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科研老司機的套路哲學(一)

 解螺旋 2020-08-27


作者:解螺旋·子非魚

如需轉(zhuǎn)載請注明來源:解螺旋·醫(yī)生科研助手

導語

科研老司機說:一切皆有套路(規(guī)律),科研也不例外。miRNA作為當家花旦,在科研這個大舞臺上搖曳生姿已久;而腫瘤治療身為老牌明星,自然也保持長盛不衰之勢,那么當miRNA碰見腫瘤治療,是怎么碰撞出美麗火花,形成深得人心的CP呢?

然而,老牌明星出道已久,CP組合自然花樣繁多,Car-T療法、DNA甲基化修飾等等,無一不是科研汪們熱捧的對象,那么miRNA小鮮肉要想一直得到腫瘤治療明星大腕的青睞,沒有幾個傍身秘籍又怎么能行呢?好在自古深情留不住,總是套路得人心,那么小魚通過兩篇相關(guān)文章來深入分析下科研中用miRNA進行腫瘤研究的兩個經(jīng)典套路。
經(jīng)典套路一


基于前期研究,已有報道揭示了MSC可作為催化劑促進癌癥進展、侵襲和轉(zhuǎn)移,然而其具體的分子機制并未闡明,因而,這篇文章通過一套完整的研究流程,闡明了腫瘤間充質(zhì)干細胞(MSC)誘發(fā)的miRNA調(diào)節(jié)網(wǎng)絡,并證實了轉(zhuǎn)錄因子FOXP2在乳腺癌轉(zhuǎn)移中的關(guān)鍵角色。
 
其文章研究思路如下:
 

1.miRNA篩選,獲取研究對象


此外,還需要排除細胞模型的特異性,即先用不同品系的乳腺癌細胞(BCC)與不同來源MSC共培養(yǎng)3天,檢測所篩選的miRNA的表達率變化。
 

2.對篩選出的miRNA進行功能驗證

研究者發(fā)現(xiàn)所得的miR-199a-3p可促使腫瘤干細胞的標記物乙醛脫氫酶(ALDHA1)的表達水平顯著提高,并增強腫瘤的始發(fā)能力。
 
3.尋找并驗證miRNA的靶基因

 

因不同體內(nèi)細胞環(huán)境對miRNA的影響不同,可再次進行基因芯片篩選miRNA的靶基因,并關(guān)注那些與獲得或維持腫瘤細胞干性有關(guān)的因素。

4.從靶基因的角度闡明miRNA的調(diào)控分子機制

經(jīng)典套路二
當然,如果你已確定某一種miRNA與腫瘤的增殖、轉(zhuǎn)移及治療密切相關(guān),而你又想知道其與某種腫瘤發(fā)生發(fā)展過程中的調(diào)控關(guān)系,可參考下面這篇文章的研究思路。

 

前期已有報道說明miR-490-3p與腫瘤的增殖、轉(zhuǎn)移及治療密切相關(guān),但僅局限于現(xiàn)象性研究,具體涉及的信號通路仍未闡明。同時,尚未有文獻報道m(xù)iR-490-3p對結(jié)直腸癌發(fā)病和轉(zhuǎn)移的作用及相關(guān)機制。
 
因而本文研究者通過體內(nèi)外實驗,明確了miR-490-3p與結(jié)直腸癌轉(zhuǎn)移的關(guān)系及相關(guān)機制。其研究思路如下:
 
1.驗證miR-490-3p與結(jié)直腸癌發(fā)病、轉(zhuǎn)移及預后的關(guān)系

通過實驗證明miR-490-3p在結(jié)直腸癌中的表達呈下調(diào)趨勢,且與腫瘤的轉(zhuǎn)移相關(guān)。且其高表達與病人的良好預后成正相關(guān)性。
 

2.驗證miR-490-3p對結(jié)直腸癌腫瘤細胞增殖和轉(zhuǎn)移的影響


結(jié)果證明,過表達miR-490-3p可抑制腫瘤細胞的成瘤能力及轉(zhuǎn)移能力。
 
3.驗證miR-490-3p及其靶點FRAT1的相互作用機制

通過實驗證明已明確miR-490-3p的靶基因為FRAT1,進一步通過體外拯救實驗,證實FRAT1能夠恢復miR-490-3p對結(jié)直腸癌腫瘤細胞轉(zhuǎn)移的抑制作用。此外, miR-490-3p靶向調(diào)控FRAT1的表達,促進β-catenin的的降解,抑制其核內(nèi)定位,從而介導Wnt/β-catenin信號通路的活性,影響結(jié)直腸癌的轉(zhuǎn)移。

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