鐵死亡（Ferroptosis）最早由哥倫比亞大學Dr. Brent R.Stockwell在2012年提出，是一種鐵依賴性的，區(qū)別于細胞凋亡、細胞壞死、細胞自噬的新型的細胞程序性死亡方式。鐵死亡的的本質(zhì)是谷胱甘肽的耗竭，谷胱甘肽過氧化物酶（GPX4）活性下降，脂質(zhì)氧化物不能通過GPX4催化的谷胱甘肽還原酶反應代謝，之后二價的鐵離子氧化脂質(zhì)產(chǎn)生活性氧，從而促使鐵死亡的發(fā)生。

    現(xiàn)在很多文章的套路都是先做差異表達分析，然后跟一個熱點的基因集合取個交集，然后再做后續(xù)分析。例如我們前面講過m6A相關的基因集

?m6a甲基化相關基因boxplot并顯示p值

或者看這個基因集里面的基因是否跟臨床信息相關

?m6a甲基化相關基因根據(jù)臨床信息分組繪制boxplot并顯示p值

除了m6A相關的基因集之外，小編還見過免疫相關的基因集，血管生成相關的基因集，細胞焦亡相關的基因集合，銅死亡相關的基因集合等等。

今天我們就來聊聊如何獲取鐵死亡相關的基因集合。FerrDb數(shù)據(jù)庫(http://www./ferrdb/current/)是廣州醫(yī)科大學附屬腦科醫(yī)院和四川大學生命科學學院，生物資源與生態(tài)環(huán)境教育部重點實驗室共同開發(fā)的，是人工收集管理的鐵死亡相關的標志物和調(diào)控因子以及鐵死亡關聯(lián)疾病的數(shù)據(jù)庫。截止到目前為止，該數(shù)據(jù)庫從PubMed數(shù)據(jù)庫下載了784篇關于鐵死亡的文章，并從中提取鐵死亡的調(diào)控因子和標志物以及相關疾病。數(shù)據(jù)庫在更新中。

這個數(shù)據(jù)庫根據(jù)基因與鐵死亡的關系劃分成了7大類，并且提供一次性的下載

可以根據(jù)研究需要下載相應類型的基因，也可全部下載下來再合并到一起。

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