益生菌，又稱為益生素、微生態(tài)制劑或活菌制劑，指有利于維持腸道內(nèi)的微生態(tài)平衡的微生物及其代謝產(chǎn)物，其可通過進(jìn)入并定植于宿主的消化道，促進(jìn)腸道有益微生物的繁殖，抑制有害微生物生長(zhǎng)，調(diào)節(jié)宿生腸道菌群平衡，從而改善宿主的健康。

益生菌對(duì)宿主的作用屬于生物修復(fù)的范疇，因此，益生菌應(yīng)具備以下條件：（1）必須對(duì)宿主無(wú)害；（2）被宿主攝入后，可定植于消化道內(nèi)并發(fā)揮作用；（3）在人工感染的實(shí)驗(yàn)中，必須能提高宿主的抵抗力。

光合細(xì)菌，屬于厭氧或兼性厭氧性的光能異養(yǎng)菌。在光照條件下，光合細(xì)菌能利用小分子有機(jī)物合成自身生長(zhǎng)繁殖所需要的各種養(yǎng)分，增加水體溶氧，還能利用水環(huán)境中的氨氮、硝酸鹽、亞硝酸鹽等合成有機(jī)氮化物，凈化水質(zhì)；在缺氧條件下，光合細(xì)菌對(duì)硫化氫、酸性物質(zhì)等均有一定的分解作用。此外，光合細(xì)菌可以產(chǎn)生抗病毒因子等生物活性物質(zhì)，具有獨(dú)特的抗病、促生長(zhǎng)功能，大大提高了水產(chǎn)動(dòng)物的生產(chǎn)性能。

芽孢桿菌，是一種可形成芽孢的好氧革蘭氏陽(yáng)性菌，具有耐酸、耐鹽、耐高溫、快速?gòu)?fù)活和可分泌多種能降解有機(jī)物的酶類（蛋白酶、淀粉酶、脂肪酶）等特點(diǎn)，不僅能有效抑制宿主腸道有害病菌生長(zhǎng)，提高機(jī)體抗病能力，還可直接利用水體中的硝酸鹽和亞硝酸鹽，分解池底有機(jī)物，降低養(yǎng)殖水體富營(yíng)養(yǎng)化程度，優(yōu)化水體環(huán)境。常見的有枯草芽孢桿菌、地衣芽孢桿菌、短小芽孢桿菌等。

乳酸菌，屬于厭氧或兼性厭氧菌，能夠分解碳水化合物，主要代謝產(chǎn)物為乳酸，可降低腸道pH值，抑制腸道不耐酸厭氧病原菌繁殖，維持腸道微生態(tài)平衡，還可合成短鏈脂肪酸和B族維生素，中和毒性產(chǎn)物，抑制氨和胺的合成，增強(qiáng)機(jī)體免疫力。

酵母菌，是一種單細(xì)胞真菌，屬于兼性厭氧菌，在有氧的情況下，它把糖分解成二氧化碳和水，且酵母菌生長(zhǎng)較快。在缺乏氧氣時(shí)，發(fā)酵型的酵母通過將糖類轉(zhuǎn)化成為二氧化碳和乙醇（俗稱酒精）來(lái)獲取能量。酵母菌適宜生長(zhǎng)在多糖偏酸環(huán)境中，體內(nèi)富含蛋白質(zhì)和多種B族維生素，不耐熱。酵母及其培養(yǎng)物可有效地改善胃腸內(nèi)環(huán)境和菌群結(jié)構(gòu)，促進(jìn)營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)消化吸收，抑制病原菌繁殖，提高機(jī)體抗病能力，提高水產(chǎn)動(dòng)物品質(zhì)，是一種綠色飼料添加劑。

蛭弧菌，是一類非常微小的寄生型革蘭氏陰性細(xì)菌，主要通過粘附、攻擊、侵染、裂解其他細(xì)菌的方式使自身得以生長(zhǎng)繁殖，有類似噬菌體的作用。其能夠裂解大多數(shù)科屬革蘭氏陰性細(xì)菌，并對(duì)許多的致病菌都有良好的裂解活性。目前分離的噬菌蛭弧菌菌株對(duì)pH、溫度等環(huán)境因子的要求并不嚴(yán)格，其噬菌條件范圍一般為pH6.5-8.6和4℃-37℃。

硝化細(xì)菌，是指利用氨或亞硝酸鹽作為主要能源以及能利用二氧化碳作為主要碳源的細(xì)菌，屬于化能自養(yǎng)型細(xì)菌，可分為亞硝化細(xì)菌和硝化細(xì)菌兩大類群。硝化細(xì)菌在氮的循環(huán)中將亞硝酸鹽轉(zhuǎn)化為硝酸鹽而被藻類利用，從而起到凈化水質(zhì)的作用。