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Nature子刊:全基因組重建技術(shù)助力胚胎疾病風險預(yù)測

 子孫滿堂康復(fù)師 2022-11-23 發(fā)布于黑龍江

來源:科技部生物中心 2022-11-22 10:16

胚胎植入前基因檢測(Preimplantation genetic testing,PGT)是指在胚胎植入前篩查胚胎染色體,以排除攜帶遺傳疾病及染色體異常的胚胎,有效減少出生缺陷,是輔助生殖技術(shù)中提高

胚胎植入前基因檢測(Preimplantation genetic testing,PGT)是指在胚胎植入前篩查胚胎染色體,以排除攜帶遺傳疾病及染色體異常的胚胎,有效減少出生缺陷,是輔助生殖技術(shù)中提高妊娠成功率最有價值的手段之一。但由于胚胎中遺傳物質(zhì)有限,存在與等位基因缺失相關(guān)的不精確性,全面分析胚胎基因組成本高昂且耗時多。

發(fā)表在《Nature Medicine》上的一項題為“Whole-genome risk prediction of common diseases in human preimplantation embryos”的研究中,美國MyOme公司的研究團隊擴展了全基因組重建(Whole-genome reconstruction,WGR)策略,通過使用親本基因組測序和胚胎基因分型來預(yù)測胚胎的遺傳基因組序列,預(yù)測常見疾病的發(fā)生風險。

研究人員通過對父母進行高覆蓋率基因組測序,并對同胞胚胎進行陣列測量來實現(xiàn)胚胎的WGR。研究人員采用分子生物學和統(tǒng)計學相結(jié)合的方法,將親本染色體連接成對應(yīng)于單個整倍體染色體的“單倍型”,確定每個胚胎的減數(shù)分裂重組位點,并在每個重組位點之間組裝相關(guān)的單倍型片段,以近似整個遺傳胚胎基因組。與實際出生的嬰兒相比,結(jié)果顯示預(yù)測準確率約為98%。為了探索WGR在預(yù)測常見疾病風險中的準確性,研究人員使用重建的胚胎基因組計算多基因風險評分(Polygenic risk score,PRS),結(jié)果顯示與多基因風險評分相關(guān)的位點基因型準確率約為99%。

  綜上,這項臨床前研究證明了WGR策略的可行性,重建結(jié)果能夠準確計算PRS。利用WGR對常見變異進行PRS計算,可以較為準確地預(yù)測多種常見疾病的風險。


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