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iPS重編程中如何優(yōu)化嘌呤霉素篩選步驟?

 生物_醫(yī)藥_科研 2019-01-23

ReproRNA?-OKSGM為單鏈RNA復制子、非整合型的重編程載體。該載體包含一個嘌呤霉素抗性基因片段,用于篩選出含此載體的細胞。因此,沒有含此載體的細胞會被嘌呤霉素去除。在轉(zhuǎn)染后的第1到6天進行篩選,可去除培養(yǎng)中未被轉(zhuǎn)染的成纖維細胞。STEMCELL Technologies推薦的篩選過程中嘌呤霉素的使用濃度為0.8 μg/mL。該濃度既保證嘌呤霉素的毒性足夠去除未被轉(zhuǎn)染的成纖維細胞以降低背景,又不會過量而對轉(zhuǎn)染過的細胞具有毒性,導致重編程效率降低。對于一些特定的細胞系,如果在篩選步驟后發(fā)現(xiàn)剩余細胞或者被去除的細胞過少,說明0.8 μg/mL嘌呤霉素并不是一個合適的濃度。在此情況下,可按照以下步驟做一個細胞毒性檢測來決定適當?shù)臐舛取?/span>


操作流程

1. 成纖維細胞以5 x 10^4 cells/mL的濃度接種于96孔板,并使用成纖維細胞培養(yǎng)基在 37°C,5%CO2條件下孵育過夜,使細胞貼壁。 

成纖維細胞培養(yǎng)基: 

高糖DMEM; 

10% (v/v) FBS(胎牛血清); 
1% (v/v)非必需氨基酸; 
2 mM L-谷氨酰胺。

2. 第二天,制備含不同濃度嘌呤霉素的成纖維細胞培養(yǎng)基。請參見下面表格中的示例,您可根據(jù)需要來選取不同嘌呤霉素濃度或樣本重復數(shù)。例如,選取嘌呤霉素濃度為1.2,1.0,0.8,0.6,0.4,0.2,0.1和0 μg/mL。

3. 在顯微鏡下觀察96孔板,確認成纖維細胞已貼壁。通常情況下,細胞密度大約為80%。

4. 將原培養(yǎng)基換成含不同濃度嘌呤霉素的培養(yǎng)基,在37°C,5%CO2下培養(yǎng)過夜。

5. 在之后的5天內(nèi)每天重復步驟2-4。請注意:需當天制備新鮮的含嘌呤霉素的培養(yǎng)基,我們不建議一次制備所需的全部培養(yǎng)基。

6. 在第5天,使用細胞活性檢測(如MTT或LDH)得到能夠去除80-100%的細胞的最小嘌呤霉素濃度。使用此濃度進行后續(xù)的ReproRNA?-OKSGM實驗的篩選步驟。

示例:在96孔板中每個樣本進行三次重復實驗


答疑時間

Q:ReproRNA?工作流程是否是feeder-free和serum-free?

A:整個工作流程是feeder-free的,但在成纖維細胞培養(yǎng)期間我們建議使用10%的FBS。

Q:如果不小心將轉(zhuǎn)染試劑和添加物放入了冰箱怎么辦?

A:雖然轉(zhuǎn)染試劑和添加物不應被冷藏保存,但可能依舊可以使用。您需要將試劑在室溫解凍并觀察是否有沉淀物出現(xiàn),若有沉淀物出現(xiàn)應在室溫繼續(xù)解凍10-15分鐘(期間可進行vortex確保沉淀物重新溶解)。一旦沉淀物溶解后,試劑和添加物即可使用。

Q:載體在細胞中會保留多久?

A:在B18R的作用下,載體會存在于細胞中。B18R可下調(diào)細胞對外源性RNA的先天反應。RNA中的非結(jié)構(gòu)蛋白編碼使得RNA可在陽性轉(zhuǎn)染的細胞內(nèi)復制。在嘌呤霉素的選擇壓力下,未能成功轉(zhuǎn)染ReproRNA?的細胞無法存活。我們并未檢測過誘導結(jié)束后ReproRNA?的殘留情況。Yoshioka的文章檢測了在去除嘌呤霉素和B18R蛋白后細胞內(nèi)RNA的表達情況。他們觀察到RNA在第8代(大部分在第5代)已全部被清除干凈。另外,他們并未檢測在細胞系中觀測到任何的整合情況,提示使用本系統(tǒng)進行wild-type iPSC建立的安全性。而仙臺病毒被證實在11代以后依舊存在于細胞中。

Q:重編程結(jié)束后,如何進行下游的分化?

A:使用ReproRNA?進行重編程的iPS細胞可成功的進行定型內(nèi)胚層、外胚層和中胚層祖細胞的分化,具體的操作流程和推薦可點擊這里申請我們的產(chǎn)品手冊!


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