成熟的miRNA是一類內(nèi)源性非編碼單鏈RNA，其長度約為19-25nt，具有很高的保守性。其通過裝載進(jìn)入AGO2蛋白形成RISC復(fù)合物，對靶基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄后調(diào)控作用，在生物進(jìn)程中起到非常重要的作用。

1、miRNA相關(guān)數(shù)據(jù)庫

miRBase是miRNA主要的公共數(shù)據(jù)庫，提供miRNAs序列以及注釋查詢、定位、發(fā)卡序列查詢，以及提供命名服務(wù)。

截止到現(xiàn)在，miRBase 21 共收錄了28645條miRNA信息。其中人類的共收錄了1881條pre-miRNA(前體)，以及2588條成熟的miRNAs。

2、miRNA的命名規(guī)則

一般情況，我們從文獻(xiàn)上看到一條miRNA，它名稱一般是這樣的：miR-21、let-7等等。但很多的時候，我們看到的miRNAs是這樣的：

rno-miR-9*

1. 首先，miRNA命名先確定物種名稱，如人種的為hsa，然后加上miRNA的簡寫miR/mir，最后加上其被發(fā)現(xiàn)的順序，如上述的hsa-miR-217。

2. 在確定命名規(guī)則之前發(fā)現(xiàn)的miRNA，則保留原來的名字，如hsa-let-7。

3. 有一類同源的miRNAs，它們可能只有1-2個堿基的差別，同源性非常高，那么在第一個發(fā)現(xiàn)并命名的miRNA后加上a、b、c……

   

4. 有的miRNA可以由不同染色體的DNA序列轉(zhuǎn)錄而成，為了表示來源不同，則在名字后面加上1、2、3……

   
   

5. 在miRNA成熟過程中，一直到裝配進(jìn)AGO2蛋白，miRNA都是雙鏈的，這就有可能從3'或5'端臂產(chǎn)生最終成熟的miRNA。在以前，產(chǎn)生表達(dá)水平高的miRNA后面不加任何符號，而表達(dá)量低的則加上“*”，以示區(qū)分。如：

   

   現(xiàn)在基本都使用“-5p”“-3p”來區(qū)分miRNA是由哪條臂形成的。
   

6. 還有一種情況是這樣的：miR-17-92。這表示的是基因簇，在miRNA成熟過程中能產(chǎn)生多條的miRNAs。例如這個miR-17-92簇，它能產(chǎn)生miR-17、miR-18、miR-19a、miR-20、miR-19b、miR-92這6個成熟的miRNA。
   

3、不同物種之間的miRNA前體和成熟體命名的差別

a. 動物：

miRNA前體：以動物物種縮寫-mir-命名順序，如hsa-mir-227；

miRNA成熟鏈：以動物物種縮寫-miR-命名順序，如hsa-miR-227-5p。

b. 植物：

miRNA前體：以植物物種縮寫-MIR 命名順序，如ath-MIR156a。注意：MIR是大寫，并與命名順序之間沒有“-”；

miRNA成熟鏈：以植物物種縮寫-miR 命名順序，如ath-miR156a-5p。注意：miR是小寫，并與命名順序之間沒有“-”。

c. 病毒：與動物一致。

miRNA前體：以病毒物種縮寫-mir 命名順序，如bhv1-mir-B6；

miRNA成熟鏈：以病毒物種縮寫-miR 命名順序，如bhv1-miR-B6-5p。