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近期,發(fā)表在Nature Communications 上的一項(xiàng)新研究結(jié)果揭示,多種基因突變將會(huì)影響結(jié)直腸癌患者的生存與預(yù)后。 莫非特癌癥研究中心、吉布斯癌癥中心等機(jī)構(gòu)的研究人員對(duì)500份結(jié)直腸癌樣本進(jìn)行靶向panel測(cè)序,重點(diǎn)關(guān)注1300多個(gè)已知或者疑似具有致癌性的基因,進(jìn)一步結(jié)合病人的生存信息后,鑒定出17個(gè)潛在致癌基因,這些基因突變的頻率與癌癥基因組圖譜(TCCA)報(bào)道的結(jié)直腸癌(CRC)腫瘤突變頻率接近。 其中,APC基因突變對(duì)結(jié)直腸癌的預(yù)后作用尤其明顯。研究人員根據(jù)突變模式,提出了應(yīng)用于CRC的APC分類(lèi)系統(tǒng),其中包含了5種突變類(lèi)型。 作者在文章寫(xiě)道:“我們已經(jīng)開(kāi)發(fā)出一套應(yīng)用于CRC預(yù)后的五類(lèi)多基因突變分類(lèi)系統(tǒng),其中APC基因起到了關(guān)鍵作用。我們認(rèn)為除了已知的用于癌癥分類(lèi)預(yù)測(cè)的BRAF、KRAS和TP53基因外,APC基因突變?cè)u(píng)估在常規(guī)的臨床癌癥預(yù)測(cè)中也非常有用。而且最終將幫助我們通過(guò)識(shí)別高風(fēng)險(xiǎn)與低風(fēng)險(xiǎn)群體,提升選取合適治療方案的效率?!?/p> 該研究通過(guò)深圳華大的SureSelect靶向捕獲和Illumina GAIIx測(cè)序,從468個(gè)CRC樣本的1321個(gè)基因中搜尋相關(guān)的預(yù)后突變信息。同時(shí)按照Bethesda panel指南對(duì)樣本進(jìn)行微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(MSI)分析。 該研究發(fā)現(xiàn)對(duì)高不穩(wěn)定性(MSI-high)的腫瘤組織而言預(yù)后一般會(huì)較好,13%的樣本符合分析結(jié)果。這一發(fā)現(xiàn)與已有研究結(jié)果一致。但如果高不穩(wěn)定性的腫瘤中同時(shí)含有BRAF突變,會(huì)導(dǎo)致存活率降低。 在微衛(wèi)星穩(wěn)定的腫瘤組織(MSS)中,研究人員發(fā)現(xiàn)了3個(gè)基因與癌癥轉(zhuǎn)移顯著相關(guān):APC、TP53和KRAS。同時(shí)含有這三種基因突變的腫瘤一般都屬于惡性腫瘤。該研究中,超過(guò)1/5的CRC樣本都發(fā)生了轉(zhuǎn)移。如果病人同時(shí)含有2個(gè)APC突變,KRAS基因突變和TP53基因突變,那么一般很難獲得較好的治療。另外,研究人員還表示,對(duì)僅含有一個(gè)APC突變的腫瘤病人而言,無(wú)論是APC突變單獨(dú)存在還是和KRAS或者TP53基因突變同時(shí)存在,會(huì)比不含有APC基因突變的病人存活時(shí)間更長(zhǎng)。 作者表示:“我們認(rèn)識(shí)到APC基因的預(yù)后功能,將幫助我們進(jìn)行更加詳細(xì)的突變分析以及更大樣本規(guī)模的研究。” 參考文獻(xiàn):A multigene mutation classification of 468 colorectal cancers reveals a prognostic role for APC. Nature Communications 7, Article number:11743 doi:10.1038/ncomms11743. |
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