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常見的三種蛋白定量法,你用的哪一種?

 生物狗在求救 2021-07-19
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蛋白質(zhì)作為生命活動的物質(zhì)基礎(chǔ)之一,也是生命活動的主要承擔(dān)者,是科研工作中的重要研究對象。而在這些精細(xì)化研究工作中,測定蛋白濃度,定量實(shí)驗(yàn),是探索蛋白生物學(xué)功能不可或缺的一個(gè)環(huán)節(jié)。依托不同的科學(xué)原理,目前已經(jīng)發(fā)展出多種不同的蛋白測定方法,其中BCA法、Bradford法和UV法在科研實(shí)驗(yàn)中應(yīng)用最為廣泛,不過三種方法之間各有千秋,小P今天就和大家一起盤點(diǎn)盤點(diǎn)~

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01

BCA法

理:BCA (Bicinchoninic acid,2,2-聯(lián)喹啉-4,4-二甲酸二鈉),與含二價(jià)銅離子的硫酸銅組成BCA檢測試劑(商業(yè)試劑盒中,堿性的BCA混合溶液與硫酸銅溶液分別包裝,標(biāo)記為A液和B液,二者在實(shí)驗(yàn)前比例混合,溶液呈綠色),在堿性條件下,二價(jià)銅離子可被蛋白質(zhì)還原成一價(jià)銅離子,一價(jià)銅離子能夠與BCA相互作用,兩分子BCA鰲合一個(gè)銅離子,形成穩(wěn)定的紫色復(fù)合物,在562nm處顯示強(qiáng)吸光性。在一定濃度范圍內(nèi),復(fù)合物的光密度與蛋白質(zhì)含量呈線性關(guān)系,通過酶標(biāo)儀或者分光光度計(jì)以標(biāo)準(zhǔn)品蛋白做標(biāo)準(zhǔn)曲線,隨后檢測靶標(biāo)蛋白562nm波長處的吸光值,即可換算出靶標(biāo)蛋白濃度。

點(diǎn)BCA法作為已知最靈敏的檢測方法之一,靈敏度高,普通BCA試劑盒檢測范圍為20-2000μg/ml,增強(qiáng)型BCA試劑盒最低檢測濃度可到0.5μg/ml,檢測范圍廣且線性穩(wěn)定;同時(shí)該方法操作較為便捷,正常情況下可在45分鐘內(nèi)完成測定;不過由于反應(yīng)中涉及“氧化”和“螯合”兩個(gè)過程,BCA法檢測結(jié)果會受到還原劑(如DTT,巰基乙醇等)、金屬離子螯合劑(如EDTA等)干擾,不易受表面活性劑(Triton X-100、SDS等)影響。

02

Bradford法

原理:Bradford法也稱作考馬斯亮藍(lán)法(Bradford為發(fā)明人),考馬斯亮藍(lán)G250(Coomassie brilliant blue G250),是一種甲基取代的三苯基甲烷,每分子包含兩個(gè)SO3-H基團(tuán),呈酸性,該磺酸基團(tuán)能夠通過范德華力與蛋白質(zhì)的堿性基團(tuán)結(jié)合形成穩(wěn)定的染料-蛋白復(fù)合物,在595nm波長處有最大吸收峰,游離考馬斯亮藍(lán)G250溶液呈現(xiàn)棕紅色,與蛋白反應(yīng)之后變成藍(lán)色;并且在一定濃度范圍內(nèi),復(fù)合物的光密度與蛋白質(zhì)含量呈線性關(guān)系。通過酶標(biāo)儀或者分光光度計(jì)以標(biāo)準(zhǔn)品蛋白做標(biāo)準(zhǔn)曲線,隨后檢測靶標(biāo)蛋白595nm波長處的吸光值,即可換算出靶標(biāo)蛋白濃度。
特點(diǎn):Bradford法作為另一種最靈敏的檢測方法,其靈敏度同樣可以達(dá)到微克級別;并且僅需一種反應(yīng)試劑即可完成檢測,操作十分便捷;同時(shí)考馬斯亮藍(lán)染料與蛋白樣本結(jié)合所需時(shí)間極短,2分鐘即可形成穩(wěn)定復(fù)合物,完成一次檢測耗時(shí)僅需幾分鐘。但是,由于蛋白-染料穩(wěn)定復(fù)合物之間是分子間作用力,故Bradford法會受到表面活性劑(Triton X-100、SDS等)干擾,除此之外,不同靶標(biāo)蛋白中堿性氨基酸(范德華力作用)以及芳香族氨基酸(疏水作用)含量不一,對考馬斯亮藍(lán)的結(jié)合能力差異較大;而且隨著蛋白濃度增加,線性關(guān)系會出現(xiàn)偏差。因此Bradford法與BCA法一樣,也是一種不完美的檢測手段。

[延伸]:檢測蛋白濃度的考馬斯亮藍(lán)和染色PAGE膠的考馬斯亮藍(lán)不是同一種物質(zhì),前者采用考馬斯亮藍(lán)G250,后者采用考馬斯亮藍(lán)R250,G250和R250分子基本骨架一樣,但是G250多了兩個(gè)甲基,與蛋白反應(yīng)迅速,染膠慢且脫色困難,故用于蛋白定量;R250與蛋白反應(yīng)較緩慢,染膠較快且易于洗脫,故用于PAGE膠染色。

03

UV法(NanoDrop)

原理:UV法即紫外分光光度法,蛋白質(zhì)分子中的芳香族氨基酸,包括色氨酸、賴氨酸、苯丙氨酸,含有可以吸收紫外光的共軛雙鍵,最大吸收峰在280nm波長處,且在此波長內(nèi)吸收峰的光密度值與其濃度成線性關(guān)系。通過分光光度計(jì)檢測靶標(biāo)蛋白280nm波長,即可根據(jù)Beer-Lambert定律(A=E*C*l;A代表吸光度,E代表消光系數(shù),C代表蛋白質(zhì)濃度,l代表光徑長度,其中消光系數(shù)可以根據(jù)蛋白質(zhì)序列估測)換算出靶標(biāo)蛋白的濃度。
點(diǎn)相較于上述兩種檢測手段,UV法一個(gè)最大的優(yōu)勢就是不用額外添加檢測試劑,因此待測樣本是可以回收利用的,不影響活性;這也使得UV法具有無與倫比的便捷性和高效性,通過Nanodrop等儀器,我們甚至可以在幾秒內(nèi)直接讀出一個(gè)蛋白樣本的濃度;UV法檢測的靈敏度同樣可以達(dá)到微克級別。
UV法優(yōu)勢明顯,缺點(diǎn)也極為突出。由于不同蛋白有不同的酪氨酸和色氨酸含量,對紫外光的吸收能力不同,故要準(zhǔn)確測量,必須要有待測蛋白質(zhì)或其它蛋白的純品作標(biāo)準(zhǔn)品參考;其次,很多化合物在280nm處有吸光值,對實(shí)驗(yàn)結(jié)果造成干擾,其中核酸影響尤為嚴(yán)重,核酸最大吸收峰在260nm處,故溶液中可能存在核酸時(shí),必須同時(shí)測定OD260和OD280,然后根據(jù)兩種波長的吸收度的比值,通過經(jīng)驗(yàn)公式校正,以消除核酸的影響 。(一般常用Lowry-Kalcker公式:C(Protein)(mg/ml) = 1.45 * A280 - 0.74 * A260,或者Warburg-Christian公式:C(Protein)(mg/ml) =  1.55 * A280 - 0.76 * A260,來估算蛋白濃度。)

參考文獻(xiàn):

1. 周躍男,王湛等.淺談蛋白質(zhì)含量的定量檢測方法[J].食品研究與開發(fā),2014.

2. 范雙雙,李正平.幾種檢測蛋白質(zhì)濃度方法的比較[N].承德民族師專學(xué)報(bào),2004

3. 范華杰,李聞捷.蛋白質(zhì)定量方法的合理應(yīng)用[J].中華國際醫(yī)學(xué)雜志,2003.
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通過以上對比我們不難發(fā)現(xiàn),對于蛋白濃度測定,目前依舊沒有一個(gè)完美的解決方案。BCA法受還原劑、螯合劑干擾;Bradford法受表面活性劑、蛋白差異干擾;UV法受氨基酸組成干擾、核受酸影響,每一種方法都有自身的優(yōu)勢和缺陷,因此針對同一樣本采用不同的方法進(jìn)行檢測,檢測結(jié)果也可能出現(xiàn)偏差。所以我們在使用時(shí),應(yīng)當(dāng)根據(jù)實(shí)驗(yàn)條件挑選最合適的檢測方法,這樣實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)才會更可靠!

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以上就是三種常用蛋白定量方法差異盤點(diǎn),

各位勤勞的科研園丁,

不知道你采用的是哪一種呢?

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