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幾乎不做實驗發(fā)表一篇Nature論文!

 dachuanz 2020-05-02

2020年1月15日,Nature期刊在線發(fā)表了一篇題為B cells are associated with survival and immunotherapy response in sarcoma的研究性論文,揭示了B細胞中腫瘤免疫治療中的關鍵作用。該文的通訊作者為法國國家健康與醫(yī)學研究院的Wolf H. Fridman教授和美國德克薩斯大學安德森癌癥中心的Hussein A. Tawbi教授。由于該論文大部分結果都來自于 公共數據庫分析,今天筆者就帶大家仔細欣賞一下這篇文章。

研究背景:軟組織肉瘤是指脂肪、肌肉、筋膜、淋巴和血管等組織發(fā)生腫瘤,當前已經發(fā)現有50多種組織學亞型,每種組織肉瘤都具有不同的組織學、生物學特性和不一樣的局部浸潤和淋巴轉移傾向。 臨床結果表明軟組織肉瘤對免疫檢查點阻斷療法的敏感性差異很大,但是其中的機制目前還不清楚。

研究結果:為了探究軟組織肉瘤對免疫檢查點阻斷療法響應性不同的機制,作者從腫瘤微環(huán)境中免疫細胞組成入手來進行探究。通過對來自四個獨立數據庫(TCGA SARC, Gene Expression Omnibus (GEO) accessions GSE21050, GSE21122 and GSE30929)的608個軟組織肉瘤亞型數據進行微環(huán)境細胞群分析(MCP), 作者根據免疫微環(huán)境對軟組織肉瘤進行重新分類,分別為肉瘤免疫分類(SIC)A, B, C, D, E五種:其中SIC A為免疫匱乏型,低表達免疫細胞和血管內皮細胞相關基因;SIC B的免疫組成復雜,總體免疫反應弱;SIC C高表達血管內皮細胞相關基因;SIC D的免疫組成也為異質性,但總體免疫反應強;SIC E高表達免疫細胞相關基因,特別是B細胞相關基因。

根據免疫微環(huán)境組成對軟組織肉瘤進行重新分類后,接下來作者探究這種 分類方式是否與腫瘤患者的生存率相關。通過對TCGA和GEO兩個數據集進行分析,作者發(fā)現 高表達免疫細胞相關基因的SIC E具有較高的生存率,低表達免疫細胞相關基因的SIC A生存率較低。這表明根據免疫微環(huán)境組成對軟組織肉瘤進行分類能夠較好的預測腫瘤患者生存率。

由于SIC E中高表達B細胞和T細胞相關基因,那究竟何種細胞決定腫瘤患者的生存預后呢?為了探究這個問題,作者根據T, B細胞分別對腫瘤患者重新進行生存分析。結果顯示 腫瘤患者的生存率與B細胞的表達密切相關,但是與CD8+T細胞表達無明顯相關性。

三級淋巴結構(TLS)是機體中的異位淋巴器官,其在腫瘤部位的非淋巴組織中發(fā)展,主要由T細胞,B細胞和DC細胞組成。雖然研究者們已經發(fā)現腫瘤患者中存在大量三級淋巴結構,但是其對腫瘤治療的影響目前還不清楚。在前期的分析中作者發(fā)現SIC E中大量表達 CXCL13,而后者又與三級淋巴結構的形成密切相關。因此,作者接下來探究三級淋巴結構在腫瘤治療中的作用,并且能否作為SIC E的標志物。通過對93個軟組織肉瘤樣本進行免疫組化染色,作者發(fā)現 免疫反應強的SIC E中存在大量三級淋巴結構,而免疫反應弱的SIC A中基本不含有三級淋巴結構,并且大量表達三級結構的腫瘤中高表達CD3+T, CD8+T和CD20+ B細胞。這說明三級淋巴結構可以作為免疫反應強的軟組織肉瘤的標志物,并且與腫瘤患者預后呈現正相關關系。

既然根據免疫微環(huán)境組成對軟組織肉瘤進行分類的方式與腫瘤患者生存率密切相關,那其是否也能預測患者對PD1等免疫檢查點阻斷療法的響應性呢?為了探究這個問題,作者使用pembrolizumab(PD1單抗)對47個軟組織肉瘤患者進行治療。結果顯示, SIC E對pembrolizumab具有更好的響應性,患者的生存率也得到了較大提高。說明這種新型軟組織肉瘤分類方法有助于預測腫瘤患者對PD1免疫療法的敏感性。

總體來說,這篇論文根據免疫微環(huán)境組成這個全新的視角對軟組織肉瘤進行分類,發(fā)現該種分類方式能夠較好的預測病人對PD1免疫療法的敏感性,并且還揭示B細胞以及三級淋巴結構在腫瘤免疫治療中的重要作用,這加深了人們對于腫瘤免疫治療的理解。

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