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meta分析之前有給大家寫過,但是meta分析只能比較兩個方法。經(jīng)常是被用來證明在現(xiàn)有研究中顯示矛盾結(jié)果的干預(yù)方法到底有沒有效的時候使用,通過證據(jù)綜合得到某種干預(yù)到底有沒有用的結(jié)論。但是如果我要證明好幾種方法到底哪個最優(yōu),這個時候meta分析就不行了,我們得使用網(wǎng)狀meta。
網(wǎng)狀meta的原理和meta沒有區(qū)別,精髓在于其利用了間接證據(jù),可以進(jìn)行多個干預(yù)的同時分析。一個研究直接對A、B兩種干預(yù)進(jìn)行比較,這個叫做直接證據(jù);所謂的間接證據(jù)的意思是,我們有研究比較了A和C、有研究比較了B和C,此時可以構(gòu)建一個證據(jù)鏈(forming an A-B-C “l(fā)oop” of evidence)進(jìn)行AB之間的比較,這個就叫做間接證據(jù)。 在臨床實(shí)踐中,若有一系列的藥物可以治療某種疾病,但文獻(xiàn)報道的RCT均是藥物與安慰劑的對照,而藥物互相之間的RCT都沒有進(jìn)行或很少,那么在這種情況下,想要進(jìn)行藥物間效應(yīng)的比較就需要將間接比較和直接比較的證據(jù)進(jìn)行合并,就可以用網(wǎng)狀Meta分析。下面一張圖就可以較為清楚地說明網(wǎng)狀meta到底在干什么:
因?yàn)橛辛斯餐谋容^對象A,所以能夠間接得到BC的比較結(jié)果。能這么比是有一個顯而易見的假設(shè)需要滿足的:所提到的RCT的研究人群得來源于同一個總體,從而我們可以將BA和CA的關(guān)系推出BC,這個也叫transitivity。是網(wǎng)狀meta可以站得住腳的基礎(chǔ)。
這個假設(shè)保證了間接效應(yīng)是可以成立的,但是研究的協(xié)變量不一致的情況下這個假設(shè)很容易不滿足,所以我們做文獻(xiàn)篩選的時候就要將人群盡可能相似的研究納入,當(dāng)然時候我們還可以比較直接效應(yīng)和間接證據(jù)的一致性來反映這個假設(shè)是否成立。這個時候在統(tǒng)計(jì)上又叫做比較consistency或者Incoherence。可以看的統(tǒng)計(jì)指標(biāo)包括I方,包括異質(zhì)性檢驗(yàn)的p值,包括圖形熱點(diǎn)等。
了解了這些之后我們給出網(wǎng)狀meta的定義:
網(wǎng)狀meta最大優(yōu)勢就是可以對治療同類疾病的不同干預(yù)措施進(jìn)行量化比較,并按照某一結(jié)果指標(biāo)效果進(jìn)行排序。
而且最終呈現(xiàn)的圖片結(jié)果較一般 Meta 分析高端,目前應(yīng)用越來越多。下表對傳統(tǒng)meta分析的步驟進(jìn)行了總結(jié)并且提出了網(wǎng)狀meta在相應(yīng)步驟上的注意事項(xiàng)。
總體來說網(wǎng)狀meta要做好其實(shí)是非常不容易的,從立題到分析到文獻(xiàn)篩選到數(shù)據(jù)提取到各種偏倚評估再到具體分析操作到最后結(jié)果報告都有很多要注意的地方,本文主要聚焦分析實(shí)操和結(jié)果報告,希望對大家有幫助。 網(wǎng)狀meta的結(jié)果呈現(xiàn)在網(wǎng)狀meta的文章中都會出一張如下圖所示的網(wǎng)叫做Network diagrams:
上面的圖展示的各個干預(yù)措施的比較情況,哪些是直接比較哪些是間接比較。圖中可以看出來Timolol是被比較最多的干預(yù)措施。上面這個線的粗細(xì)表示研究的數(shù)量,點(diǎn)的大小表示用藥的人數(shù)(研究中的樣本量),這些也可以根據(jù)需要映射別的指標(biāo),比如研究的精準(zhǔn)度。
當(dāng)然我們光看圖,視覺上較為直觀但是能獲取到的信息較少,一般我們還會出一個表作為這個圖的補(bǔ)充,這個表就叫做league table或者triangle table:
這個圖展示了網(wǎng)狀meta的結(jié)果,包括了所有可能的兩兩比較的結(jié)果,比如圖中左上角的2.52就表示apraclonidine這個藥相對于安慰劑來講就能顯著有利于結(jié)局。 不同干預(yù)方法相互比較的結(jié)果出來之后,要指導(dǎo)臨床決策我們還需要報告到底哪種方法更好,這個時候我們可以給出一個排序圖叫做rankograms,用這個圖來展示各個方案成為第幾優(yōu)方案的概率的曲線,如下圖:
其余的還有和傳統(tǒng)meta分析一樣的異質(zhì)性檢驗(yàn)的結(jié)果,森林圖等??偨Y(jié)起來,一個網(wǎng)狀meta的分析部分特別的就包括網(wǎng)狀圖Network diagrams,三角表league table,累計(jì)排序曲線cumulative ranking curve (SUCRA)。 在擬合網(wǎng)狀meta的時候我們依然可以選擇固定效應(yīng)模型或者隨機(jī)效應(yīng)模型,這個主要從研究異質(zhì)性考慮,可以看的統(tǒng)計(jì)指標(biāo)包括I方,包括異質(zhì)性檢驗(yàn)的p值,包括圖形熱點(diǎn),具體我們在實(shí)操中講解:
實(shí)例操練比如我現(xiàn)在從文獻(xiàn)種收集了如下數(shù)據(jù):
上面數(shù)據(jù)中第一列是研究的標(biāo)簽,TE為方法比較的效應(yīng)值,seTE為對應(yīng)的標(biāo)準(zhǔn)誤,treat1和treat2為對比的組別。 有了上面的數(shù)據(jù)我們就可以適用netmeta函數(shù)做網(wǎng)狀meta了,代碼如下,需要注意sm為效應(yīng)量可以為RD,OR,RR,HR,SMD,MD等,要根據(jù)實(shí)際選擇: 運(yùn)行后得到對比的效應(yīng)值及其置信區(qū)間和Q值,結(jié)果如下:
還有每個治療和參考治療對比的效應(yīng)值以及I方:
上圖顯示我們的I方是很大的,用固定效應(yīng)模型就不合適,需要用隨機(jī)效應(yīng)模型(從I方和異質(zhì)性檢驗(yàn)的結(jié)果都可以說明)。 我們也可用Net Heat Plot來查看到底異質(zhì)性來源是哪一個:
上面圖中灰色色塊越大表示該效應(yīng)越重要,有色色塊表示橫軸效應(yīng)的異質(zhì)性可以歸因于縱軸效應(yīng)的比例,色塊越紅比例越高,色塊越藍(lán)比例越低。 假設(shè)上面的結(jié)果做對了,我們可以接著往下出Network diagrams,簡單代碼示例如下,這個函數(shù)有很多參數(shù)可以調(diào)整的,可以把圖做的非常漂亮,大家自己嘗試:
從這個圖中可以直觀的看出比較的情況了,當(dāng)然了我們還需要數(shù)值型的結(jié)果表達(dá),我們可以做一個league table出來,代碼和對應(yīng)輸出如下:
最能體現(xiàn)網(wǎng)狀meta的優(yōu)勢的地方就是各個干預(yù)方法的比較了,通過干預(yù)方法排序,回答哪種干預(yù)最優(yōu),通過下面代碼得到每種干預(yù)的排序:
運(yùn)行結(jié)果中會輸出一個p值,表示的是該方法比其余方法好的概率,這個值越大越好,當(dāng)然光看p值也不行我們要考慮穩(wěn)定性,還得看置信區(qū)間,這個時候我們可以做一個森林圖來展示各個干預(yù)相對于參考方案的效應(yīng)分布。
從上面結(jié)果可以看出,相對于參考組,ind的效果是最好的。對于這個結(jié)果排序,我們也可以用下面代碼出排序曲線:
依然可以得到ind排在第一。 到這兒網(wǎng)狀meta分析涉及的網(wǎng)狀圖Network diagrams,三角表league table,累計(jì)排序曲線cumulative ranking curve (SUCRA)就都介紹完了。 推薦閱讀:
小結(jié)今天給大家寫了網(wǎng)狀meta分析的實(shí)操和結(jié)果解讀,傳統(tǒng)meta中已經(jīng)涉及的森林圖和漏斗圖在本文中略過了,重點(diǎn)關(guān)注了網(wǎng)狀圖Network diagrams,三角表league table,累計(jì)排序曲線cumulative ranking curve (SUCRA)。希望大家可以結(jié)合傳統(tǒng)meta進(jìn)一步理解網(wǎng)狀meta的優(yōu)勢,進(jìn)一步理解其與傳統(tǒng)統(tǒng)計(jì)推斷的區(qū)別。感謝大家耐心看完,自己的文章都寫的很細(xì),重要代碼都在原文中,希望大家都可以自己做一做,請轉(zhuǎn)發(fā)本文到朋友圈后私信回復(fù)“數(shù)據(jù)鏈接”獲取所有數(shù)據(jù)和本人收集的學(xué)習(xí)資料。如果對您有用請先記得收藏,再點(diǎn)贊分享。 也歡迎大家的意見和建議,大家想了解什么統(tǒng)計(jì)方法都可以在文章下留言,說不定我看見了就會給你寫教程哦,有疑問歡迎私信,有合作意向請直接滴滴我。 如果你是一個大學(xué)本科生或研究生,如果你正在因?yàn)槟愕慕y(tǒng)計(jì)作業(yè)、數(shù)據(jù)分析、模型構(gòu)建,科研統(tǒng)計(jì)設(shè)計(jì)等發(fā)愁,如果你在使用SPSS, R,Mplus中遇到任何問題,都可以聯(lián)系我。因?yàn)槲铱梢越o您提供最好的,最詳細(xì)和耐心的數(shù)據(jù)分析服務(wù)。 如果你對Z檢驗(yàn),t檢驗(yàn),方差分析,多元方差分析,回歸,卡方檢驗(yàn),相關(guān),多水平模型,結(jié)構(gòu)方程模型,中介調(diào)節(jié),量表信效度等等統(tǒng)計(jì)技巧有任何問題,請私信我,獲取詳細(xì)和耐心的指導(dǎo)。 如果你或你的團(tuán)隊(duì)需要專業(yè)的科研數(shù)據(jù)清洗,建模服務(wù),教學(xué)培訓(xùn)需求等等。請聯(lián)系我。 If you are a student and you are worried about you statistical #Assignments, #Data #Analysis, #Thesis, #Reports, #Composing, #Quizzes, Exams.. And if you are facing problem in #SPSS, #R-Programming, #Excel, Mplus, then contact me. Because I could provide you the best services for your Data Analysis. Are you confused with statistical Techniques like z-test, t-test, ANOVA, MANOVA, Regression, Logistic Regression, Chi-Square, Correlation, Association, SEM, multilevel model, mediation and moderation etc. for your Data Analysis...?? Then Contact Me. I will solve your Problem... If You or Your Research Team Need Professional Scientific Data Cleaning, Model Building Services or Statistical Consulting... Please Contact Me. 往期精彩R數(shù)據(jù)分析:非劣效性研究設(shè)計(jì)的統(tǒng)計(jì)處理方法,原理和實(shí)例 R數(shù)據(jù)分析:集成學(xué)習(xí)方法之隨機(jī)生存森林的原理和做法,實(shí)例解析 R數(shù)據(jù)分析:凈重新分類(NRI)和綜合判別改善(IDI)指數(shù)的理解 R數(shù)據(jù)分析:反事實(shí)框架和因果中介的理論理解 R數(shù)據(jù)分析:解決科研中的“可重復(fù)危機(jī)”,理解Rmarkdown R數(shù)據(jù)分析:多項(xiàng)式回歸與響應(yīng)面分析的理解與實(shí)操 R數(shù)據(jù)分析:生存數(shù)據(jù)的預(yù)測模型建立方法與評價(二) R數(shù)據(jù)分析:生存數(shù)據(jù)的預(yù)測模型建立方法與評價 R數(shù)據(jù)分析:生存分析的列線圖的理解與繪制詳細(xì)教程 R數(shù)據(jù)分析:結(jié)合APA格式作圖大法講講ggplot2和ggsci,請收藏 R數(shù)據(jù)分析:變量間的非線性關(guān)系,多項(xiàng)式,樣條回歸和可加模型 Mplus數(shù)據(jù)分析:性別差異gendergap的相關(guān)研究如何做? R機(jī)器學(xué)習(xí):分類算法之logistics回歸分類器的原理和實(shí)現(xiàn) R數(shù)據(jù)分析:PLS結(jié)構(gòu)方程模型介紹,論文報告方法和實(shí)際操作 R數(shù)據(jù)分析:跟隨top期刊手把手教你做一個臨床預(yù)測模型 R數(shù)據(jù)分析:如何用層次聚類分析做“癥狀群”,實(shí)例操練 R數(shù)據(jù)分析:工具變量回歸與孟德爾隨機(jī)化,實(shí)例解析 R數(shù)據(jù)分析:潛類別軌跡模型LCTM的做法,實(shí)例解析 R文本挖掘:中文詞云生成,以2021新年賀詞為例 R機(jī)器學(xué)習(xí):分類算法之判別分析LDA,QDA的原理與實(shí)現(xiàn) R機(jī)器學(xué)習(xí):重復(fù)抽樣在機(jī)器學(xué)習(xí)模型建立過程中的地位理解 R數(shù)據(jù)分析:用lme4包擬合線性和非線性混合效應(yīng)模型 R數(shù)據(jù)分析:孟德爾隨機(jī)化中介的原理和實(shí)操 R數(shù)據(jù)分析:生存分析的列線圖的理解與繪制詳細(xì)教程 R數(shù)據(jù)分析:cox模型如何做預(yù)測,高分文章復(fù)現(xiàn) R數(shù)據(jù)分析:廣義估計(jì)方程式GEE的做法和解釋 R數(shù)據(jù)分析:潛類別軌跡模型LCTM的做法,實(shí)例解析 R數(shù)據(jù)分析:潛變量與降維方法(主成分分析與因子分析) R數(shù)據(jù)分析:如何給結(jié)構(gòu)方程畫路徑圖,tidySEM包詳解 R數(shù)據(jù)分析:生存分析與有競爭事件的生存分析的做法和解釋 R機(jī)器學(xué)習(xí):樸素貝葉斯與支持向量機(jī)的原理與實(shí)現(xiàn) R數(shù)據(jù)分析:混合效應(yīng)模型的可視化解釋,再不懂就真沒辦法 R數(shù)據(jù)分析:tableone包的詳細(xì)使用介紹 R數(shù)據(jù)分析:如何用lavaan包做結(jié)構(gòu)方程模型,實(shí)例解析 R機(jī)器學(xué)習(xí):分類算法之K最鄰進(jìn)算法(KNN)的原理與實(shí)現(xiàn) R數(shù)據(jù)分析:潛增長模型LGM的做法和解釋,及其與混合模型對比 R數(shù)據(jù)分析:論文中的軌跡的做法,潛增長模型和增長混合模型 R數(shù)據(jù)分析:縱向分類結(jié)局的分析-馬爾可夫多態(tài)模型的理解與實(shí)操 R數(shù)據(jù)分析:臨床預(yù)測模型實(shí)操,校準(zhǔn)曲線和DCA曲線做法示例 R數(shù)據(jù)分析:國產(chǎn)新冠口服藥比輝瑞好的文章的統(tǒng)計(jì)做法分享 |
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