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FLUKA 4-3.0和Flair 3.2-1安裝調(diào)試

 ProtonCN 2022-11-02 發(fā)布于北京

FLUKA 4-3.0是CERN九月份發(fā)布的第三個(gè)主版本,我們比較關(guān)注的更新有:體素幾何中危及器官勾畫(huà)的上限個(gè)數(shù)從100提升至400;用戶自定義程序source_newgen.f 可以從能譜(能量、強(qiáng)度)文件中進(jìn)行抽樣了;對(duì)程序的使用說(shuō)明書(shū)做了比較大的重整。同時(shí)Flair也升級(jí)到3.2-1版本。
Ubuntu 18.04安裝
Ubuntu 18.04是穩(wěn)定版本,加上有前期安裝經(jīng)驗(yàn),穩(wěn)妥起見(jiàn)我們安裝Ubuntu 18.04,安裝Ubuntu的常規(guī)操作本文不再贅述。Ubuntu下載地址:https:///。我們?cè)谝郧把b有FLUKA4.0的機(jī)器上進(jìn)行測(cè)試安裝。

FLUKA安裝

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老版本


如果是老系統(tǒng),里面安裝了原來(lái)版本的FLUKA,我們建議保留原來(lái)的版本,因?yàn)镕lair可以獨(dú)立進(jìn)行路徑修改,這方便了我們隨時(shí)可以選擇不同版本進(jìn)行計(jì)算。

2
安裝包下載

找到CERN提供的下載網(wǎng)頁(yè):https://fluka.cern/download/latest-fluka-release,這一次我們選擇用于Linux的.deb版本,也就是第三個(gè)。deb版本的安裝相對(duì)最簡(jiǎn)單。

3
gfortran安裝

由于沿用之前的系統(tǒng)版本,無(wú)需安裝gfortran,有需要的讀者參照之前的報(bào)告FLUKA 4.0和Flair 3.1安裝調(diào)試報(bào)告》中關(guān)于gfortran安裝的章節(jié)。

4
FLUKA安裝

把下載好的FLUKA安裝包復(fù)制到Ubuntu系統(tǒng)下的新建文件夾home/FLUKA4-3.0。文件夾命名可以隨意,但不能有空格。

然后在終端上用命令sudo dpkg -i fluka_4-2.0.x86-Linux-gfor7_amd64.deb進(jìn)行解壓和安裝。如果出現(xiàn)報(bào)錯(cuò),先執(zhí)行下面三行命令:
sudo rm /var/lib/dpkg/lock
sudo rm /var/lib/dpkg/lock-frontend
sudo rm /var/cache/apt/archives/lock

這個(gè)時(shí)候打開(kāi)bin目錄查看發(fā)現(xiàn),已經(jīng)生成了可執(zhí)行文件fluka等,注意,這種deb格式安裝后跟tgz格式安裝的目錄不同,deb安裝在根目錄下面/usr/local/fluka/bin。


Flair安裝

Flair是FLUKA的GUI。由于其友好的用戶界面,推薦大家都安裝使用,CERN版本的FLUKA則是強(qiáng)制使用的。目前最新版本是flair 3.2-1。對(duì)于Ubuntu系統(tǒng),優(yōu)先采用repository庫(kù)安裝方法。

1
repository庫(kù)安裝Flair

相比于之前復(fù)雜的安裝過(guò)程,尤其是依賴包的安裝過(guò)程,CERN提供了一個(gè)打包好的簡(jiǎn)易安裝方式,也就是常用的repository。用這種方法只需要三步就能完成flair和flair-geoviewer及其他依賴包的安裝。

(1)安裝repository庫(kù)的key,安裝公共存儲(chǔ)庫(kù)密鑰命令行是:
sudo wget -q -O - https://flair.web./flair/download/ubuntu/flair.gpg | sudo apt-key add -

(2)安裝Ubuntu 18.04對(duì)應(yīng)的repository庫(kù),命令行是:

sudoadd-apt-repository'deb [arch=all,amd64]https:///flair/download/ubuntu/18.04 /'

這一步可能需要時(shí)間比較長(zhǎng),根據(jù)當(dāng)?shù)氐木W(wǎng)速而定,可以喝杯咖啡休息一下。如果發(fā)現(xiàn)第三步無(wú)法進(jìn)行,需要重復(fù)一下這一步。


(3)輸入安裝命令回車(chē):sudo apt install flair。在終端中可以看到許多依賴包,包括DICOM相關(guān)的模塊都將自動(dòng)安裝。這步的時(shí)間較長(zhǎng),根據(jù)當(dāng)?shù)氐木W(wǎng)速而定。如果不成功,嘗試換個(gè)時(shí)間段。

可以看到flair成功升級(jí)到3.2-1版本:


Flair運(yùn)行測(cè)試

用命令行打開(kāi)flair:flair sobp.inp &。新版Flair打開(kāi)后彈出證書(shū)協(xié)議,拉到最底部點(diǎn)擊I agree即可。

點(diǎn)擊菜單上的Updates控件檢查版本情況,發(fā)現(xiàn)FLUKA(9月15日發(fā)布)和Flair(10月24日發(fā)布)的版本都已經(jīng)是最新的了。

如果出現(xiàn)無(wú)法識(shí)別FLUKA unkown的情況, 并且要求set fluka directory:

這里就需要最后做一個(gè)簡(jiǎn)單的手動(dòng)操作:進(jìn)入Flair的配置界面Config,將安裝路徑/usr/local/fluka/bin復(fù)制到Fluka Directory中,其他不變。設(shè)置好之后點(diǎn)擊OK。

對(duì)于啟用Source的讀者,Source的編譯請(qǐng)參照之前的文章《FLUKA進(jìn)階——展寬的布拉格峰》。中源文件一節(jié),最初編譯自定義用戶文件時(shí)可能遇到這樣的報(bào)錯(cuò):

是因?yàn)槿鄙賚ibz-dev,我們用命令安裝:sudo apt install libz-dev

這時(shí)候就可以正常編譯了:

設(shè)置50,000粒子數(shù),再進(jìn)入運(yùn)行Run界面,點(diǎn)擊Start。運(yùn)行1個(gè)cycle,需要不到1 min。

運(yùn)行完成后,再合并fort文件得到.bnn文件就可以畫(huà)圖了。進(jìn)入Plot界面畫(huà)二維圖,其操作過(guò)程跟原來(lái)版本一致,得到SOBP,并與質(zhì)子能量的權(quán)重合成一個(gè)圖,如下所示。

(質(zhì)子中國(guó) 編輯報(bào)道)

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