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綜述 | 國內(nèi)外農(nóng)藥相關(guān)數(shù)據(jù)庫介紹

 jianqi2023 2023-09-19

化學(xué)農(nóng)藥的大規(guī)模使用對生態(tài)環(huán)境和人類健康都造成了諸多影響。在開展環(huán)境污染物風(fēng)險(xiǎn)評估、環(huán)境污染治理、農(nóng)藥管理、生態(tài)毒理學(xué)等方向的研究時(shí),系統(tǒng)的農(nóng)藥相關(guān)數(shù)據(jù)庫平臺是不可缺少的基礎(chǔ)支持。

《環(huán)境與職業(yè)醫(yī)學(xué)》2020年第12期發(fā)表了東南大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院環(huán)境醫(yī)學(xué)工程教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室董書衡等的文章,介紹了EFSA OpenFoodTox、EPA CompTox Chemicals Dashboard、農(nóng)藥特性數(shù)據(jù)庫(PPDB)、農(nóng)藥行動(dòng)網(wǎng)絡(luò)(PAN)、美國生態(tài)毒理數(shù)據(jù)庫(ECOTOX)、毒理學(xué)數(shù)據(jù)網(wǎng)絡(luò)(TOXNET)六個(gè)國外常用農(nóng)藥相關(guān)數(shù)據(jù)庫的概況及特點(diǎn),比較了六個(gè)數(shù)據(jù)庫的可查詢數(shù)據(jù)內(nèi)容及優(yōu)缺點(diǎn),分析了其在農(nóng)藥風(fēng)險(xiǎn)管理中的應(yīng)用。同時(shí)介紹了國內(nèi)四個(gè)相關(guān)數(shù)據(jù)庫的概況及特點(diǎn),分析了國內(nèi)數(shù)據(jù)庫的不足。結(jié)合我國農(nóng)藥污染現(xiàn)狀及特點(diǎn),借鑒國外相關(guān)數(shù)據(jù)庫建設(shè)的經(jīng)驗(yàn),我國的農(nóng)藥毒性數(shù)據(jù)庫建設(shè)迫切需要在以下幾方面有所突破:建立農(nóng)藥數(shù)據(jù)整編標(biāo)準(zhǔn)和規(guī)范;建立信息完整、豐富、有效和共享的農(nóng)藥數(shù)據(jù)庫;注重收集中國本土生物毒性數(shù)據(jù)。

化學(xué)農(nóng)藥是一種常見的環(huán)境污染物,對生態(tài)環(huán)境和人類健康都產(chǎn)生了許多影響。因其使用量大,但有效利用率低,導(dǎo)致農(nóng)藥對生物體的影響十分明顯。以中國為例,2017年我國農(nóng)藥的有效利用率只有38.8%。這些農(nóng)藥通過消化道、呼吸道、皮膚等途徑進(jìn)入人體后,可能引起急性中毒甚至死亡,也可能不斷蓄積,造成慢性中毒,引起疾病的發(fā)生。2016年我國中毒死亡人數(shù)為4936人,其中農(nóng)藥中毒死亡的人數(shù)為2725人。

隨著農(nóng)藥種類的增加以及農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全工作的深入,農(nóng)藥數(shù)據(jù)日益劇增,因此實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)管理的科學(xué)化、系統(tǒng)化和規(guī)范化在農(nóng)藥管理中十分重要。實(shí)現(xiàn)農(nóng)藥數(shù)據(jù)系統(tǒng)化管理的一種方法便是建立農(nóng)藥污染物數(shù)據(jù)庫,目前國外已經(jīng)建立了相對完善的農(nóng)藥毒理數(shù)據(jù)庫。我國部分農(nóng)藥毒理研究需依托于國外數(shù)據(jù)庫才能開展,這些數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)來源大多為英文文獻(xiàn)或具有英文摘要的非英語文獻(xiàn),且國外數(shù)據(jù)庫中中國本土生物毒性數(shù)據(jù)較少。這使我國開展農(nóng)藥毒理研究、生態(tài)風(fēng)險(xiǎn)評估研究時(shí)因國內(nèi)國外物種、生態(tài)結(jié)構(gòu)差異性等導(dǎo)致研究的科學(xué)性降低。

當(dāng)前,我國在開展環(huán)境污染物風(fēng)險(xiǎn)評估、環(huán)境污染物治理、農(nóng)藥管理、生態(tài)毒理學(xué)等方面的研究時(shí),也常常因缺乏我國本土的基礎(chǔ)毒性數(shù)據(jù)庫和平臺而備受掣肘。因此,建立本土化的農(nóng)藥環(huán)境與毒性數(shù)據(jù)庫和數(shù)據(jù)應(yīng)用平臺成為我國環(huán)境污染物研究的當(dāng)務(wù)之急。本文通過介紹國內(nèi)外農(nóng)藥相關(guān)數(shù)據(jù)庫的現(xiàn)狀,描述常用數(shù)據(jù)庫的基本情況、數(shù)據(jù)類型、種類及其特點(diǎn),供相關(guān)研究參考與使用。

01

國外主要農(nóng)藥相關(guān)數(shù)據(jù)庫簡介

國外的土壤環(huán)境污染物數(shù)據(jù)庫的建立工作發(fā)展較早,也較完善。歐美國家早在20世紀(jì)就已經(jīng)具備了完善系統(tǒng)的毒性數(shù)據(jù)庫及完善的數(shù)據(jù)收集和質(zhì)量檢查規(guī)范,例如歐洲食品安全局(European Food Safety Authority,EFSA)OpenFoodTox數(shù)據(jù)庫、美國環(huán)境保護(hù)局(Environmental Protection Agency,EPA)CompTox Chemicals Dashboard 數(shù)據(jù)庫、農(nóng)藥特性數(shù)據(jù)庫(Pesticide Properties Database,PPDB)等數(shù)據(jù)庫。國外毒性數(shù)據(jù)庫主要由國家政府機(jī)構(gòu)及相關(guān)科研單位或公司支持和建設(shè),由專業(yè)的相關(guān)部門管理和維護(hù),定期進(jìn)行數(shù)據(jù)更新。多數(shù)毒性數(shù)據(jù)庫支持面向公眾開放,完全或部分共享。

EFSA OpenFoodTox數(shù)據(jù)庫

EFSA于2002年成立,獨(dú)立于歐洲立法和行政機(jī)構(gòu)(委員會(huì)、理事會(huì)、議會(huì))以及歐盟成員國運(yùn)作,是歐盟食品和飼料安全的獨(dú)立風(fēng)險(xiǎn)評估機(jī)構(gòu)。該機(jī)構(gòu)旨在評估整個(gè)食物鏈的風(fēng)險(xiǎn),保護(hù)消費(fèi)者、動(dòng)物和環(huán)境免受與食品相關(guān)的風(fēng)險(xiǎn),為管理歐洲食品安全的決策者提供獨(dú)立的科學(xué)建議。

OpenFoodTox可提供有關(guān)食品和飼料中化學(xué)危害的開放數(shù)據(jù)源,農(nóng)藥風(fēng)險(xiǎn)評估相關(guān)數(shù)據(jù)是這個(gè)數(shù)據(jù)庫的重要內(nèi)容。其研究者已經(jīng)對2040多個(gè)科學(xué)觀點(diǎn)、聲明和結(jié)論中的近5000種物質(zhì)進(jìn)行了風(fēng)險(xiǎn)評估。對于每種物質(zhì),EFSA都從人類健康、動(dòng)物健康和生態(tài)危害評估方面進(jìn)行了總結(jié)。其中:物質(zhì)表征部分包含物質(zhì)的分子式、化學(xué)文摘社(Chemical Abstracts Service,CAS)號等數(shù)據(jù);參考點(diǎn)部分包含實(shí)驗(yàn)類型、物種、作用方式、效果、毒性等數(shù)據(jù);參考值部分包含物質(zhì)評定、特殊類群、參考值等數(shù)據(jù);OpenFoodTox部分包含化學(xué)評價(jià)、遺傳毒性、終點(diǎn)研究等數(shù)據(jù);EFSA輸出部分包含物質(zhì)的法律依據(jù)、輸出類型等數(shù)據(jù);基因毒性部分包括物質(zhì)的基因毒性、作者及發(fā)布年份數(shù)據(jù)。

該數(shù)據(jù)庫建立的目的是從EFSA研究人員的報(bào)告中提取、匯總數(shù)據(jù),因此其數(shù)據(jù)來源全部為EFSA報(bào)告(科學(xué)意見、聲明、農(nóng)藥評審結(jié)論),屬于二次摘錄的數(shù)據(jù)庫,可通過數(shù)據(jù)庫直接快速地查找原始數(shù)據(jù)文獻(xiàn)。除農(nóng)藥數(shù)據(jù)以外,此數(shù)據(jù)庫還包括食品添加劑、營養(yǎng)物、食物鏈中的污染物數(shù)據(jù)等。數(shù)據(jù)庫的終點(diǎn)部分報(bào)告了關(guān)鍵研究,科研人員可從該參考研究中獲得參考值。在輸入數(shù)據(jù)時(shí),數(shù)據(jù)庫會(huì)自動(dòng)驗(yàn)證數(shù)據(jù)質(zhì)量,而且需要手動(dòng)修訂要提交的數(shù)據(jù)以保證數(shù)據(jù)正確無誤。EFSA擁有科學(xué)委員會(huì)和專家小組分析其發(fā)布的相關(guān)數(shù)據(jù),有審計(jì)員審核,保證數(shù)據(jù)的可信度,同時(shí)承諾公開透明其全部工作。

EFSAOpenFoodTox數(shù)據(jù)庫網(wǎng)址為:

https://www.efsa./en/data/chemical-hazards-data(可免費(fèi)瀏覽和使用)

EPA CompTox Chemicals Dashboard數(shù)據(jù)庫

EPA成立于1970年12月2日。其中,分布式結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫于2004年公開發(fā)布,目前收錄了超過875000種物質(zhì),主要內(nèi)容為EPA環(huán)境研究人員的研究,2014年后依次自動(dòng)加載了3個(gè)公共數(shù)據(jù)集經(jīng)過篩選后的部分:EPA的物質(zhì)注冊服務(wù)(substance registration service,SRS)、美國國家醫(yī)學(xué)圖書館的ChemID和PubChem。起初可搜索毒性數(shù)據(jù)庫(Distributed Structure-Searchable Toxicity,DSSTox)中僅有7000多種化學(xué)物質(zhì)的信息且均為手動(dòng)錄入,到2013年擴(kuò)充到24000種物質(zhì),手動(dòng)管理與維護(hù)已經(jīng)無法支撐進(jìn)一步發(fā)展。DSSTox_V2隨之誕生,第二代不僅將第一代DSSTox的數(shù)據(jù)全部數(shù)字化,并且加載擴(kuò)展了多個(gè)公共化學(xué)數(shù)據(jù)庫,使得DSSTox_V2擁有超過740000種化學(xué)品的相關(guān)數(shù)據(jù)。2016年EPA在DSSTox_V2的基礎(chǔ)上發(fā)布CompTox Chemicals Dashboard,是供公眾訪問DSSTox的化學(xué)物質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫和索引列表的主要工具。

EPA還擁有其他農(nóng)藥和毒理學(xué)相關(guān)的數(shù)據(jù)庫,包括農(nóng)藥化學(xué)品搜索(Pesticide Chemical Search)、ChemView、綜合風(fēng)險(xiǎn)信息系統(tǒng)、水質(zhì)門戶網(wǎng)站、國家農(nóng)藥信息檢索系統(tǒng)等多個(gè)數(shù)據(jù)庫。EPA主頁上可以檢索到有毒物質(zhì)和疾病管理局的毒理學(xué)概況,大概有275種物質(zhì)的毒理學(xué)報(bào)告,數(shù)據(jù)內(nèi)容包括物質(zhì)的基本信息、理化性質(zhì)、人體健康數(shù)據(jù)指標(biāo)及法律法規(guī)等。其主頁網(wǎng)址是https://www./,針對農(nóng)藥風(fēng)險(xiǎn)評估的網(wǎng)址是https://www./pesticide-science-and-assessing-pesticide-risks,介紹了大量農(nóng)藥風(fēng)險(xiǎn)評估、農(nóng)藥數(shù)據(jù)庫、農(nóng)藥科學(xué)等內(nèi)容。

EPA CompTox Chemicals Dashboard的網(wǎng)址為:

https://comptox./dashboard(可免費(fèi)瀏覽使用)

PPDB

2007年,PPDB作為一個(gè)免費(fèi)訪問網(wǎng)站推出。它由赫特福德大學(xué)農(nóng)藥與環(huán)境研究所為各種終端用戶開發(fā),從隨附于農(nóng)業(yè)環(huán)境管理軟件的數(shù)據(jù)庫演變而來,并得到了系統(tǒng)的進(jìn)一步開發(fā),在歐盟資助的FOOTPRINT項(xiàng)目支持和所獲收入的幫助下進(jìn)行了擴(kuò)展,支持風(fēng)險(xiǎn)評估和風(fēng)險(xiǎn)管理。

PPDB是提供農(nóng)藥化學(xué)特性、物理化學(xué)、人類健康和生態(tài)毒理學(xué)數(shù)據(jù)的綜合信息數(shù)據(jù)庫。截至2017年,PPDB擁有近2300種農(nóng)藥活性物質(zhì)和700多種代謝物的數(shù)據(jù)。每種物質(zhì)大約存儲300個(gè)參數(shù),涵蓋化學(xué)結(jié)果、一般狀況、農(nóng)藥配方、環(huán)境趨勢、生態(tài)毒理學(xué)、人體健康和保護(hù)6方面的內(nèi)容。PPDB的數(shù)據(jù)從全球出版的科學(xué)文獻(xiàn)和數(shù)據(jù)庫、手冊、注冊數(shù)據(jù)庫、公司技術(shù)數(shù)據(jù)表和研究項(xiàng)目中獲取。這些數(shù)據(jù)在輸入數(shù)據(jù)庫之前必須經(jīng)過質(zhì)量控制,使用的方法有同行評審以及與其他數(shù)據(jù)庫和數(shù)據(jù)源交叉檢查。如果數(shù)據(jù)存在疑問且已知原始參考來源,PPDB會(huì)重新訪問原始來源,并調(diào)整其質(zhì)量得分,供使用者參考。

其所含農(nóng)藥種類包括已批準(zhǔn)使用的農(nóng)藥、新研發(fā)的農(nóng)藥及過時(shí)或禁用的農(nóng)藥。除農(nóng)藥特性數(shù)據(jù)庫外,它還有兩個(gè)關(guān)于生物農(nóng)藥和獸藥的數(shù)據(jù)庫。

其網(wǎng)站為:

http://sitem./aeru/ppdb/en/index.htm(可以免費(fèi)瀏覽)

農(nóng)藥行動(dòng)網(wǎng)絡(luò)(Pesticide Action Network,PAN)

PAN農(nóng)藥數(shù)據(jù)庫是關(guān)于農(nóng)藥毒性和法規(guī)信息的一站式站點(diǎn),成立于1982年。PAN是由90多個(gè)國家的600多個(gè)非政府組織、機(jī)構(gòu)和個(gè)人組成的網(wǎng)絡(luò),有五個(gè)獨(dú)立的合作區(qū)域中心來實(shí)施其項(xiàng)目和活動(dòng),分別是非洲中心、北美中心、拉丁美洲中心、歐洲中心和亞太中心。PAN農(nóng)藥數(shù)據(jù)庫由北美中心負(fù)責(zé)維護(hù)和更新,匯集不同來源的農(nóng)藥信息,提供約6400種農(nóng)藥及其轉(zhuǎn)化產(chǎn)物的數(shù)據(jù)信息,其數(shù)據(jù)內(nèi)容包括識別信息、健康毒性(慢性和急性)、中毒癥狀、監(jiān)管、水污染潛力、生態(tài)毒性、法規(guī)信息等。它是北美注冊使用農(nóng)藥數(shù)據(jù)信息最為完整的數(shù)據(jù)庫。為了確保其數(shù)據(jù)準(zhǔn)確性,數(shù)據(jù)均經(jīng)過科學(xué)家的同行評審,大部分?jǐn)?shù)據(jù)來自經(jīng)證據(jù)權(quán)重評估的官方信息。

所有數(shù)據(jù)源均有引用來源,方便用戶非??焖俚孬@取原始數(shù)據(jù)集。每種數(shù)據(jù)都有參考文檔表明數(shù)據(jù)來源,并且說明每種來源的準(zhǔn)確性、時(shí)效性和全面性。PAN的數(shù)據(jù)主要來源于官方機(jī)構(gòu),如美國EPA、世界衛(wèi)生組織、國家毒理學(xué)計(jì)劃、美國國立衛(wèi)生研究院、國際癌癥研究機(jī)構(gòu)。如果數(shù)據(jù)從互聯(lián)網(wǎng)上獲得,則也有指向原始數(shù)據(jù)源的鏈接,當(dāng)數(shù)據(jù)無法從權(quán)威數(shù)據(jù)庫獲取時(shí),則提供原始數(shù)據(jù)來源,即經(jīng)過同行專家評議過的科學(xué)文獻(xiàn)。

其網(wǎng)站是http://www./(可免費(fèi)瀏覽)

美國生態(tài)毒理數(shù)據(jù)庫(Ecotoxicology Database,ECOTOX)

ECOTOX由EPA研究與發(fā)展辦公室的國家健康與環(huán)境影響研究實(shí)驗(yàn)室中部大陸生態(tài)分區(qū)部門開發(fā)和維護(hù),其數(shù)據(jù)主要是某一種化學(xué)物質(zhì)對水生生物、陸生生物的生態(tài)毒性數(shù)據(jù),由ECOTOX的工作人員從美國EPA中部大陸生態(tài)分區(qū)圖書館館藏文獻(xiàn)中搜集。

ECOTOX主要由AQUIRE、PHYTOTOX和TERRETOX 3個(gè)獨(dú)立數(shù)據(jù)庫整合而成,收錄了由1970年至今已發(fā)表文獻(xiàn)中水生和陸生生物毒性數(shù)據(jù)。截至2020年2月8日,該數(shù)據(jù)庫中共包含11822種化學(xué)物信息,涵蓋13039種物種。該數(shù)據(jù)庫約每三個(gè)月更新一次。數(shù)據(jù)內(nèi)容包含化學(xué)污染物基本信息如英文名稱、化學(xué)名稱、溶劑名稱、CAS號、分子式、純度值等;實(shí)驗(yàn)生物參數(shù)如受試生物的名稱、拉丁名稱、數(shù)量、生活齡期及其特征描述等數(shù)據(jù);實(shí)驗(yàn)條件信息包括實(shí)驗(yàn)類型、實(shí)驗(yàn)毒物濃度或劑量、實(shí)驗(yàn)位置、染毒方式、實(shí)驗(yàn)持續(xù)時(shí)間等信息;毒性參數(shù)包括半數(shù)致死劑量(LD50)、致死中濃度(LC50)、殘留毒性的效應(yīng)和終點(diǎn)數(shù)據(jù)等。數(shù)據(jù)質(zhì)量檢查分為兩方面,分別是收集人員自我檢查以及有經(jīng)驗(yàn)的數(shù)據(jù)收集人員檢查和數(shù)據(jù)管理員終檢。

該數(shù)據(jù)庫的網(wǎng)址為:

https://cfpub./ecotox/search.cfm(可免費(fèi)瀏覽使用)

毒理學(xué)數(shù)據(jù)網(wǎng)絡(luò)(TOXicology data NETwork, TOXNET)

TOXNET是一組數(shù)據(jù)庫的總稱,它由美國國家醫(yī)學(xué)圖書館專業(yè)信息服務(wù)部建成,包含毒理學(xué)文獻(xiàn)在線、發(fā)育和生殖毒理學(xué)數(shù)據(jù)庫2個(gè)文獻(xiàn)性數(shù)據(jù)庫,以及化學(xué)致癌研究信息系統(tǒng)、致癌效力數(shù)據(jù)庫、比較毒物基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫、遺傳學(xué)數(shù)據(jù)庫、有害物質(zhì)數(shù)據(jù)庫、綜合風(fēng)險(xiǎn)信息系統(tǒng)、國際毒性風(fēng)險(xiǎn)評估等12個(gè)數(shù)據(jù)庫。目前,有害物質(zhì)數(shù)據(jù)庫中涵蓋5000多種經(jīng)過專家評審的危險(xiǎn)化學(xué)品毒理學(xué)數(shù)據(jù),而毒藥學(xué)文獻(xiàn)在線數(shù)據(jù)庫中有400萬條參考藥物和其他化學(xué)品的生物化學(xué)、藥理學(xué)、生理學(xué)和毒理學(xué)影響數(shù)據(jù),其余數(shù)據(jù)庫也均有專業(yè)且翔實(shí)的信息,其數(shù)據(jù)量可在網(wǎng)站每個(gè)數(shù)據(jù)庫鏈接下找到。其數(shù)據(jù)的主要內(nèi)容包含化學(xué)物質(zhì)的基本信息;健康毒性如致癌性、誘變性、腫瘤增生及抑制性、健康危險(xiǎn)評估數(shù)據(jù)等;環(huán)境數(shù)據(jù)如安全管理、生態(tài)毒理數(shù)據(jù);以及藥物與化學(xué)藥品的檢測數(shù)據(jù)和其生物化學(xué)、藥理學(xué)、生理學(xué)、毒理學(xué)相關(guān)的知識及數(shù)據(jù)。其數(shù)據(jù)均來自核心權(quán)威圖書、政府公文、EPA技術(shù)報(bào)告及主流期刊。使用者可選擇檢索單個(gè)、若干個(gè)或所有數(shù)據(jù)庫。

TOXNET系列數(shù)據(jù)庫的網(wǎng)址為:

https://toxnet.nlm./(所有內(nèi)容均可免費(fèi)獲得)但因美國國家醫(yī)學(xué)圖書館重組,其中大多數(shù)毒理學(xué)信息服務(wù)已集成到其他產(chǎn)品和服務(wù)中。其中有害物質(zhì)數(shù)據(jù)庫、化學(xué)致癌研究信息系統(tǒng)、遺傳學(xué)數(shù)據(jù)庫匯入PubChem,毒理學(xué)文獻(xiàn)在線、發(fā)育和生殖毒理學(xué)數(shù)據(jù)庫2個(gè)文獻(xiàn)性數(shù)據(jù)庫匯入PubMed,綜合風(fēng)險(xiǎn)信息系統(tǒng)、致癌效力數(shù)據(jù)庫、比較毒物基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫已不在TOXNET支持服務(wù)內(nèi),但仍然可以訪問其數(shù)據(jù),上文中TOXNET網(wǎng)址指明了這幾個(gè)數(shù)據(jù)庫的訪問鏈接。

國外主要數(shù)據(jù)庫比較

查詢數(shù)據(jù)比較

EFSA和EPA的數(shù)據(jù)庫以查詢評估報(bào)告或其他文獻(xiàn)資料的形式進(jìn)行數(shù)據(jù)檢索,數(shù)據(jù)涵蓋基本信息(CAS號、分子式、相對分子質(zhì)量等)、理化性質(zhì)(物質(zhì)狀態(tài)、熔點(diǎn)、沸點(diǎn)、分解溫度、飽和蒸氣壓、亨利常數(shù)、水溶解度、有機(jī)溶劑溶解度等)、環(huán)境行為(降解速率、吸附系數(shù)、水解速率、光解速率等)、健康毒性(每日允許攝入量、急性參考劑量、操作者允許接受水平等)、生態(tài)毒理等方面,比較詳細(xì)。PPDB和PAN數(shù)據(jù)庫可直接查詢數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)指標(biāo)較前者少。ECOTOX為生態(tài)毒理數(shù)據(jù)庫,提供鳥類、哺乳動(dòng)物、魚類、水生無脊椎動(dòng)物、底棲生物、藻類、水生高等植物、水生微宇宙和中宇宙實(shí)驗(yàn)、蜜蜂、其他節(jié)肢動(dòng)物、蚯蚓、彈尾目、其他單個(gè)物種等多種較詳細(xì)的生態(tài)毒理數(shù)據(jù)。

表1 國外主要農(nóng)藥相關(guān)數(shù)據(jù)庫包含的數(shù)據(jù)指標(biāo)對比

  優(yōu)缺點(diǎn)比較

EFSA的數(shù)據(jù)相對完善,數(shù)據(jù)較多,但數(shù)據(jù)的查找比較煩瑣,且僅收錄歐盟的數(shù)據(jù)。EPA的數(shù)據(jù)類型及種類同樣較全,同時(shí)還另將農(nóng)藥數(shù)據(jù)庫獨(dú)立出來,更有利于搜集查詢。PPDB和PAN是純農(nóng)藥數(shù)據(jù)庫,其數(shù)據(jù)類型及指標(biāo)針對性更強(qiáng),對于獲取農(nóng)藥數(shù)據(jù)更加方便且專業(yè)。ECOTOX數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)資料多源于文獻(xiàn),且不需要閱讀文獻(xiàn),直接以表格的方式呈現(xiàn)數(shù)據(jù),還可以直接導(dǎo)出為Excel文件,方便使用者統(tǒng)計(jì);但導(dǎo)出數(shù)據(jù)在使用時(shí)還需要進(jìn)行核實(shí)和篩選。TOXNET數(shù)據(jù)庫內(nèi)容多側(cè)重于藥物且缺少生態(tài)毒理方面的數(shù)據(jù)。

表2 國外主要農(nóng)藥相關(guān)數(shù)據(jù)庫優(yōu)缺點(diǎn)比較在環(huán)境管理應(yīng)用中的比較

  

對于環(huán)境管理研究,優(yōu)先推薦EFSA OpenFoodTox、EPA CompTox Chemicals Dashboard、PPDB和ECOTOX數(shù)據(jù)庫。EFSA OpenFoodTox和EPA CompTox Chemicals Dashboard數(shù)據(jù)類型豐富,基本涵蓋了環(huán)境管理研究所需,包含歐洲和美國田野實(shí)驗(yàn)和實(shí)驗(yàn)室的原始數(shù)據(jù)。但若無法有效檢索到相關(guān)數(shù)據(jù),則可以使用PPDB快速獲得化學(xué)物質(zhì)的基本信息、理化性質(zhì)、環(huán)境行為、健康毒性的數(shù)據(jù),再結(jié)合ECOTOX大量的生態(tài)毒理數(shù)據(jù),就可以補(bǔ)全研究所需信息。不建議使用PAN和TOXNET數(shù)據(jù)庫。PAN數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)量和數(shù)據(jù)類型較少,難以滿足研究所需,可使用PPDB 代替;TOXNET數(shù)據(jù)庫現(xiàn)已整合到其他美國國家醫(yī)學(xué)圖書館服務(wù)當(dāng)中,需要單獨(dú)進(jìn)入下屬數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索,操作較為煩瑣。

02

國內(nèi)農(nóng)藥相關(guān)數(shù)據(jù)庫簡介

國內(nèi)農(nóng)藥相關(guān)數(shù)據(jù)庫建設(shè)現(xiàn)狀

自1978年起,我國開始建立農(nóng)藥數(shù)據(jù)庫,包括中國國家有毒化學(xué)品基礎(chǔ)數(shù)據(jù)庫、中國科學(xué)院化學(xué)物質(zhì)毒性數(shù)據(jù)庫、上海有機(jī)所化學(xué)專業(yè)數(shù)據(jù)庫等。這些數(shù)據(jù)庫的主要內(nèi)容為物質(zhì)的基本信息、理化性質(zhì)數(shù)據(jù)、健康毒性數(shù)據(jù)、來源文獻(xiàn)、職業(yè)標(biāo)準(zhǔn)和相關(guān)法規(guī)等信息。

中國國家有毒化學(xué)品基礎(chǔ)數(shù)據(jù)庫

中國國家有毒化學(xué)品基礎(chǔ)數(shù)據(jù)庫由環(huán)境科學(xué)研究院于1990年建成,包含11個(gè)子庫。數(shù)據(jù)主要來源于1985年“全國化學(xué)品調(diào)查登記”所收集的萬種化學(xué)品的檔案材料、國外的化學(xué)物質(zhì)毒性數(shù)據(jù)庫(Registry of Toxic Effects of Chemical Substances,RTECS)和國際潛在有毒化學(xué)品登記中心數(shù)據(jù)庫,現(xiàn)不能在網(wǎng)上公開使用。

化學(xué)物質(zhì)毒性數(shù)據(jù)庫

化學(xué)物質(zhì)毒性數(shù)據(jù)庫由中國科學(xué)院過程研究所發(fā)布,由中國科學(xué)院計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)信息中心承擔(dān)建設(shè),是綜合科技信息數(shù)據(jù)庫的重要組成部分。該數(shù)據(jù)庫分為三部分:化學(xué)物質(zhì)毒性英文數(shù)據(jù)庫、化學(xué)物質(zhì)毒性中文文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫、化學(xué)品安全特性數(shù)據(jù)庫。

化學(xué)物質(zhì)毒性英文數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)大部分來自2001年前公開發(fā)行的RTECS。在2001年之前RTECS是美國國家職業(yè)安全衛(wèi)生研究所免費(fèi)提供的出版物,但現(xiàn)在RTECS屬于硅谷高科技公司Symyx Technologies,并且必須訂閱付費(fèi)才能獲取數(shù)據(jù)?;瘜W(xué)物質(zhì)毒性英文數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)從20世紀(jì)50年代開始積累,每年四次更新。至2003年,英文數(shù)據(jù)庫總數(shù)據(jù)量約300 MB,含150000多個(gè)記錄,包括刺激性、毒性、致畸、致癌與生殖效應(yīng)等健康毒性數(shù)據(jù),以及生態(tài)環(huán)境標(biāo)準(zhǔn)與職業(yè)衛(wèi)生標(biāo)準(zhǔn)、EPA文件數(shù)據(jù)等,也涵蓋了關(guān)于化學(xué)品安全管理、預(yù)防化學(xué)事故和災(zāi)害應(yīng)急響應(yīng)中需要的物理(易燃性、易爆性)、化學(xué)(毒性、環(huán)境標(biāo)準(zhǔn))的特性數(shù)據(jù),基本滿足職業(yè)衛(wèi)生、公共衛(wèi)生以及環(huán)境研究等工作需要。

化學(xué)物質(zhì)毒性中文文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫編輯整理了約120多種自1953年至今國內(nèi)公開定期出版的期刊論文中的實(shí)驗(yàn)、觀測等產(chǎn)生的特性數(shù)據(jù),并由專家負(fù)責(zé)對數(shù)據(jù)進(jìn)行審核與校正,按照一定的數(shù)據(jù)規(guī)格錄入化學(xué)物質(zhì)毒性中文文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫。化學(xué)物質(zhì)毒性中文文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)收錄工作自2003年啟動(dòng),截至目前已建成數(shù)據(jù)量約5.6 MB,含3300余條記錄。

化學(xué)品安全特性數(shù)據(jù)庫,其數(shù)據(jù)內(nèi)容主要是常見化學(xué)物質(zhì)的物理安全特性(易燃性、易爆性、儲運(yùn)條件)、化學(xué)安全特性(毒性、環(huán)境標(biāo)準(zhǔn))等實(shí)質(zhì)性數(shù)據(jù);并且收錄了如CAS號、化學(xué)名、商品名、相對分子質(zhì)量和分子式等基本信息。目前含有約5 MB、7300多條記錄,由中國科學(xué)院自主開發(fā)。

其網(wǎng)址為:http://www.toxic./(向注冊用戶免費(fèi)開放)

化學(xué)專業(yè)數(shù)據(jù)庫

化學(xué)專業(yè)數(shù)據(jù)庫附屬于中國科學(xué)院信息化專項(xiàng)科學(xué)大數(shù)據(jù)工程項(xiàng)目,由中科院上海有機(jī)化學(xué)研究所承擔(dān)建設(shè)。此數(shù)據(jù)庫現(xiàn)已成為國內(nèi)最大的公益性化學(xué)數(shù)據(jù)庫,部分?jǐn)?shù)據(jù)來自RTECS,下文介紹化學(xué)專業(yè)數(shù)據(jù)庫中的兩個(gè)子庫。

毒藥物動(dòng)力學(xué)預(yù)測數(shù)據(jù)庫是上海有機(jī)化學(xué)研究所化學(xué)專業(yè)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)的一部分,收錄常見藥物研發(fā)所需的大量毒藥物動(dòng)力學(xué)預(yù)測數(shù)據(jù)和毒性估測數(shù)據(jù)??偣舶?0萬多種常見的天然化合物和藥用化合物。用戶可通過輸入化合物結(jié)構(gòu)來檢索數(shù)據(jù)庫中的物質(zhì),或通過設(shè)定預(yù)測數(shù)據(jù)的種類和數(shù)值范圍,篩選出目標(biāo)化合物。

網(wǎng)址為:

http://www.organchem./scdb/main/ADME_introduce.asp(使用前需注冊賬戶)

上海有機(jī)化學(xué)研究所環(huán)境化學(xué)毒物防治數(shù)據(jù)庫目前收錄了1000余種環(huán)境有害化學(xué)毒物的防治技術(shù)資料,包含化學(xué)毒物的穩(wěn)定性、毒理學(xué)資料、中毒臨床、生態(tài)危害與環(huán)境保護(hù)、安全生產(chǎn)與勞動(dòng)保護(hù)、流行病學(xué)調(diào)查、理化特性等內(nèi)容。用戶可通過化學(xué)品的中英文名稱、CAS號、分子式、毒物類型等檢索化學(xué)品并查看其毒性防治信息。

網(wǎng)址為:

http://www.organchem./scdb/main/huanjing_introduce.asp(使用前需注冊賬戶)

農(nóng)獸藥數(shù)據(jù)庫

由煙臺富美特食品科技有限公司旗下食品行業(yè)綜合性門戶網(wǎng)站—食品伙伴網(wǎng)開設(shè)的農(nóng)獸藥數(shù)據(jù)庫,數(shù)據(jù)更新至2012年,共計(jì)3500余種農(nóng)、獸藥數(shù)據(jù)條目。數(shù)據(jù)包含農(nóng)獸藥的基本信息、理化性質(zhì)、毒理學(xué)、應(yīng)用情況等。

其網(wǎng)址為:http://db.foodmate.net/pesticide/(可免費(fèi)瀏覽)

國內(nèi)數(shù)據(jù)庫比較

中國國家有毒化學(xué)品基礎(chǔ)研究庫有較好的數(shù)據(jù)權(quán)威性,但不能在互聯(lián)網(wǎng)上訪問;化學(xué)物質(zhì)毒性數(shù)據(jù)庫生態(tài)毒理數(shù)據(jù)較少;化學(xué)專業(yè)數(shù)據(jù)庫無專門的農(nóng)藥數(shù)據(jù)庫;農(nóng)獸藥數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)來源較不明確。

表3 國內(nèi)主要農(nóng)藥相關(guān)數(shù)據(jù)庫優(yōu)缺點(diǎn)比較

  

國內(nèi)農(nóng)藥相關(guān)數(shù)據(jù)庫建設(shè)的局限性

目前中國本土農(nóng)藥相關(guān)數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)仍不夠全面,從上文列舉的四個(gè)數(shù)據(jù)庫可以看出:

(1)我國本土毒性數(shù)據(jù)較為缺乏。國內(nèi)數(shù)據(jù)庫中中國本土生物的健康毒性數(shù)據(jù)比國外少,且缺乏大量生態(tài)毒理數(shù)據(jù)。以化學(xué)物質(zhì)毒性數(shù)據(jù)庫為例,英文文獻(xiàn)有150000多條記錄,且來自外國數(shù)據(jù)庫,而國內(nèi)數(shù)據(jù)為3300余條。

(2)數(shù)據(jù)收集內(nèi)容較少。我國本土數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)主要包括物質(zhì)基本性質(zhì)、少數(shù)環(huán)境行為數(shù)據(jù)、健康毒性、來源文獻(xiàn)等,其中健康毒性數(shù)據(jù)包含急性毒性、每日允許攝入量、急性參考劑量、操作者允許接受水平、測試方法、暴露途徑等,生態(tài)毒性方面包括測試物種的模糊名稱(俗名)、毒性物質(zhì)用量、暴露時(shí)間、毒性作用描述等信息。對比美國ECOTOX數(shù)據(jù)庫,除包含上述國內(nèi)化學(xué)物質(zhì)毒性數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)類型外,其數(shù)據(jù)詳細(xì)到物種分類學(xué)名,物種種類也更加豐富,物種會(huì)注明齡期,標(biāo)明實(shí)驗(yàn)條件以及毒性實(shí)驗(yàn)相關(guān)參數(shù)等方面關(guān)鍵的毒性信息,相較于國內(nèi)數(shù)據(jù)庫更加詳細(xì)完善。

(3)數(shù)據(jù)更新維護(hù)不及時(shí)。國內(nèi)的化學(xué)英文數(shù)據(jù)庫大部分?jǐn)?shù)據(jù)來自美國的RTECS,并且是2001年之前的公開版本,沒有進(jìn)行及時(shí)更新,農(nóng)獸藥數(shù)據(jù)庫僅更新至2012年的數(shù)據(jù)。

(4)數(shù)據(jù)共享不足。國內(nèi)數(shù)據(jù)庫存在不提供免費(fèi)查詢和瀏覽功能,需要單獨(dú)注冊,部分使用受限,不對外開放且普適性較差的問題。

(5)尚未建立數(shù)據(jù)收集規(guī)范、數(shù)據(jù)篩選標(biāo)準(zhǔn)。我國本土數(shù)據(jù)庫目前尚未建立毒性數(shù)據(jù)的收集和整編規(guī)范,缺乏嚴(yán)格的數(shù)據(jù)篩選標(biāo)準(zhǔn),因此無法保證數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性、可靠性,也可能會(huì)影響評價(jià)結(jié)果。

(6)缺乏專門的農(nóng)藥數(shù)據(jù)庫。我國的數(shù)據(jù)庫多為化學(xué)物質(zhì)數(shù)據(jù)庫,包含物質(zhì)更多,但農(nóng)藥科學(xué)相關(guān)的生態(tài)毒理、健康毒性等數(shù)據(jù)不夠完善。而國外有PAN和PPDB等農(nóng)藥數(shù)據(jù)庫,更加方便農(nóng)藥環(huán)境相關(guān)研究的開展。

03

小結(jié)

雖然我國過去已經(jīng)開展了大量的農(nóng)藥科學(xué)與環(huán)境基準(zhǔn)方面的研究,也積累了相對豐富的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)資料,但由于數(shù)據(jù)的收集、整理、編纂和實(shí)地獲取極其耗時(shí)耗力,同時(shí)國內(nèi)缺少相應(yīng)的國家標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)規(guī)范為數(shù)據(jù)收集過程與整理提供支持,導(dǎo)致國內(nèi)相關(guān)數(shù)據(jù)庫建設(shè)工作極少,這些已成為我國生態(tài)環(huán)境研究發(fā)展的關(guān)鍵障礙。

國外數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)來源廣泛,數(shù)據(jù)內(nèi)容相對于我國數(shù)據(jù)庫更加豐富準(zhǔn)確,以及數(shù)據(jù)更新及時(shí)且完全共享等特性導(dǎo)致目前我國在開展農(nóng)藥環(huán)境研究時(shí)有關(guān)毒性的大部分?jǐn)?shù)據(jù)來源于國外數(shù)據(jù)庫。而在國外數(shù)據(jù)庫中,大部分是基于外國主要生物體系的數(shù)據(jù),中國本土的農(nóng)藥毒性數(shù)據(jù)較少。大量采用國外的有關(guān)數(shù)據(jù)開展相關(guān)研究,常常會(huì)因?yàn)榈赜蜷g物種差異、區(qū)域間污染物背景濃度和基本性質(zhì)不同、人體污染物暴露途徑和數(shù)量不同等原因而造成誤差,降低了相關(guān)研究的準(zhǔn)確度與可信度,使得有關(guān)研究的開展,農(nóng)藥污染的監(jiān)測、治理、防控受到影響。除此之外,由國外數(shù)據(jù)庫中所得到的數(shù)據(jù)多為急性毒理數(shù)據(jù),但針對農(nóng)藥的慢性中毒等方面的研究,同樣需要建立我國的農(nóng)藥慢性毒性數(shù)據(jù)庫,對各種農(nóng)藥的慢性毒性進(jìn)行長期連續(xù)的監(jiān)測。

04

展望

我國雖然目前沒有相對完善系統(tǒng)的農(nóng)藥毒性數(shù)據(jù)庫,但國外相關(guān)數(shù)據(jù)庫可以給我們許多啟示。綜合國外經(jīng)驗(yàn),我國的農(nóng)藥毒性數(shù)據(jù)庫建設(shè)迫切需要在以下幾方面有所突破:

(1)建立農(nóng)藥數(shù)據(jù)整編標(biāo)準(zhǔn)和規(guī)范。目前我國農(nóng)藥相關(guān)數(shù)據(jù)庫缺少毒性數(shù)據(jù)的整編標(biāo)準(zhǔn)和規(guī)范。建立系統(tǒng)的標(biāo)準(zhǔn)和完善的數(shù)據(jù)收集流流程可以充分保證數(shù)據(jù)庫建設(shè)的工作質(zhì)量,減少?zèng)]有意義的重復(fù)性任務(wù),提高數(shù)據(jù)收集的工作效率。我國可以借鑒ECOTOX數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)收集規(guī)范,其數(shù)據(jù)收集規(guī)范、數(shù)據(jù)質(zhì)量保證和檢查程序由過去30年數(shù)據(jù)生產(chǎn)過程中總結(jié)而成,我國可以在開展農(nóng)藥數(shù)據(jù)庫建設(shè)中學(xué)習(xí)期經(jīng)驗(yàn),來補(bǔ)足我國在數(shù)據(jù)整編技術(shù)方面與收集流程方面的不足。

(2)建立信息完整、豐富、有效和共享的農(nóng)藥數(shù)據(jù)庫。農(nóng)藥數(shù)據(jù)應(yīng)包括基礎(chǔ)信息(中英文名稱、化學(xué)名稱、CAS號、分子式、相對分子質(zhì)量)、理化性質(zhì)(物質(zhì)狀態(tài)、熔點(diǎn)、沸點(diǎn)、分解溫度、飽和蒸氣壓、亨利常數(shù)、水溶解度、有機(jī)溶劑溶解度、表面張力、辛醇/水分配系數(shù)、解離常數(shù)、可燃性(閃點(diǎn))、爆炸性、氧化性)、環(huán)境行為(土壤中的降解速率、吸附系數(shù)、水解速率、光解速率、生物富集系數(shù))、健康毒性(急性毒性、短期毒性、基因毒性、長期毒性、致癌性、生殖毒性、發(fā)育毒性、神經(jīng)毒性、每日允許攝入量、急性參考劑量、操作者允許接受水平)、生態(tài)毒理(物種信息、實(shí)驗(yàn)條件、實(shí)驗(yàn)結(jié)果信息等)。數(shù)據(jù)來源既可以學(xué)習(xí)EFSA OpenFoodTox和EPA CompTox Chemicals Dashboard從研究文獻(xiàn)中提取原始數(shù)據(jù),方便數(shù)據(jù)溯源;也可以學(xué)習(xí)ECOTOX和TOXNET將多個(gè)有關(guān)的毒性數(shù)據(jù)庫匯集編纂成完整的數(shù)據(jù)庫,供不同的科研需求人員使用。

(3)注重收集中國本土生物毒性數(shù)據(jù)。中國的農(nóng)藥毒理研究仍需要科技更加先進(jìn)國家的農(nóng)藥毒性數(shù)據(jù)庫提供支持。雖然我國已經(jīng)開展了一定量的本土生物毒理學(xué)實(shí)驗(yàn),但目前積累的健康毒性和生態(tài)毒理數(shù)據(jù)仍然不夠充足,無法有效保護(hù)我國本土生物與生態(tài)環(huán)境。國內(nèi)生物區(qū)系毒理數(shù)據(jù)的積累和完善是為符合中國國情的基準(zhǔn)研究提供支持的關(guān)鍵問題之一。因此,應(yīng)注重優(yōu)先收集涉及本土生物的毒理數(shù)據(jù),如國內(nèi)外數(shù)據(jù)庫、報(bào)告、項(xiàng)目中包含中國本土生物的毒性數(shù)據(jù)資源。

盡管我國尚未建立完備的農(nóng)藥基礎(chǔ)毒性數(shù)據(jù)庫和平臺,但伴隨著國內(nèi)農(nóng)藥毒性數(shù)據(jù)庫初步建立完成、信息化時(shí)代的到來以及國內(nèi)的科研力量不斷發(fā)展壯大,中國本土的農(nóng)藥毒理數(shù)據(jù)庫也一定能夠進(jìn)一步發(fā)展,漸趨完善。在此過程中,應(yīng)該充分借鑒國外數(shù)據(jù)庫的運(yùn)行經(jīng)驗(yàn),收集完善各項(xiàng)中國本土的農(nóng)藥毒性數(shù)據(jù),并促進(jìn)各個(gè)平臺間的信息交流及對外開放,為農(nóng)藥污染物測量監(jiān)督管理等方面的科研需求提供強(qiáng)有力的支持。

聲明:本文來源于《環(huán)境與職業(yè)醫(yī)學(xué)》2020年第12期

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