以張仲景、華佗為代表的漢代醫(yī)家，拓寬了氣功臨床應(yīng)用的范圍。張仲景認(rèn)為氣功具有行氣血利九竅的作用，他在《金匱要略》中指出：“病邪……適中經(jīng)絡(luò)，未流傳臟腑，即醫(yī)治之，四肢才覺重滯，即導(dǎo)引吐納……勿令九竅閉塞。”

華佗則根據(jù)《呂氏春秋》“流水不腐，戶樞不蠹”的思想和《淮南子》上提到的若干動(dòng)物動(dòng)作，結(jié)合自己的臨床經(jīng)驗(yàn)，創(chuàng)編了一套動(dòng)功，名為五禽戲，“一曰虎，二曰鹿，三曰熊，四曰猿，五曰鳥”。功能“除疾，兼利蹄足，以當(dāng)導(dǎo)引；體有不快，起作一禽之戲，怡而汗出，因以著粉，身體輕便而欲食”。

在長沙馬王堆三號(hào)漢墓出土的隨葬品中，有幾件相當(dāng)珍貴的古代氣功文物，如《導(dǎo)引圖》《卻谷食氣篇》《養(yǎng)生方》等，反映出當(dāng)時(shí)醫(yī)家對(duì)氣功發(fā)展的貢獻(xiàn)?！秾?dǎo)引圖》是一張彩色帛畫，繪有男女多種練功姿勢。畫面上的44個(gè)練功姿勢分4行排列，但能辨認(rèn)者僅28個(gè)。整幅畫原無名稱，也無作者，現(xiàn)用之名為出土后依其內(nèi)容而定。

《卻谷食氣篇》是以描述“食氣”（即呼吸鍛煉）為主的練功方法之專著，也是歷史上首部專論卻谷的著作。全書僅26行，刻在竹簡上，對(duì)卻谷食氣的方法及適應(yīng)證有明確的論述。

《養(yǎng)生方》專論養(yǎng)生尤其是氣功養(yǎng)生的原則與方法。該書《十問》篇描述的治氣（即煉氣）方法是“息必深而久，新氣易守，宿氣易老，新氣易壽；善治氣者，使宿氣夜散，新氣朝聚，以徹九竅，而實(shí)六腑”。論述了呼吸鍛煉吐故納新之方法和作用。同篇論述的治氣四時(shí)注意事項(xiàng)，可與《卻谷食氣篇》中的內(nèi)容互為補(bǔ)充，如“食氣有禁：春避濁陽，夏避湯風(fēng)，秋避霜雪，冬避凌陰”。

東漢初年，佛教由印度傳入中國。漢代譯出的佛經(jīng)中，有專講禪定修持的《安般守意經(jīng)》，其內(nèi)容與古代氣功密切相關(guān)。禪定為佛教的重要修行方法，“安般守意”為坐禪時(shí)通過計(jì)數(shù)呼吸出入，使精神專注，進(jìn)入禪定意境。該書提出了兩種禪定調(diào)息法：一“謂數(shù)息、相隨、止觀、還凈……”為后世六妙法和數(shù)息觀的基礎(chǔ)；二是將練功過程中的呼吸分為4種不同的狀態(tài)，提出了呼吸四相，“一為風(fēng)，二為氣，三為息，四為喘”，并提出要結(jié)合意念將呼吸調(diào)至柔和輕細(xì)，對(duì)后世也頗具影響。

中國的道教也產(chǎn)生于漢代。這一時(shí)期道教的兩部重要著作《太平經(jīng)》《周易參同契》都有論及古代氣功的內(nèi)容?！短浇?jīng)》為原始道教的一部經(jīng)典，對(duì)氣功的修煉方法及理論均有貢獻(xiàn)。在方法上，該書提倡守一法和存想法。

認(rèn)為“守一明之法，長壽之根也”，并認(rèn)為全身均有可守之處；關(guān)于存想的操作，書中提出“使空室內(nèi)傍無人，畫像隨其臟色，與四時(shí)氣相應(yīng)，懸之窗光之中而思之”。在理論上，該書闡述了精、氣、神的相互轉(zhuǎn)化及其效用，認(rèn)為“氣生精，精生神，神生明；本于陰陽之氣，氣轉(zhuǎn)為精，精轉(zhuǎn)為神，神轉(zhuǎn)為明；欲壽者，當(dāng)守氣而合神……”《太平經(jīng)》中開始出現(xiàn)的“炁”字，專指內(nèi)練功法中的元?dú)?、先天之氣，沿用至今?！吨芤讌⑼酢烦鲇?/span>魏伯陽之手。該書以《周易》為主要說理工具，用于說明煉丹過程。但其所述之丹究竟屬外丹、內(nèi)丹或內(nèi)外丹兼論，長期以來各家之說不一。一般認(rèn)為，從內(nèi)容來看，為內(nèi)外丹兼論。自唐代始，該書為內(nèi)丹派所重視，宋代有稱其為“萬古丹經(jīng)王”之說，將其視作內(nèi)丹術(shù)的經(jīng)典著作。不過魏氏用詞隱晦，譬喻甚多，艱奧難通。故從唐宋開始出現(xiàn)多種注釋本。

《老子河上公章句》是后漢人托名老子所作，該書從氣功養(yǎng)生的角度闡發(fā)《老子》，對(duì)后世內(nèi)丹術(shù)、胎息的確立有很大的促進(jìn)作用?！痘茨献印肥?span>漢高祖之孫、西漢淮南王劉安所作，后世將其列為雜家言，書中基本上以道家觀點(diǎn)為中心，全面論述自然、社會(huì)問題。在氣功養(yǎng)生方面提出：“神貴于形也，故神制則行從，形勝而神窮?！敝鲝垺绑w道”，掌握陰陽變化，調(diào)節(jié)神志活動(dòng)，協(xié)調(diào)臟腑功能，使形與神合一，從而保持健康。