種長25-33nt的ncRNA。piRNA通過與piwi亞家族Argonaute蛋白質(zhì)形成RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物而發(fā)揮作用。這些piRNA復(fù)合體轉(zhuǎn)錄后調(diào)控以及表觀遺傳調(diào)控。研究熱點(diǎn)！ 小干擾RNA(siRNA)：主要參與RNA的沉默。在基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)當(dāng)中，通過構(gòu)建某一個基因互補(bǔ)的siRNA，達(dá)到敲低基因表達(dá)的作用。不過隨著CRISPR的出現(xiàn)，好多基礎(chǔ)使用都有CRISPR來替代了siRNA的干擾了。熱度下降！ crasiRNA 和 telsRNAs：相關(guān)的研究挺少的。crasiRNA是一類著絲點(diǎn)相互作用的ncRNA。而telsRNA則是和端粒存在相互作用的RNA。研究較少！
中等長度非編碼RNA:snoRNA，tiRNA，snRNA，scRNA，PROMPTs等被歸類為中等長度的非編碼RNA，大小在50-200個核苷酸之間。 核仁RNA（small nucleolar RNA, snoRNA）:是一類小RNA分子，主要指導(dǎo)其他RNA(核糖體RNA，轉(zhuǎn)移RNA和小核RNA)的化學(xué)修飾。snoRNA主要分為兩類，與甲基化相關(guān)的C / D盒snoRNA和與偽尿苷化相關(guān)的H / ACA盒snoRNA。研究熱度一般！ 小核RNA（small nuclear RNA, snRNA）:是一類小RNA分子，它們被RNA聚合酶II或RNA聚合酶III轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的。它們的主要功能是處理細(xì)胞核中的信使前RNA（hnRNA）。研究不溫不火！ 小細(xì)胞質(zhì)RNA(small cytoplasmic RNA, scRNA)：位于細(xì)胞質(zhì)當(dāng)中的一類小RNA。研究較少！ 啟動子上游轉(zhuǎn)錄物(Promoter upstream transcripts, PROMPTs)：是一類由反向鏈沿雙向轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的長度不一的非編碼RNA。大多數(shù)的PROMPTs在產(chǎn)生之后就迅速被降解，但是有某些PROMPT的表達(dá)在應(yīng)激條件下會發(fā)生變化。研究較少！
長鏈非編碼RNA:一類具有最大調(diào)控效力且包含200個以上核苷酸的RNA被分類為長非編碼RNA。 其他RNA： circRNA：我們通常研究的基因都是線性結(jié)構(gòu)的，基因的轉(zhuǎn)錄和翻譯都是從5'-3'的方向進(jìn)行的。與線性RNA不同，環(huán)狀RNA（circRNA）形成一個共價閉合的連續(xù)環(huán)。在環(huán)狀RNA中，通常存在于RNA分子中的3'和5'末端已連接在一起的情況。對于circRNA而言，有一部分是存在編碼蛋白的功能的，但是有一些也是非編碼的，其形式基因調(diào)節(jié)功能。研究熱點(diǎn)！ tRNA衍生片段(tRNA-derived fragments, tRFs)：是由tRNA降解形成的成一些非編碼的小片段。這類片段也會發(fā)揮出和其他ncRNA一樣的調(diào)節(jié)功能。逐年遞增，但未像lncRNA井噴增長！
lncRNA和miRNA是研究熱點(diǎn)，發(fā)表文章較多！其他的相對來說還是少一些。相對來說比較新一些的類似circRNA, tRFs以及piRNA文章發(fā)表相對來說還算少，且也是近十年剛剛開始研究的。 1.ncRNA分類及文章發(fā)表統(tǒng)計(jì)-- 醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫百科 2.Dahariya S, Paddibhatla I, Kumar S, Raghuwanshi S, Pallepati A, Gutti RK. Long non-coding RNA: Classification, biogenesis and functions in blood cells. Mol Immunol. 2019 Aug;112:82-92. doi: 10.1016/j.molimm.2019.04.011. Epub 2019 May 9. PMID: 31079005.
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