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疾病已知的相關(guān)基因到底有哪些？一篇篇去讀綜述和文獻(xiàn)實(shí)在耗時(shí)耗力！今天小編為大家介紹幾個(gè)在線數(shù)據(jù)庫，輕松幫您查基因！ Phenopedia數(shù)據(jù)庫 網(wǎng)址：https://phgkb./PHGKB/startPagePhenoPedia.action 參考文獻(xiàn)：Wei Yu, Melinda Clyne, Muin J. Khoury and Marta Gwinn. Phenopedia and Genopedia: Disease-centered and Gene-centered Views of the Evolving Knowledge of Human Genetic Associations. Bioinformatics, doi:10.1093/bioinformatics/btp618.   Disgenet數(shù)據(jù)庫 網(wǎng)址：https://www./search 簡(jiǎn)介：基于文獻(xiàn)和數(shù)據(jù)庫挖掘，對(duì)疾病相關(guān)基因進(jìn)行檢索，涉及到罕見變異和復(fù)雜多態(tài)關(guān)聯(lián)的多個(gè)數(shù)據(jù)庫。 參考文獻(xiàn)：Pi?ero et al., 2016 , Pi?ero et al., 2015 , Bauer-Mehren et al., 2011 and Bauer-Mehrenet al., 2010 . 查詢頁面：輸入疾病名稱  結(jié)果頁面   PolySearch2數(shù)據(jù)庫 網(wǎng)址：http://polysearch.cs./polysearch 簡(jiǎn)介：PolySearch 2.0 (PolySearch .ca)是一個(gè)在線文本挖掘系統(tǒng)，用于識(shí)別人類疾病、基因、蛋白質(zhì)、藥物、代謝物、毒素、代謝途徑、器官、組織、亞細(xì)胞細(xì)胞器、積極健康效應(yīng)、消極健康效應(yīng)、藥物作用、GO terms、網(wǎng)格術(shù)語、ICD-10醫(yī)學(xué)編碼、生物分類法和化學(xué)分類法之間的關(guān)系。PolySearch 2.0支持廣義的“給定X，查找所有相關(guān)的Y”查詢，其中X和Y可以從上述生物醫(yī)學(xué)實(shí)體中選擇。 參考文獻(xiàn)：Liu Y., Liang Y., Wishart D.S. (2015) PolySearch 2.0: A significantly improved text-mining system for discovering associations between human diseases, genes, drugs, metabolites, toxins, and more. Nucleic Acids Res. 2015 Jul 1;43(Web Server Issue):W535-42. 查詢頁面(設(shè)定查找高血壓相關(guān)的所有基因和蛋白) （當(dāng)然可以參考簡(jiǎn)介查詢其他更多的內(nèi)容）   KEGG Disease數(shù)據(jù)庫 網(wǎng)址：https://www./kegg/disease/ 簡(jiǎn)介：在KEGG中，疾病被視為分子網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)的擾動(dòng)狀態(tài)。疾病的遺傳，環(huán)境因素以及藥物，被認(rèn)為是這個(gè)系統(tǒng)的擾動(dòng)。不同類型的疾病，包括單基因(單基因)疾病、多因素疾病和傳染病，都是通過積累這些擾動(dòng)及其相互作用而得到統(tǒng)一調(diào)控的。   進(jìn)一步獲得具體的基因和通路 Malacards數(shù)據(jù)庫 網(wǎng)址：https://www./ 查詢頁面：搜索疾病名稱  結(jié)果頁面：選擇最相關(guān)的疾病表型，點(diǎn)擊后滾動(dòng)頁面，找到GENE模塊進(jìn)一步獲得具體基因列表GWAS catalog數(shù)據(jù)庫 網(wǎng)址：https://www./gwas/ 簡(jiǎn)介：GWAS目錄提供了一個(gè)可搜索的、可視化的、免費(fèi)可用的全基因組范圍SNP-trait關(guān)聯(lián)研究數(shù)據(jù)庫參考文獻(xiàn)：Buniello A, MacArthur JAL, Cerezo M, Harris LW, Hayhurst J, Malangone C, McMahon A, Morales J, Mountjoy E, Sollis E, Suveges D, Vrousgou O, Whetzel PL, Amode R, Guillen JA, Riat HS, Trevanion SJ, Hall P, Junkins H, Flicek P, Burdett T, Hindorff LA, Cunningham F and Parkinson H.The NHGRI-EBI GWAS Catalog of published genome-wide association studies, targeted arrays and summary statistics 2019.Nucleic Acids Research, 2019, Vol. 47 (Database issue): D1005-D1012.查詢頁面：輸入疾病名稱結(jié)果頁面：可查詢到GWAS研究匯報(bào)的基因，SNP，并可整體下載內(nèi)容來源：天昊生物 |
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