提示：請(qǐng)點(diǎn)擊標(biāo)題下方藍(lán)色“實(shí)驗(yàn)萬(wàn)事屋”，添加關(guān)注后，發(fā)“嗯”可以查看我們之前的文章。

小林子成天除了若有所思地做實(shí)驗(yàn)，就是若有所思地想問(wèn)題，經(jīng)常會(huì)問(wèn)出這樣那樣奇怪的問(wèn)題來(lái)。對(duì)于這些，他的莫愁師姐總是一一解答。小林子最近關(guān)心的是所謂大數(shù)據(jù)的問(wèn)題，雖然大數(shù)據(jù)這個(gè)詞是如驢灌耳的，也看有些文獻(xiàn)，就是對(duì)大數(shù)據(jù)隨便分析分析，就稍微做兩個(gè)驗(yàn)證試驗(yàn)就發(fā)了文字。但他卻從來(lái)沒(méi)弄明白過(guò)究竟是怎么回事。這種事情只能去問(wèn)師姐啊，拔茲道是不是大家都會(huì)羨慕他有辣么好的師姐呢？

莫愁：其實(shí)也覺(jué)得挺難三言兩語(yǔ)說(shuō)清楚這件事情的，就舉了兩個(gè)栗子。

第一個(gè)栗子很簡(jiǎn)單，要知道大數(shù)據(jù)，那就先知道知道什么是小數(shù)據(jù)咯。比如十七八個(gè)盲人在那里摸象，每個(gè)人都會(huì)獲得自己心目中的數(shù)據(jù)，但僅僅是局部的“小數(shù)據(jù)”，代表不了整體。當(dāng)數(shù)據(jù)達(dá)到一定的體量之后，才會(huì)把整個(gè)事件看得清楚和透徹，這就是大數(shù)據(jù)和小數(shù)據(jù)。在生物學(xué)上，各種組學(xué)及表型的數(shù)據(jù)整合在一起，就形成了“大數(shù)據(jù)”。這樣的大數(shù)據(jù)，就能在整體上把握像腫瘤這樣的“大象”，而不再是片面的。

第二個(gè)例子有點(diǎn)復(fù)雜，要知道那么大體量的數(shù)據(jù)能干嘛呢？最簡(jiǎn)單的例子就是算命，當(dāng)然不要以為算命不科學(xué)，其實(shí)算命就是延續(xù)了5000多年的一個(gè)問(wèn)卷調(diào)查，擁有大體量的數(shù)據(jù)，以及對(duì)相應(yīng)目標(biāo)未來(lái)的一種預(yù)測(cè)，這就是大數(shù)據(jù)能做到的事情了。比如：五年前，谷歌的一個(gè)研究小組在《nature》上宣布了該小組可以追蹤美國(guó)境內(nèi)流感的傳播趨勢(shì)，而這一結(jié)果不依賴于任何醫(yī)療檢查.他們的追蹤速度甚至比疾控中心（CDC）要快的多。也就是說(shuō)，通過(guò)對(duì)大數(shù)據(jù)的系統(tǒng)分析，就有可能找出或預(yù)測(cè)出一些新的機(jī)制或分子間的相互聯(lián)系。

但小林子還覺(jué)得不是很清楚：那師姐，我們做科研要大數(shù)據(jù)干嘛呢？

莫愁：小林啊，要記住，任何數(shù)據(jù)對(duì)于我們來(lái)說(shuō)都是珍貴的。大數(shù)據(jù)對(duì)于科研來(lái)說(shuō)是必不可少的哦！

倒是可以給你，再舉幾個(gè)例子，給你幾種運(yùn)用大數(shù)據(jù)的科研思路，給你的科研思路添點(diǎn)干貨。

一、最常見(jiàn)的思路：運(yùn)用芯片技術(shù)，對(duì)少數(shù)幾個(gè)腫瘤組織進(jìn)行研究（20例），找出差異基因，再將這些篩查出來(lái)的差異基因，回歸到大數(shù)據(jù)的芯片數(shù)據(jù)庫(kù)中（200例以上）去進(jìn)行獨(dú)立驗(yàn)證；

二、容易被忽視的思路：細(xì)胞系中進(jìn)行表型或敲減的篩選，選出可能的較為重要的基因，通過(guò)已發(fā)表的芯片數(shù)據(jù)與臨床表型數(shù)據(jù)，找出該基因與臨床表型之間的關(guān)系，反映出它臨床上的重要性；

三、Topic指導(dǎo)的Story：一般來(lái)說(shuō)這種也是比較常見(jiàn)的運(yùn)用大數(shù)據(jù)的科研思路了。比如我有一個(gè)Topic，我要make astory。這個(gè)story要有一定的結(jié)構(gòu)：腫瘤，基因，機(jī)制。比如“我做的腫瘤是腸癌”，“最近一直在關(guān)注miRNA，不知道能不能扯上點(diǎn)關(guān)系”，“最好和自噬有辣么點(diǎn)關(guān)系”。好了，所有要素都全了。那下一步怎么做呢？首先，通過(guò)擁有大數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)庫(kù)（例如TCGA），找出mRNA、miRNA及臨床相關(guān)數(shù)據(jù)，篩選出已經(jīng)發(fā)表過(guò)的與自噬相關(guān)的基因。預(yù)測(cè)通過(guò)自噬來(lái)影響腫瘤發(fā)生發(fā)展的miRNA及其靶基因。緊接著，細(xì)胞實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證其與自噬的相關(guān)性。緊接著，動(dòng)物實(shí)驗(yàn)……