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如何做好NRF2 ?

 優(yōu)寧維 2021-12-15

氧化應(yīng)激(Oxidative Stress,OS)由于活性氧(自由基)的產(chǎn)生和抗氧化防御之間的平衡紊亂,引起的組織損傷,可導(dǎo)致多種疾病,比如神經(jīng)系統(tǒng)(帕金森病、阿爾茨海默病)、心血管疾病(高膽固醇血癥和動(dòng)脈粥樣硬化、中風(fēng)、心肌梗塞等)、生殖系統(tǒng)疾病或自身免疫疾病等。

NRF2是在OS反應(yīng)中起關(guān)鍵作用的轉(zhuǎn)錄因子。在穩(wěn)態(tài)條件下,KEAP1結(jié)合 NRF2,并將其保留在細(xì)胞漿內(nèi),進(jìn)行泛素介導(dǎo)的降解,維持較低NRF2水平。少量組成型胞核 NRF2 通過(guò)調(diào)節(jié)抗氧化劑反應(yīng)基因的基礎(chǔ)表達(dá)來(lái)維持細(xì)胞穩(wěn)態(tài)。在OS后,KEAP1 釋放 NRF2,從而使激活劑轉(zhuǎn)位到細(xì)胞核與抗氧化反應(yīng)元件ARE 元件基因結(jié)合,導(dǎo)致細(xì)胞保護(hù)基因的表達(dá),比如GSH、HO-1、NADP(H)、NQO1等。


圖1 Nrf2與炎癥通路的調(diào)控(R. Wang,2020)

目前研究氧化應(yīng)激的老師很多,NRF2鑒于它的特殊性,是一個(gè)比較難檢測(cè)的指標(biāo)。那么在檢測(cè)NRF2前我們需要了解哪些信息呢?小優(yōu)整理了如下三點(diǎn):

01 WB檢測(cè)限-細(xì)胞中較高的蛋白水平

從HPA(The Human protein Atlas)可知NRF2的在各組織中的基因表達(dá)水平尚可,但在穩(wěn)態(tài)下NRF2的實(shí)際蛋白水平是很低的,不斷地經(jīng)過(guò)泛素-蛋白酶體途徑被降解。


圖2 NRF2在人源細(xì)胞系中的基因表達(dá)水平(HPA)


圖3泛素-蛋白酶體途徑

需要氧化應(yīng)激/親電子試劑(如圖4上,亞砷酸鹽50 μM,8 h,)處理導(dǎo)致(KEAP1) E3 泛素連接酶復(fù)合物失活,或者蛋白酶體抑制劑(如圖4下,MG132 10 μM,10 h)處理令其不被降解。


圖4 不同處理NRF2的蛋白表達(dá)情況(CST)

02 翻譯后修飾

根據(jù)Uniport可查到NRF2有多個(gè)翻譯后修飾 (PTM)。其中磷酸化Ser40和乙?;龠M(jìn)其核定位,并易位到核內(nèi)。糖基化阻止了小 Maf 蛋白的異二聚化,從而削弱轉(zhuǎn)錄因子活性。入核后,通過(guò)FN3K的去糖作用恢復(fù)活性,與Maf形成異二聚體,結(jié)合ARE發(fā)揮作用。


圖5 NRF2的幾種修飾和異二聚體的形成

03 NRF2條帶位置的爭(zhēng)議

由于抗體生產(chǎn)方面的原因,一直以來(lái)許多研究者認(rèn)為Nrf2是以預(yù)測(cè)的55-65 kDa 的分子量遷移,該預(yù)測(cè)是根據(jù) Nrf2 的開放閱讀框大小 2.2-kb 做出的。Alexandria Lau在2013年通過(guò)化學(xué)刺激、哺乳動(dòng)物過(guò)表達(dá)和重組蛋白表達(dá)提供了證據(jù),證明NRF2實(shí)際條帶應(yīng)該在95-110KD。此后各抗體供應(yīng)商們也糾正了這個(gè)錯(cuò)誤,目前標(biāo)注的實(shí)際條帶位置都在95-110KD。


圖6 Nrf2條帶位置的驗(yàn)證

在后續(xù)具體的WB實(shí)驗(yàn)中,我們可能會(huì)遇到無(wú)條帶、非特異帶、高背景或者條帶位置不對(duì)的情況。小優(yōu)細(xì)節(jié)君根據(jù)多年的經(jīng)驗(yàn)也整理出了一套解決方案。

a、無(wú)條帶:

可能原因:樣品未經(jīng)合適處理;降解或提取不充分;抗體不工作

b、非特異帶:

可能原因:樣品降解;同型或者修飾;多聚體;漂洗不充分;抗體非特異

c、高背景:

可能原因:樣品降解;試劑或操作污染;漂洗不充分;PVDF膜;抗體非特異

d、條帶位置不對(duì):

可能原因:樣品降解,膠濃度,抗體非特異

解決方案

a、設(shè)置陽(yáng)性對(duì)照,選擇合適的處理(MG132,氧化應(yīng)激)作為陽(yáng)性樣品;樣品新鮮制備;被Keap1釋放后入核,裂解時(shí)強(qiáng)烈建議超聲處理,或者用專門的核提取試劑盒;增加上樣量(細(xì)胞20μg,組織50-100μg);更換抗體。

b、新鮮制備樣品;同型/修飾換其他細(xì)胞樣品看看;存在異源二聚體,因此loading buffer中還原劑(0.6MDTT或者5%B-ME)要有效,可另外添加;加強(qiáng)漂洗,增加漂洗液中的NaCl 濃度(150mM-500mM)和Tween濃度(0.1-0.5%);更換抗體。

c、新鮮制備樣品;實(shí)驗(yàn)中試劑包括電泳液、轉(zhuǎn)膜液、漂洗液、脫脂奶粉、抗體稀釋液等用新鮮配制的,海綿也要洗干凈,濾紙換新的,操作時(shí)用鑷子夾邊緣不要用手觸摸,孵育時(shí)放平,不要彎曲導(dǎo)致孵育不均,膜干掉;加強(qiáng)漂洗,增加漂洗液中的NaCl和Tween濃度;使用NC膜背景會(huì)相對(duì)低點(diǎn);更換抗體。

d、新鮮制備樣品;使用梯度膠,排查問題時(shí)孵全膜;更換抗體。

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貨號(hào)

靶點(diǎn)

產(chǎn)品名稱

12721

NRF2

NRF2(D1Z9C)XP?Rabbit mAb

8047

KEAP1

KEAP1(D6B12)Rabbit mAb

43966

HO-1

HO-1(E3F4S)Rabbit mAb

8242

p65

NF-κB p65(D14E12)XP? Rabbit mAb

3033

p-p65

Phospho-NF-κB p65 (Ser536) (93H1) Rabbit mAb

5114

p62

SQSTM1/p62 Antibody

9242

IκBa

IκBa Antibody

2859

p-IκBa

Phospho-IκBu.(Ser32)(14D4)Rabbit mAb

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