在一項新的研究中，來自deCODE Genetics和冰島雷克雅未克大學等研究機構(gòu)的研究人員報告了英國生物庫（UK biobank）中15萬參與者的全基因組序列。這是迄今為止最大的全基因組測序工作，這些作者將在三年內(nèi)對50萬個全基因組進行測序。相關(guān)研究結(jié)果于2022年7月20日在線發(fā)表在Nature期刊上，論文標題為“The sequences of 150,119 genomes in the UK Biobank”。

這些作者在這15萬個基因組中發(fā)現(xiàn)了6億個單核苷酸多態(tài)性（SNP）和序列插入/缺失（indel），相當于人類基因組中理論上可能出現(xiàn)的那些SNP和indel的7%。然而，理論上可能出現(xiàn)的一些變體很可能與生命不相容。

這個龐大的數(shù)據(jù)集使這些作者能夠?qū)⒛切┠軌蛉萑绦蛄兄芯薮蠖鄻有缘膮^(qū)域與那些不能容忍巨大多樣性的區(qū)域分開。人們假設不耐受序列多樣性的區(qū)域?qū)θ祟惖纳婧蜕苤匾?。長期以來，人們一直認為編碼外顯子（coding exon）是對人類生存最重要的區(qū)域。然而，當對基因組中序列保守性最好的1%進行研究時，其中只有13%是編碼外顯子。

deCODE Genetics創(chuàng)始人、論文共同通訊作者Kari Stefansson說，“這種類型和數(shù)量的數(shù)據(jù)將徹底改變我們識別和表征對人類多樣性具有重要意義的基因間序列的能力，無論是對疾病風險和治療反應還是其他一些特性?！?/p>

英國生物庫中序列變異的突變類型。圖片來自Nature, 2022, doi:10.1038/s41586-022-04965-x。

此外，這些作者還報告了那些沒有通過全外顯子組測序確定的變體與疾病和其他表型之間的關(guān)聯(lián)性。

英國生物庫的參與者具有不同的遺傳血統(tǒng)，他們的祖先來自世界上的大多數(shù)國家。這些作者確定，85%的參與者可以將他們的大部分祖先追溯到不列顛群島。他們還發(fā)現(xiàn)有一大群參與者可以將他們的祖先大部分追溯到非洲和南亞。這項新的研究可能代表了最大的一組非洲和南亞血統(tǒng)的全基因組測序個體。然而，從社會和科學的角度來看，為這項新的研究以及其他已經(jīng)發(fā)表的研究提供序列的人的種族比例失衡是令人遺憾的。這些作者決心在未來努力實現(xiàn)更為種族平衡的測序隊列。（生物谷 Bioon.com）

參考資料：

Bjarni Halldorsson et al. The sequences of 150,119 genomes in the UK Biobank. Nature, 2022, doi:10.1038/s41586-022-04965-x.