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來源：生物谷原創(chuàng) 2023-04-21 16:38 惡性腫瘤是人類死亡的主要原因之一。隨著生命科學研究的迅速發(fā)展，腫瘤細胞內(nèi)的各種基本過程，如信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細胞周期調(diào)節(jié)、細胞凋亡誘導(dǎo)、血管生成以及細胞與腫瘤微環(huán)境之間的相互作用，正在逐步闡明。 惡性腫瘤是人類死亡的主要原因之一。隨著生命科學研究的迅速發(fā)展，腫瘤細胞內(nèi)的各種基本過程，如信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細胞周期調(diào)節(jié)、細胞凋亡誘導(dǎo)、血管生成以及細胞與腫瘤微環(huán)境之間的相互作用，正在逐步闡明。隨著高通量測序技術(shù)的普及和腫瘤數(shù)據(jù)共享平臺的完善，泛癌研究越來越受到重視。 泛癌研究結(jié)合并分析不同有機原蛋白的癌癥，可以更深入、更廣泛地了解導(dǎo)致癌癥的一些常見信號通路的特征，并使研究人員能夠?qū)Ｗ⒂谙鄬^大樣本量的數(shù)據(jù)。樣本量越大，數(shù)據(jù)的統(tǒng)計能力越強，越容易發(fā)現(xiàn)與癌癥相關(guān)的基因組變化，因此泛腫瘤研究可能有助于發(fā)現(xiàn)以前從未發(fā)現(xiàn)的藥物靶點。
圖片來源：https:///10.1186/s12943-023-01752-8 近日，來自廣西醫(yī)學科學院的研究者們在Mol Cancer.雜志上發(fā)表了題為“Cuproptosis correlates with immunosuppressive tumor microenvironment based on pan-cancer multiomics and single-cell sequencing analysis”的文章，該研究為進一步研究銅死亡在癌癥發(fā)生發(fā)展中的作用以及基于銅死亡的靶向治療的發(fā)展開辟了途徑。 最近的研究表明，銅死亡是一種新型的細胞死亡方式，可能與癌癥的發(fā)展有關(guān)。然而，沒有研究表明它在腫瘤發(fā)生、進展和預(yù)后中的作用。在本研究中，研究者綜合分析了銅死亡相關(guān)基因（CRG）在胰腺癌中的表達差異、基因變異和甲基化修飾。然后，使用單樣本基因集富集分析（ssGSEA）來計算個體銅中毒評分（CS）。綜合評估CS與拷貝數(shù)變異、臨床特征、免疫相關(guān)基因、TMB、MSI和腫瘤免疫功能障礙和排斥（TIDE）的相關(guān)性。單細胞轉(zhuǎn)錄組測序（scRNA-seq）分析腫瘤微環(huán)境中銅中毒的激活。采用免疫組織化學（IHC）方法驗證銅中毒中樞基因的表達。 研究表明，CRG在多種腫瘤中顯著表達，CDKN2A在所有腫瘤中的突變頻率最高（49%）。在大多數(shù)癌癥中觀察到CS的顯著增加，并且在大多數(shù)腫瘤中與不良預(yù)后相關(guān)。在10多個腫瘤中，CS與腫瘤微環(huán)境評分呈顯著負相關(guān)，在11個腫瘤中與PD-L1呈正相關(guān)，表明參與了腫瘤免疫逃逸。scRNAseq表明，癌癥細胞的CRG評分顯著增加。
對GTEX和TCGA聯(lián)合數(shù)據(jù)庫進行銅中毒途徑評分分析 圖片來源：https:///10.1186/s12943-023-01752-8 綜上所述，該研究綜合評估了銅死亡在泛癌中的作用，銅中毒參與了腫瘤發(fā)生和轉(zhuǎn)移的大多數(shù)機制，并與腫瘤免疫逃逸有關(guān)。對銅中毒的綜合評估有助于提高人們對腫瘤發(fā)生和腫瘤微環(huán)境重塑的理解，并為進一步研究銅中毒與腫瘤的相關(guān)性提供基礎(chǔ)。（生物谷 Bioon.com） 參考文獻   |
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