中國科學(xué)院上海巴斯德研究所研究員Daniel Falush團隊與挪威奧斯陸大學(xué)合作，在《自然-通訊》（Nature Communications）上，在線發(fā)表了題為Repeated out-of-Africa expansions of Helicobacter pylori driven by replacement of deleterious mutations的研究論文，報道了多次新的幽門螺桿菌非洲譜系“走出非洲”，并逐漸取代歐洲、中東當(dāng)?shù)刈V系的獨特進化歷史。該研究證實“走出非洲”過程中“瓶頸效應(yīng)”造成的有害突變累計是后續(xù)遷徙和取代其他地區(qū)當(dāng)?shù)刈V系的原因?！　? 

幽門螺桿菌是一種寄生在人體胃內(nèi)的細菌，是世界上人群感染率頗高的細菌之一。幽門螺桿菌感染會導(dǎo)致慢性胃炎和消化性潰瘍，并會顯著增加胃癌風(fēng)險。以往研究通常認為幽門螺桿菌與其宿主人類具有頗為相似的進化歷史，在人類祖先5萬年前通過一次“走出非洲”事件被傳播至世界各地。

該研究分析來自非洲、歐洲和亞洲的幽門螺桿菌基因組序列，發(fā)現(xiàn)至少存在三次獨立的“走出非洲”事件。研究進一步表明，在遺傳多樣性水平相似的情況下，與非洲菌株相比，歐亞菌株積累了更多的非同義突變，證明了最初遷徙出非洲后對于細菌適應(yīng)性產(chǎn)生了重要影響。作為雜合體的歐洲菌株缺乏亞洲血統(tǒng)（ancestry），表明了后續(xù)基因融合過程中這部分血統(tǒng)被取代。

研究表明，盡管幽門螺桿菌依賴人類傳播，但其DNA與人類DNA的傳播模式不同。該研究證明重要種群事件（如“走出非洲”）影響細菌適應(yīng)性以及種群動態(tài)變化模式。

幽門螺桿菌hpEurope菌株祖先血統(tǒng)（ancestry）構(gòu)成