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重大發(fā)現(xiàn)!新冠病毒首次發(fā)生大片段基因突變,致其更適應(yīng)人類,且該變異病毒已傳播了至少四周

 洪瀾 2020-03-19

到目前為止,2019新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)基因組被認(rèn)為比SARS-CoV或MERS-CoV更穩(wěn)定。一項(xiàng)來自杜克-新加坡國立大學(xué)醫(yī)學(xué)院的最新的研究顯示,SARS-CoV-2已發(fā)生一段長度達(dá)382個(gè)核苷酸的大片段缺失突變(?382),該缺失突變是SARS-CoV-2病毒感染人類后的第一次重大變異事件,也提示檢測該基因片段的新冠試劑盒將失效。研究人員認(rèn)為該缺失突變會(huì)使SARS-CoV-2更適應(yīng)感染人類宿主,并且該?382變異的病毒已經(jīng)傳播了至少四周。

先前的研究表明,開放閱讀框架8(ORF8)基因片段是SARS相關(guān)冠狀病毒的進(jìn)化熱點(diǎn),ORF8區(qū)域已被證明在導(dǎo)致2003年”非典“的SARS-CoV的物種間傳播、病毒復(fù)制效率以及適應(yīng)人類宿主等方面發(fā)揮了重要作用。

來自的一項(xiàng)最新的研究顯示,研究人員在8名新加坡住院的SARS-CoV-2感染患者中,發(fā)現(xiàn)SARS-CoV-2基因組均存在一段長度達(dá)382個(gè)核苷酸的大片段缺失突變(?382),?382片段幾乎完全覆蓋了SARS-CoV-2的ORF8基因片段及其轉(zhuǎn)錄表達(dá)調(diào)節(jié)序列(TRS),導(dǎo)致ORF8基因不能表達(dá),?382是SARS-CoV-2病毒進(jìn)入人類后的第一次重大變異事件

圖示:SARS-CoV-2存在一段長度達(dá)382個(gè)核苷酸的缺失突變(?382)

病毒核衣殼內(nèi)最重要的蛋白之一就是核衣殼蛋白(N,Nucleocapsid Protein),主要負(fù)責(zé)RNA的復(fù)制功能。核衣殼蛋白(N蛋白)常作為新型冠狀病毒診斷檢測工具,是新冠病毒快速診斷試劑核心原料。?382片段缺失會(huì)增強(qiáng)下游SARS-CoV-2病毒N蛋白基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)。因此,研究人員推測在該片段的缺失可能會(huì)導(dǎo)致SARS-CoV-2更適應(yīng)人類宿主。進(jìn)一步研究還發(fā)現(xiàn),?382病毒已經(jīng)傳播了至少四周。

圖示:?382增強(qiáng)下游N蛋白基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)

最后,鑒于ORF8是SARS相關(guān)冠狀病毒的進(jìn)化熱點(diǎn),且已被證明在SARS-CoV的物種間傳播、病毒復(fù)制效率以及適應(yīng)人類宿主等方面發(fā)揮了重要作用。因此,隨著SARS-CoV-2在人類中的持續(xù)傳播,我們很可能會(huì)發(fā)現(xiàn)更多的病毒變異。而且后續(xù)的研究應(yīng)當(dāng)注重?382 SARS-CoV-2病毒導(dǎo)致的表型變化以及該基因組標(biāo)記物在分子流行病學(xué)調(diào)查研究中的應(yīng)用

參考文獻(xiàn):Discovery of a 382-nt deletion during the early evolution of SARS-CoV-2

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