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作者:Jack,MedEditing LLC, USA 根據 世界衛(wèi)生組織(WHO)于2019年10月17日發(fā)布的《2019年全球結核病報告》,2018年全球結核病發(fā)病率為130/10萬人,新發(fā)病患者有1000萬。 中國CDC對此報告做了系統(tǒng)總結,顯示全球新發(fā)病例的87%集中在30個國家,2/3新發(fā)病例集中在8個國家。就發(fā)病人數來說,印度新發(fā)病例占全球的27%,中國新發(fā)病例占全球的9%列第二位。由此估計中國的結核病新發(fā)患者數為86.6萬(對比,2017年88.9萬),估算結核病發(fā)病率為61/10萬。 更為嚴重的是結核耐藥性。全球估算利福平耐藥結核病患者數約為48.4萬,其中耐多藥結核病患者約占78%。 高發(fā)病率和高耐藥性,導致了結核病持續(xù)列在全球前10位致死原因中。2018年全球估算結核病死亡數約為124萬,死亡率為16/10萬。其中中國的結核病死亡數為3.7萬,結核病死亡率為2.6/10萬。 (主要致死原因。來源:中國CDC) 面對臨床重要而未解決的問題,一個系統(tǒng)的大數據分析很有必要。這里我們拋磚引玉,有不妥之處,還請業(yè)內專家指正。 檢索詞: tuberculosis[ti] 檢索數據庫:Medline 檢索工具:文獻鳥 檢索報告主要分為三部分: 第一部分是big analysis(大數據分析),也就是對發(fā)表論文的宏觀分析,包括發(fā)表年度、國家/地區(qū)、雜志、作者、關聯領域、最常發(fā)表的雜志等等。 第二部分是citation network,是已經發(fā)表論文的被引用情況。我們都知道,論文的價值體現在被閱讀和借鑒,并通過被引用次數體現出來。所發(fā)表影響因子越高、及被引用越多,則該論文被定義為越有影響力的論文。 第三部分是美國國立衛(wèi)生研究院立項初檢結果。NIH除了有最龐大的科研院所之外,還負責管理生物醫(yī)學領域的科研立項。 下面依次展開。 第一部分: 結核病研究論文 大數據分析。 最近1萬篇文獻的 發(fā)表時間和國家分布圖 (論文的時間和國家分布) 時間分布顯示,針對結核病研究 , 目前已發(fā)表140,050篇SCI,其中納入到分析的有10,000篇,集中在2017 - 2020年;所以本推文分析也主要基于最近三年的論文。 總體看,結核病研究受到持續(xù)關注,熱度值為45 。 國家分布可以看到,中國發(fā)表的結核病論文數量僅次于美國,居第二位;印度、南非、法國和澳大利亞分列第三到六位。 結核病領域 發(fā)文最多學術機構排名 (發(fā)表論文的機構排名) 可以看到開普敦大學(南非)、Stellenbosch大學(南非)和首都醫(yī)科大學(中國)分列論文發(fā)表數量的前三名。 繼續(xù)查看結核病研究相關的 熱點基因和相關疾病 (研究熱點基因和課題) INHA、CD4、PIGS、TLR2、TLR4等是結核病研究中最受關注的基因;而結核、HIV、糖尿病、菌株以及預防等是與結核病最相關的關鍵詞/研究熱點。 上述列表對于選題有非常好的參考價值。 發(fā)表結核病 最多的雜志 (發(fā)表論文的雜志分布) 發(fā)表結核病相關研究最多的雜志中依次是: Int J Tuberc Lung Dis (IF 2.0) , PLoS ONE (IF 2.8) , BMC Infect Dis (IF 2.6), Sci Rep (IF 4) 、Tuberculosis (IF 2.8)。 雜志后面附有影響因子,參考這個排名及影響因子,對于投稿有非常強的參考價值。 結核病研究領域 知名學者學術圈, 及其關系網。 (最知名學者及其關系網) 本編輯對這個領域不是很熟悉,但根據本圖可以看到,最近三年中,領域內最重要的學者包括英國的Zumla, Alimuddin、加拿大的Menzies, Dic、意大利的Migliori, Giovanni Battista、澳大利亞的Fox, Greg J、美國的Furin, Jennifer等。 通過這個網絡,可以看到Zumla(英國) - Migliori(意大利) - Furin(美國)等是連接在一起的,占前五名的3/5;并且這個圈子里面的大牛還有Marks, Guy B, Dheda, Keertan等。如果拖動其中的任何一位,幾乎一半的學者都會被牽動。 如上圖所示,如果拉動Migliori向左,則將近一半的最知名學者被拉過 來。 不僅陷入沉思。這個對結核病研究貢獻最多的學者圈中幾乎沒有中國學者,是由于中國學者做的不好、還是因為沒有進入到這個圈子? 下面的進一步分析可能會給出答案。 上面關系網中的學者, 是怎么篩出來的呢? 是基于學者在該領域的 論文影響因子總分。 (最知名學者排名) 與網絡圖中的學者相對應,按照影響力展示學者排名??梢钥吹剑?strong>結核病研究領域最活躍的前十位學者,基本上都是英國、美國、意大利、澳大利亞、加拿大等發(fā)達國家,另外看到南非的學者。 可是這些最知名學者所在國家,結核病的發(fā)病極低,比如筆者所在的美國,新生兒都不打卡介苗。他們是如何完成針對結核病的臨床研究的? 我們一起學習這些專家的貢獻。 第一位,英國的Zumla, Alimuddin,共發(fā)表了21篇SCI論文,大都在柳葉刀雜志主要側重于結核病治療方案的研究。 第二位,加拿大的Menzies, Dic,發(fā)表了21篇SCI論文,主要關注結核耐藥菌的研究。 ![]() 第三位,意大利的Migliori, Giovanni Battista,發(fā)表了37篇SCI論文,主要側重結核病治療方案的優(yōu)化。 ![]() 第四位,澳大利亞的Fox, Greg J,發(fā)表了8篇SCI論文,側重于結核病的預防。 ![]() 第五位,美國的Furin, Jennifer,發(fā)表16篇論文,側重兒童結核病的防治。 ![]() 除了這五位專家,我們還特意關注了南非開普敦大學的Tait, Derech R。這位教授只發(fā)表了3篇論文,但是都在新英格蘭醫(yī)學雜志。其研究領域是針對結核桿菌的新型疫苗。 根據這個大數據分析,在短時間內對結核病的熱點和知名研究機構和學者都有了系統(tǒng)的了解。 尤其是,我們看到,這些最知名的專家,大都是在某一個領域做了非常深入和長時間的研究,從而在那個領域領先于其他研究組。并且這些專家盡管相互之間有合作和交際,但是他們的研究注意力顯然完全不同,各領風騷。 要想通曉一個領域、尤其是最新進展,經典和重要論文是必讀的。 第二部分: 找到結核病 最近一階段最有影響的論文。 通過“citation network”功能, 可以看到所有10,000篇文獻的分布。 每個點都是一篇文獻, 左邊的是最早發(fā)表的; 點的大小代表著這篇論文的影響力,即被引用次數。 ![]() (被引用排名) 我們看看領域內前1%的論文。 有了這些, 新人就容易知道, 開題報告或基金申請書的立項依據部分, 或論文的前言和討論部分, 該讀和該引哪篇文章了。 ![]() 而順著論文關系網, 你也更容易捋清這些研究的承接圖, 對于自己設計課題非常重要。 如果點擊任何一篇文獻,都會出現該文獻的信息。 還可以通過列表讀到 這些經典論文的具體細節(jié); 論文按照影響力排列。 ![]() ![]() (名單很長,只列出被引用最有影響力的論文排名) 為了解學者們最關心哪些研究,我對前幾位部分論文的摘要做了查看。 尤其是前0.1%的新論文, 是必讀論文, 即領域內最重要的論文。 第一篇 是來自于南非和英國的聯合研究,研究了耐藥情況下結核病人的治療。 ![]() 第二篇 由南非、美國和丹麥的學者共同完成,研究了新的結核疫苗。 ![]() 第三篇 則是由法國、烏干達、柬埔寨、越南、英國等聯合完成,研究了合并艾滋病的結核病人的治療方案。 ![]() 第四篇 由南非、英國、贊比亞、瑞士、美國等國聯合完成,研究了新型疫苗。通訊作者是Trait, Dereck。 ![]() 第五篇 主要由澳大利亞和越南合作完成,這是一項RCT臨床試驗,研究了結核病的家庭感染及預防。 ![]() 由此,我們可以看出,這些研究大都是國際合作項目,尤其是發(fā)達國家和發(fā)展中國家的合作。 這也部分解釋了前面我們提到的問題,合作是發(fā)展的重要基礎。 第三部分: 研究動態(tài)實時更新 了解了結核病最知名學者、研究機構,也知曉了領域內的經典論文及其發(fā)表雜志,頓時感覺“腹有詩書氣自華”,腰板挺直了很多。 但是,這些只是存量知識。而未來需要創(chuàng)造。知識的實時更新,及時獲得最新研究進展非常重要。 ![]() 可以直接查到 NIH資助的基金。 ![]() (NIH在研課題檢索) 對于美國資助的結核病課題的大數據分析,我們后面會做過專門的分析。 總結: 通過大數據分析,獲取了結核病領域的研究熱點領域和基因、研究機構和知名專家,這些研究發(fā)表的雜志,以及該領域的經典論文和美國NIH資助課題情況。 不僅有助于快速系統(tǒng)了解該領域,對于課題選題及課題設計、選取合適的投稿雜志都提供了非常有價值的參考。 1)在最近的3年時間里,就已經有1萬多篇SCI論文發(fā)表; 2)就單一機構來說,中國的首都醫(yī)科大學發(fā)表的SCI總數第三; 3)最具影響力學者中,我們沒有看到中國學者 。 4)最具影響力十篇論文中,也沒有看到中國學者 的研究; 5)在結核病研究領域,幾乎所有最有影響力的研究都是通過廣泛的國際合作完成的;這也部分解釋了我們看到,有一組學者關系非常密切,幾乎占到了最知名學者中的一半; 6)作為嚴重危害國人健康但遠未解決的疾病,中國仍需要加強在結核領域的研究投入,尤其是創(chuàng)新性研究 。 7)參與到國際合作,可能會是快速提示中國在結核病領域研究水平,并逐漸由跟跑到領跑的捷徑。 透過數據,我們可以看到結核病研究的活力和熱度;我們更看到,在這個最重要的疾病研究中,中國學者雖然沒有缺席,卻離應有的領導作用相差甚遠。 作者簡介: Jack,MD, PhD,美國恒祥咨詢公司,主要從事臨床科研大數據分析。 本文中提供的分析結果大部分是收費項目,但注冊后每天都可以收到自己感興趣課題發(fā)表的SCI論文,自帶中文翻譯哦。 編輯:Henry,圖片來自于網絡,版權歸原作者所有。 |
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