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Western blot 實(shí)驗(yàn)心得 step by step

 漸近故鄉(xiāng)時 2015-05-08

根據(jù)自己的實(shí)驗(yàn)體會,總結(jié)做好 WB 的一些心得,希望對你實(shí)驗(yàn)有幫助。圍繞著實(shí)驗(yàn)的每個步驟展開敘述,這樣可能更具體更好理解。



配膠



該部分較為重要的是配制凝膠時要充分混勻,此外應(yīng)保證試劑的新鮮。常出現(xiàn)的問題有:A. 凝膠出現(xiàn)花紋:此時應(yīng)檢查原料中過硫酸銨(AP)粉末是否受潮。B. 凝膠聚合時間較長:聚合時間由 AP 以及 TEMED 決定,通常在 30 min 左右,AP 不新鮮會導(dǎo)致聚合變慢。此外還需注意環(huán)境的溫度也很重要,氣溫較低時膠是會凝得慢一些,必要時可適當(dāng)增加 AP 以及 TEMED 的量,但通常不會超過 1 h,若超過 1 h 甚至更長仍未聚合,應(yīng)檢查配制的操作有無錯誤。



處理蛋白樣品


該部分蛋白樣品本身很關(guān)鍵,若蛋白提取過程存在問題或蛋白發(fā)生降解則很難進(jìn)行好之后的實(shí)驗(yàn),也就很難做出好的結(jié)果了。除此之外 loading buffer 的作用也不容忽視,切莫使用不新鮮的上樣緩沖液,同時在處理時將樣品與 loading buffer 混合均勻也應(yīng)注意。



電泳



首先在跑積層膠時應(yīng)盡可能使樣品壓齊,若上樣量較大(如細(xì)胞蛋白通常上樣在 20-30 甚至 40 ul),可適當(dāng)減小電壓跑 20-30 min,待壓齊后方可開始分離。



轉(zhuǎn)膜



該環(huán)節(jié)電流的大小,轉(zhuǎn)膜的時間決定是否能成功將蛋白轉(zhuǎn)上,而具體的參數(shù)應(yīng)取決于所要蛋白的分子量大小,應(yīng)反復(fù)摸索,本人在實(shí)驗(yàn)中得出的經(jīng)驗(yàn)為:10 KDa:200 mA 1 h,60 KDa 70 V,2 h,90 KDa 70 V,4 h,200 KDa 70 V,6 h。


此外還有如下幾個細(xì)節(jié)問題需要注意:


膜的選擇:PVDF 還是 NC,0.22 μm 還是 0.45 μm。


轉(zhuǎn)膜液中甲醇的量:通常在 10%-20%,蛋白分子量較大時可適當(dāng)減少,蛋白分子量小時應(yīng)適當(dāng)增加,建議先從 15% 開始。



封閉



該步驟一般不易出現(xiàn)問題,常見的有室溫 2-3 h,或者 4 度封閉過夜,但仍需強(qiáng)調(diào)一點(diǎn)的是有些抗體的使用需配套使用特殊的封閉液。



一抗孵育



通常購買到一種新抗體后,還是建議先按說明書推薦的濃度比例在室溫孵育 2-3 h。若該抗體效價較好,應(yīng)該顯帶很漂亮,尤其是在抗體剛買時間不長,然而事情往往不能盡如人意。我們在遇到一個不好的抗體時該怎么辦?可通過延長孵育時間(如:4 度過夜孵育甚至室溫過夜孵育),增大抗體濃度。如果你想盡了一切可能結(jié)果仍然很不理想,建議還是換抗體吧,不要再浪費(fèi)時間與精力了。



洗膜



個人認(rèn)為洗膜液洗 3 遍,每遍 10 min 足以。沒有必要過多次數(shù)過長時間,膜的背景不好很多時候并不是沒洗干凈,更多的應(yīng)該去考慮抗體濃度是否過高等其他原因。本人實(shí)驗(yàn)過程中曾經(jīng)做過兩個抗體,其他的條件一樣(甚至是從一張膜上剪開的),背景卻相差很大,你能說是沒洗干凈嗎?洗二抗同樣如此。



二抗孵育



選擇好一個合適的條件不要輕易改變,另外相比一抗,二抗作用的時間應(yīng)嚴(yán)格控制,實(shí)踐證明一抗時間長點(diǎn)可能沒什么關(guān)系,而二抗時間若過長過短都將會直接影響結(jié)果。


本文作者系丁香園中級站友:hangpengzhou


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