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【醫(yī)伴旅】識(shí)別急性髓細(xì)胞白血病患者癌細(xì)胞的新測序方法

 醫(yī)伴旅 2021-04-27
急性髓細(xì)胞白血病是一類異質(zhì)性較高的血液腫瘤,是癌癥干細(xì)胞研究的范式,治療后極易復(fù)發(fā),復(fù)發(fā)后再次治療失敗率較高,需要了解每個(gè)急性髓細(xì)胞白血病患者的分子遺傳學(xué)信息并進(jìn)行個(gè)體化治療;但是癌癥干細(xì)胞分裂率較低,難以作為治療的靶點(diǎn),因此找到一種識(shí)別癌癥干細(xì)胞的方法尤為重要。
 
《自然-通訊》中發(fā)表了一篇論文,文中闡述了一種名為MutaSeq的新型單細(xì)胞多基因測序方法,研究人員用其識(shí)別急性髓細(xì)胞白血病患者的白血病干細(xì)胞和癌癥干細(xì)胞,另外研究人員指出該方法也可能適用于其他類型腫瘤細(xì)胞的識(shí)別。


MutaSeq測序法由來自基因組調(diào)節(jié)中心和歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的研究人員發(fā)明,用于區(qū)分白血病前干細(xì)胞、白血病干細(xì)胞和健康造血干細(xì)胞。
 
“雖然許多小分子藥物已被證實(shí)具有臨床安全性,但判斷某類藥物更適合哪些癌癥,尤其是更適合哪些患者卻并不容易”,該論文作者斯坦福大學(xué)Lars Steinmetz教授在一次新聞發(fā)布會(huì)上表示?!拔覀?/span>發(fā)明的MutaSeq測序法可以識(shí)別那些尚未針對急性髓細(xì)胞白血病患者進(jìn)行測試的藥物靶標(biāo),后續(xù)我們會(huì)逐步開展臨床對照試驗(yàn)來進(jìn)行此類測試?!?/span>
 
MutaSeq測序法通過同時(shí)測量成千上萬個(gè)核糖核酸來確定單個(gè)細(xì)胞是否為干細(xì)胞,之后聯(lián)合其它測序確定該干細(xì)胞是健康還是發(fā)生了癌變。收集這些數(shù)據(jù)有助于研究團(tuán)隊(duì)跟蹤干細(xì)胞是癌性的還是健康的,以便其研究促使癌細(xì)胞種類多樣的原因。
 
雖然大多數(shù)癌變組織的細(xì)胞快速分裂能力不強(qiáng),但癌癥干細(xì)胞能夠無限復(fù)制,導(dǎo)致癌癥的長期發(fā)展及復(fù)發(fā)。具體來說,白血病干細(xì)胞是引起急性髓細(xì)胞白血病復(fù)發(fā)并導(dǎo)致死亡的潛在驅(qū)動(dòng)因素,但由于其數(shù)量少,因此難以分離單個(gè)細(xì)胞。
 
試驗(yàn)中,研究人員發(fā)現(xiàn)MutaSeq測序法增加了每個(gè)細(xì)胞覆蓋的靶位點(diǎn)的數(shù)量,與Smart-seq2方法相比,其精度更高,提供了更好的基因組靶位點(diǎn)的覆蓋,并且獲得了較高質(zhì)量的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)
 
“核糖核酸在蛋白質(zhì)合成過程中傳遞遺傳數(shù)據(jù),對人類健康至關(guān)重要。例如,通過聚合酶鏈反應(yīng)技術(shù)(PCR)檢測冠狀病毒的核糖核酸,能夠診斷COVID-19,隨后的測序可確定病毒是否變異”,論文作者Lars Velten解釋說。MutaSeq測序的作用類似于冠狀病毒的PCR檢測,不同的是MutaSeq測序更復(fù)雜,且研究人員需要對細(xì)胞單個(gè)分離后進(jìn)行研究?!?/span>
 
諸如MutaSeq之類的單細(xì)胞測序方法越來越流行,常用于協(xié)助研究團(tuán)隊(duì)收集和解釋全基因組數(shù)據(jù)。借助MutaSeq測序法,研究人員可使用復(fù)雜的組織和癌癥來繪制詳細(xì)的分子譜。
 
“我們的研究團(tuán)隊(duì)包括來自德國和西班牙的醫(yī)學(xué)專家,后續(xù)會(huì)開展大型臨床研究,以便完善和簡化MutaSeq測序法”,Velten表示。“我們希望能夠以個(gè)體化的方式識(shí)別癌癥干細(xì)胞藥物靶標(biāo),使醫(yī)生能夠像檢測冠狀病毒一樣為患者尋找治療癌癥的方法?!?/span>
 

參考資料

https://www./view/new-single-cell-sequencing-method-effective-in-distinguishing-between-healthy-and-cancerous-cells-in-aml

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