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孫樂樂:從科學(xué)家到企業(yè)家,如何把握二代測序的“風口”?

 劉得光3p6n6zqq 2021-09-29

專訪視頻

“我最為自豪的,是有幸近距離和兩位諾獎級別導(dǎo)師交流?!泵鞔a生物科技總經(jīng)理孫樂樂在同寫意的專訪中,回想自己早年科研生涯時說。

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孫樂樂 博士  

明碼(上海)生物科技有限公司總經(jīng)理

1998年從中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)畢業(yè)后,孫樂樂赴美深造。她在亞利桑那大學(xué)讀了一年博士,隨后轉(zhuǎn)去麻省大學(xué)醫(yī)學(xué)院念生物化學(xué)。這也開啟一段被她戲稱為接連“旺導(dǎo)師”的經(jīng)歷。

 孫樂樂的博士生導(dǎo)師是張必良,后者如今成為廣州銳博生物的董事長;而當時的博士論文指導(dǎo)老師Craig Mello(克雷格·梅洛),因在RNA干擾機制方面的發(fā)現(xiàn),獲得2006年諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎。

 只花了四年時間博士畢業(yè),孫樂樂接著去到哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院,跟隨導(dǎo)師Jack Szostak(杰克·紹斯塔克)從事博士后研究。2009年,這位導(dǎo)師也成為諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎得主。 

“讀博士并不是說我的學(xué)歷有多高,而更多讓我積累相應(yīng)的科學(xué)素質(zhì),進而影響我用科學(xué)的思維去思考?!睂O樂樂認為,“兩位諾獎級導(dǎo)師看到的東西,不是普通實驗室所做的研究,他們目光高遠,理念先進,境界和常人比是很不一樣的?!?nbsp;

這樣的科學(xué)指引,最終把孫樂樂帶向產(chǎn)業(yè)界。她自言喜歡做一個引領(lǐng)者,雖然沒有繼續(xù)在校園中深造,但采訪中依舊能看到她身上的學(xué)術(shù)精神在傳承。 

供職于哈佛醫(yī)學(xué)院期間,孫樂樂每次向Jack Szostak就實驗問題求教,對方幾乎都能將整個實驗細節(jié)與步驟重現(xiàn)?!八牡雇颇芰Γ乙恢迸W(xué)習(xí),就像在我目前的工作中,當團隊遇到問題,尤其實驗過程難以解決的麻煩,我盡可能通過倒推去給予部分引導(dǎo)?!睂O樂樂補充說。

跨界產(chǎn)業(yè)“弄潮兒”,發(fā)掘新特長

孫樂樂投身產(chǎn)業(yè)的“第一站”,其實與博士后研究頗有淵源。 

Sanger測序時代,Applied Biosystems(ABI)一直是該行業(yè)的龍頭。無論早期的ABI 377抑或全自動化的ABI 3730XL,這些DNA測序儀被廣泛應(yīng)用于基因組學(xué)研究。但伴隨454 Life Sciences推出超高通量基因組測序系統(tǒng)Genome Sequencer 20 System并不斷對其優(yōu)化,固有格局在二代技術(shù)的興起下出現(xiàn)松動。

作為回應(yīng),2007年ABI將自研的SOLiD 測序儀投入使用,與Illumina及收購454 Life Sciences 的Roche等高通量測序平臺代表公司角力。

 “我的博士后研究與體外篩選相關(guān),當時我們正在做的油包水反應(yīng)器技術(shù)非常有意思,受到ABI的關(guān)注,后來我也因為這個契機進入ABI,深度參與二代基因測序SOLiD平臺的研究與開發(fā)?!睂O樂樂回憶道。使用SOLiD測序,要通過文庫制備得到大量的DNA雙鏈模板。而油包水PCR最大的特點,就是可以形成數(shù)目龐大的獨立反應(yīng)空間以進行DNA擴增。 

供職ABI的履歷,讓孫樂樂對高通量測序技術(shù)有了深入了解。由于當時實驗室里都是沒有外殼的“裸機”,她經(jīng)常需要手動操作內(nèi)部零件,積累了豐富的一線經(jīng)驗。 

2011年,孫樂樂帶著二代測序領(lǐng)域的一身學(xué)識,開始參與組建明碼生物科技。

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彼時,與化藥較為成熟的CRO市場相比,國內(nèi)基因領(lǐng)域的外包服務(wù)尚屬空白。孫樂樂以為,只需把在海外自己會做的實驗搬到國內(nèi)重復(fù)一遍,最后發(fā)現(xiàn),復(fù)制實驗是最簡單的事情,在此之外她要管理團隊,“考慮成本,考慮質(zhì)量和效率”這些研發(fā)科學(xué)家原本不去接觸的方面。 

不過,這似乎讓孫樂樂重新發(fā)現(xiàn)“特長”。 

“我非常擅長統(tǒng)籌安排,去調(diào)配先做什么、后做什么,”她半開玩笑地稱自己有“強迫癥”,希望每件事情都有序,“做一件事可能看不到我的優(yōu)勢,但如果同時做八件事,我可能是首先把八件事都完美完成的。所以感覺在新的崗位是一個轉(zhuǎn)變,對自己來說,好像更加了解我更擅長管理。” 

孫樂樂一度享受這種感覺,并帶領(lǐng)團隊用了不到半年時間,拿到中國首家CLIA測序?qū)嶒炇业恼J證,后者和CAP認證被視為臨床檢測行業(yè)質(zhì)量管理的最高標準。2015年,明碼生物科技正式成立后,孫樂樂逐漸從實驗室的運營管理,跨升到自2020年起負責明碼生物科技中國的所有運營。 

業(yè)績上,明碼生物科技去年的營收表現(xiàn),較孫樂樂加入的頭半年數(shù)額迅速增長至60倍。盡管如此,她卻也面臨時間上的緊迫感。 

“國內(nèi)行業(yè)的發(fā)展速度非常快,你要是差三個月,可能就差出一個天地來?!睂O樂樂頗為感慨,“明碼生物科技要保證營收是沒問題的,可基因測序行業(yè)目前的利潤非常低,盈利還是難題??赡芨嫌喂?yīng)商比較強勢有關(guān),但在我看來,更多的還是因為中間環(huán)節(jié)各個服務(wù)商間的競爭缺乏有序的環(huán)境來指引,甚至有時候形成惡性循環(huán)?!?nbsp;

行業(yè)的現(xiàn)狀是嚴峻的,孫樂樂因此并不期待能通過技術(shù)突破把利潤短板補上,因為這種突破“不是短時間能形成的”,短期內(nèi)“靠著非常有力的管理去控制經(jīng)營成本”,長期看“只能依賴企業(yè)的遠景和規(guī)劃”。 

如此背景下,她更傾向于保守的打法:把自身核心能力做好,技術(shù)穩(wěn)步前推,等“浪潮”一來,有準備和積累的公司就一定能翻上去。

信息化破局,打造明碼“生態(tài)圈”

以時間維度看,華大基因可謂國內(nèi)提供二代測序的“元老級”機構(gòu),此后逐漸出現(xiàn)貝瑞和康、諾禾致源、邁基諾等一眾創(chuàng)業(yè)公司。然而,孫樂樂覺得,真正將各家區(qū)分開的并非技術(shù),而是從2016年前后的商業(yè)化方向。 

“貝瑞和康趕上NIPT(無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測)那一波浪潮,借此實現(xiàn)上市;諾禾致源集中深耕科研服務(wù),在4月也成功登陸上交所。明碼生物科技的優(yōu)勢在于服務(wù)藥廠,我們的平臺和體系都是圍繞藥廠業(yè)務(wù)搭建的,本身帶有這樣的理念?!睂O樂樂進一步解釋。 

眾所周知,基因是遺傳物質(zhì)的基本單位,通常能在代際實現(xiàn)穩(wěn)定延續(xù)。隨著生命科學(xué)的發(fā)展,業(yè)界已發(fā)現(xiàn)許多基因?qū)τ诩膊【哂兄匾绊懀绕涫腔蛲蛔?,往往成為相關(guān)疾病的“導(dǎo)火索”。而反過來說,如果能對基因的變異情況進行監(jiān)控,則有利于為早期干預(yù)與治療提供窗口期。 

這便是孫樂樂預(yù)期的“基因體檢”:比如身體尚未出現(xiàn)病灶,或者病灶太小以致無法用X光、CT等常規(guī)檢測方法發(fā)現(xiàn),但微量的基因突變可能已經(jīng)在血液里循環(huán),此時可通過液態(tài)活檢找到問題。 

“我的vision就是,基因測序未來一定會成為常態(tài)?!睂O樂樂用核酸檢測進行對比,“就像這次新冠疫情,讓我們以科學(xué)的方式認識了核酸檢測的作用。其實核酸是遺傳物質(zhì)的化學(xué)名字,而基因是功能單位,我相信以后去到醫(yī)院看病,醫(yī)生可能會開兩個檢查,一個是血常規(guī),另一個是基因檢測,這是精準醫(yī)學(xué)的大趨勢。” 

為了把握這個“風口”,當前明碼生物科技正積極推進傳統(tǒng)業(yè)務(wù)的信息化轉(zhuǎn)型,“明碼測序商城”就是布局代表之一。 

按照孫樂樂的設(shè)想,“明碼測序商城”就像一個基因測序領(lǐng)域的“淘寶商城”,用戶可以方便地在上面找到任何想要的基因測序服務(wù)。出于隱私及合規(guī)考慮,明碼“測序商城”前期暫不面對個人開放,而主要服務(wù)兩類用戶,即科研機構(gòu)和生物技術(shù)研發(fā)公司。 

“想法落地后,明碼生物科技就變成了平臺和工具,”她補充道,“因為測序很貴,一臺頂尖的高通量測序儀可能要100萬美元,雖然平均單位成本比較低,可當你沒那么多量去攤薄時,這還是一個很大的負擔,就如同飛機的造價很貴,一個人難以承擔包機費用,大家合在一起買機票的時候,成本就容易控制,并且還可以提前預(yù)期班次,其中的道理和我們的信息化平臺是相通的。” 

此外,明碼生物科技預(yù)計今年能夠?qū)崿F(xiàn)測序信息的全流程管理。孫樂樂觀察,現(xiàn)有的基因測序服務(wù)商大都依賴紙質(zhì)文件,而尚未很好地做到電子化和數(shù)據(jù)信息化。她相信,倘若把基因測序與信息技術(shù)相結(jié)合,這將是“沒有想象邊界”的事情。 

十分明顯,孫樂樂的愿景很難憑借一己之力完成。事實上,明碼生物科技也正不斷與行業(yè)上下游公司達成相關(guān)探索。 

今年3月,新格元和明碼生物科技剛剛簽署戰(zhàn)略協(xié)議。雙方將借助優(yōu)勢互補,共同為精準醫(yī)學(xué)提供全面的單細胞多組學(xué)技術(shù)服務(wù),從項目設(shè)計、能力構(gòu)建,到測序服務(wù)、數(shù)據(jù)分析、生物學(xué)注釋,直至臨床測試和伴隨診斷,加速疾病研究、推動藥物研發(fā)。 

明碼生物科技的落地能力還體現(xiàn)在過去幾年的國際化合作中。2014年,孫樂樂帶領(lǐng)團隊率先從Foundation Medicine引進國際最高標準的腫瘤大panel檢測業(yè)務(wù),開始規(guī)劃基因組測試服務(wù)布局。 

而去年疫情期間,明碼生物科技成為Olink在中國大陸地區(qū)唯一指定的第三方服務(wù)商?!癘link的蛋白生物標志物檢測技術(shù)獨到,可以推動明碼生物科技向多組學(xué)服務(wù)發(fā)展?!睂O樂樂最后補充說。

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關(guān)于明碼生物科技

明碼生物科技是中國多組學(xué)研究領(lǐng)域的引領(lǐng)者,承接基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白組學(xué)等相關(guān)業(yè)務(wù),致力于運用高品質(zhì)數(shù)據(jù)和應(yīng)用產(chǎn)品服務(wù)于精準醫(yī)學(xué),改善人類健康。

明碼生物科技擁有國際標準化組織 ISO15189 認證的實驗室,作為一體化基因研發(fā)應(yīng)用和賦能平臺,支持云端及線下使用。

明碼生物科技立足于中國上海及周邊地區(qū),為科研機構(gòu)、制藥公司和醫(yī)療機構(gòu)提供全方位的多組學(xué)研究和精準醫(yī)學(xué)應(yīng)用的整體解決方案,并助力合作伙伴推動疾病發(fā)病機制的基礎(chǔ)研究、加速藥物研發(fā)和診斷試劑開發(fā),現(xiàn)已在遺傳罕見病、輔助生殖、病原宏基因、腫瘤檢測等臨床應(yīng)用場景樹立多個品牌。


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