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術(shù)語(yǔ) · CIBERSORT Newman等開(kāi)發(fā)的分析工具,使用基因表達(dá)數(shù)據(jù)來(lái)估計(jì)混合細(xì)胞群體中成員細(xì)胞類(lèi)型的豐度,被廣泛用于腫瘤浸潤(rùn)免疫細(xì)胞的估計(jì); · LM22 包含了547個(gè)基因在內(nèi)的signature 矩陣,能夠精確區(qū)分從外周血或體外培養(yǎng)條件中分離出的22種成熟的人造血細(xì)胞群; · RFS (relapse free survival)無(wú)復(fù)發(fā)生存期,或無(wú)病生存期,從隨機(jī)化開(kāi)始至疾病復(fù)發(fā)或(因任何原因)死亡之間的時(shí)間,最常用于根治性手術(shù)或放療后的輔助治療的研究; 1.研究思路 · 數(shù)據(jù)來(lái)源:TCGA數(shù)據(jù)庫(kù),ESCA, STAD, LIHC,PAAD, COAD, READ;GEO數(shù)據(jù)集 · 基于CIBERSORT結(jié)果進(jìn)行l(wèi)asso回歸分析,用于診斷模型的構(gòu)建,并進(jìn)行驗(yàn)證 · 基于CIBERSORT結(jié)果進(jìn)行預(yù)后模型的構(gòu)建和驗(yàn)證,并比較預(yù)后模型、TNM、列線圖的c-index,以確定預(yù)測(cè)效果 · 基于PIS和臨床信息進(jìn)行列線圖的構(gòu)建和驗(yàn)證 · 依據(jù)免疫細(xì)胞比例,對(duì)腫瘤病人進(jìn)行無(wú)監(jiān)督聚類(lèi),最后確定為6類(lèi),并進(jìn)行生存曲線的繪制和PIS分布的比較 2.結(jié)果 2.1 消化系統(tǒng)腫瘤中DIS(診斷免疫評(píng)分)的構(gòu)建和驗(yàn)證 2.2 消化系統(tǒng)腫瘤中PIS(預(yù)后免疫評(píng)分)的構(gòu)建和驗(yàn)證
2.3 PIS(預(yù)后免疫評(píng)分)與TNM進(jìn)行預(yù)后比較
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2.4 消化系統(tǒng)腫瘤病人的列線圖構(gòu)建和驗(yàn)證
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2.5 基于免疫浸潤(rùn)區(qū)分不同免疫亞型
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