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Cell:一個(gè)基因變異竟然和五種血管疾病都相關(guān)

 成靖 2017-07-31
2 小時(shí)前 來(lái)源:生物探索
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7月27日的Cell雜志上研究人員揭示了染色體6p24上的一個(gè)常見(jiàn)遺傳變異會(huì)提高內(nèi)皮素-1(EDN1)的基因活性,并和五種血管疾?。汗跔顒?dòng)脈疾病、偏頭痛、頸動(dòng)脈夾層、肌纖維發(fā)育不良和高血壓相關(guān)。


全基因組關(guān)聯(lián)研究已經(jīng)將在染色體6p24上常見(jiàn)的遺傳變異和五種血管疾病:冠狀動(dòng)脈疾病、偏頭痛、頸動(dòng)脈夾層、肌纖維發(fā)育不良和高血壓相聯(lián)系起來(lái)。然而,目前尚不清楚這種多態(tài)性如何影響這么多疾病的風(fēng)險(xiǎn)。在7月27日的Cell雜志上,研究人員揭示了這種DNA變異如何提高被稱為內(nèi)皮素-1(EDN1)的基因活性,EDN1會(huì)促進(jìn)血管收縮和動(dòng)脈硬化。

通訊作者之一,Broad研究所的心臟病專家Sekar Kathiresan說(shuō):“我們研究的主要價(jià)值是指出了內(nèi)皮素-1對(duì)于血管收縮的多種血管疾病的重要性。我們還展示了如何在細(xì)胞里通過(guò)基因組編輯來(lái)識(shí)別多種疾病的核心基因?!?/p>

20萬(wàn)人數(shù)據(jù)找到這個(gè)心血管疾病重要SNP

Kathiresan和第一作者Rajat Gupta在近20萬(wàn)個(gè)人中使用來(lái)自(CARDIOGRAM)冠狀動(dòng)脈疾病(C4D)遺傳學(xué)聯(lián)盟和1000基因組項(xiàng)目的數(shù)據(jù),研究遺傳變異與冠狀動(dòng)脈疾病和心肌梗死相關(guān)增加的風(fēng)險(xiǎn)。具體來(lái)說(shuō),他們關(guān)注的是單核苷酸多態(tài)性(SNP)。

分析顯示一個(gè)在染色體6p24上,EDN1基因很遠(yuǎn)距離之處,叫做rs9349379的 SNP是心血管疾病的最強(qiáng)危險(xiǎn)因素。從英國(guó)Biobank中112338個(gè)歐洲血統(tǒng)的人的額外分析顯示,rs9349379為G的等位基因的一種具體形式,在這些人中占36%,與冠狀動(dòng)脈疾病的風(fēng)險(xiǎn)增加有關(guān)。


CRISPR基因編輯證明該變異調(diào)節(jié)遠(yuǎn)距離EDN1基因

研究人員在人的多能干細(xì)胞中,利用CRISPR/Cas9基因編輯刪除DNA的rs9349379小區(qū)域,然后將這些未成熟的細(xì)胞轉(zhuǎn)換成血管細(xì)胞,研究rs9349379對(duì)遠(yuǎn)距離的EDN1基因的活性影響如何。重要的是,從99名健康人的血樣分析表明,在rs9349379為G的等位基因和較高水平的大內(nèi)皮素-1(ET-1,EDN1基因前體蛋白產(chǎn)品)相關(guān)。

過(guò)去的研究表明,ET-1在人類是最有效的,最持久的血管收縮物質(zhì),它促進(jìn)動(dòng)脈內(nèi)斑塊的發(fā)展。因?yàn)閞s9349379增加ET-1的產(chǎn)生,這種基因變異可以解釋冠狀動(dòng)脈疾病患者偏頭痛、頸動(dòng)脈夾層、肌纖維發(fā)育不良、高血壓的共同發(fā)生。然而,需要進(jìn)一步的研究來(lái)探索這種可能性。此外,未來(lái)的工作需要了解到底rs9349379是如何調(diào)節(jié)EDN1基因活性的,因?yàn)橛写蟮奈锢砭嚯x將它們分開。

篩選到這個(gè)基因變異的臨床意義和正確觀點(diǎn)

從臨床的角度來(lái)看,研究結(jié)果表明,篩選rs9349379可以提高血管疾病風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估,以及預(yù)防和治療策略。此外,研究結(jié)果提示了靶向ET-1可能在如冠狀動(dòng)脈疾病、偏頭痛、頸動(dòng)脈夾層、肌纖維發(fā)育不良、高血壓疾病的治療中是有用的。

然而,必須指出的是,心臟病發(fā)作的風(fēng)險(xiǎn)取決于遺傳因素和生活方式的選擇。Kathiresan說(shuō):“我們提出了一個(gè)遺傳風(fēng)險(xiǎn)因子,但不是一個(gè)可以預(yù)測(cè)誰(shuí)會(huì)得心臟病,誰(shuí)不會(huì)得的多態(tài)性?!边@項(xiàng)工作的最大價(jià)值是指出了內(nèi)皮素-1是多種血管疾病的核心基因。

參考資料

A Genetic Variant Associated with Five Vascular Diseases Is a Distal Regulator of Endothelin-1 Gene Expression

Five vascular diseases linked to one common genetic variant

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參考文獻(xiàn)
我要補(bǔ)充文獻(xiàn)
A Genetic Variant Associated with Five Vascular Diseases Is a Distal Regulator of Endothelin-1 Gene Expression

A Genetic Variant Associated with Five Vascular Diseases Is a Distal Regulator of Endothelin-1 Gene Expression

文獻(xiàn)期刊:Cell

Genome-wide association studies (GWASs) implicate the PHACTR1 locus (6p24) in risk for five vascular diseases, including coronary artery disease, migraine headache, cervical artery dissection, fibromuscular dysplasia, and hypertension. Through genetic fine mapping, we prioritized rs9349379, a common SNP in the third intron of the PHACTR1 gene, as the putative causal variant. Epigenomic data from human tissue revealed an enhancer signature at rs9349379 exclusively in aorta, suggesting a regulatory function for this SNP in the vasculature. CRISPR-edited stem cell-derived endothelial cells demonstrate rs9349379 regulates expression of endothelin 1 (EDN1), a gene located 600 kb upstream of PHACTR1. The known physiologic effects of EDN1 on the vasculature may explain the pattern of risk for the five associated diseases. Overall, these data illustrate the integration of genetic, phenotypic, and epigenetic analysis to identify the biologic mechanism by which a common, non-coding variant can distally regulate a gene and contribute to the pathogenesis of multiple vascular diseases.

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