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今年可以說是circRNA井噴的一年了,年初時(shí)主刊《Cell》連發(fā)兩篇關(guān)于circRNA的文章,此后陸續(xù)NatureCommunication, Genome Biol, Hepatology等雜志接連發(fā)出數(shù)篇circRNA的相關(guān)文章,算是正式引爆了這個(gè)環(huán)狀非編碼RNA的科研熱點(diǎn)。 對于《Cell》這樣的神刊,需要大神級(jí)別的創(chuàng)新論點(diǎn),豈是我等凡人企及的高度?但是,出于學(xué)習(xí)(好奇)的目的,我們還是可以拜讀一下,在自己的綜述/論文/文章中引用一下。畢竟,發(fā)文章達(dá)不到這樣的高度,站在巨人的肩膀上還是可以做到的嘛不是? 下面咱們就來看看我們可以在綜述/論文/文章里引用大咖的什么觀點(diǎn)? TheLandscape of Circular RNA in Cancer 第一篇是對2000多例的腫瘤樣本和細(xì)胞系通過外顯子捕獲RNA的方法進(jìn)行測序,并建立了MiOncoCirc數(shù)據(jù)庫,并且定義了一種新型circRNA—read throughcircRNA (rt-RNA)。這意味著,如果剛好你研究癌癥,也想和circRNA這個(gè)研究熱點(diǎn)掛鉤的話,那你有福了! 引用觀點(diǎn): MiOncoCirc數(shù)據(jù)庫是一個(gè)迄今為止最全面的基于癌癥的circRNA數(shù)據(jù)庫,可以對癌癥中環(huán)狀RNA鑒定和表達(dá)模式進(jìn)行分析,還可發(fā)現(xiàn)新的biomarkers。(如果你的研究涉及到了這個(gè)數(shù)據(jù)庫,你可以簡單在此處提及下這個(gè)數(shù)據(jù)庫的出處,引用此篇文獻(xiàn))
Read-through circRNA(rt-circRNA)是一類由兩個(gè)基因的外顯子組成的新型環(huán)狀RNA,約占所有circRNA的2.5%,較一般的circRNA表達(dá)豐度更低,其形成與RNA聚合酶II在基因座位上的通讀(Read-through)有關(guān)。(該處適合研究rt-circRNA時(shí)引用,也適合在綜述里介紹這一分類時(shí)引用加以具體說明) 腫瘤內(nèi)circRNA的特性: 1)細(xì)胞增殖導(dǎo)致circRNA下調(diào)(該處是證實(shí)之前 Bachmayr-Heyda et al. (2015)的觀點(diǎn),引用時(shí)需要引用兩篇文獻(xiàn)) 2)circRNA上調(diào)與基因擴(kuò)增之間存在潛在聯(lián)系,而基因擴(kuò)增是癌基因過度表達(dá)的常見機(jī)制之一。 3) 由于缺乏開放端,circRNA對外核糖核酸酶(RNase R治療)具有天然抵抗力,故其穩(wěn)定性較高,有的circRNA甚至比同源的線性轉(zhuǎn)錄物更穩(wěn)定。因此circRNA是開發(fā)生物標(biāo)記物的理想候選之一。(此處引用可用于說明circRNA的穩(wěn)定性,適合在綜述里加以引用,后面可接上說明circRNA的研究價(jià)值和意義) Widespread and Functional RNA Circularization inLocalized Prostate Cancer 第二篇是對144例局限性前列腺癌臨床樣本進(jìn)行rRNA缺失的RNA序列分析,定義了1233個(gè)融合基因,并發(fā)現(xiàn)了76311個(gè)circRNA,且它們的表達(dá)模式與癌細(xì)胞侵襲性相關(guān)。這篇文章的意義在于,雖然作者僅討論了前列腺癌,而發(fā)現(xiàn)的circRNA的作用模式,即circRNA的作用獨(dú)立于母基因轉(zhuǎn)錄出來的mRNA,可以在之后的研究中加以引用并進(jìn)一步探討。 引用觀點(diǎn): circRNA與前列腺癌的臨床侵襲性和病理特征有關(guān)。(適合在研究前列腺癌的circRNA文章中引用,或作為綜述的一個(gè)分支加以引用) 約90%的circRNA是增殖所必需的,而其線性對應(yīng)轉(zhuǎn)錄本則不是,表明circRNA的作用是獨(dú)立的。(論述circRNA與增殖相關(guān)時(shí)可引用,另外可在敘述circRNA的作用機(jī)制時(shí)引用) 目前發(fā)現(xiàn)的circRNA作用機(jī)制,除了作為miRNA的分子海綿發(fā)揮作用以外,還具有穩(wěn)定miRNA的作用。(本文作者為此提供了證據(jù),可在此加以引用) Structure andDegradation of Circular RNAs Regulate PKR Activation in Innate Immunity 第三篇是探討circRNA的結(jié)構(gòu)及其降解機(jī)制。作者發(fā)現(xiàn)內(nèi)源性circRNA傾向于形成16-26 bp的不完全型RNA雙鏈,并作為雙鏈RNA依賴性蛋白激酶R(PKR)的抑制劑。當(dāng)poly(I:C)刺激或病毒感染時(shí),circRNA被RNase L降解,繼而PKR被釋放并激活,參與了早期細(xì)胞先天性免疫應(yīng)答。 引用觀點(diǎn): 許多circRNA傾向于形成16-26bp的雙鏈體并且充當(dāng)內(nèi)源性PKR抑制劑。在病毒感染后,circRNA可被活化的RNase L全面降解,而RNase L介導(dǎo)的circRNA降解是PKR活化所必需的。(闡述circRNA降解機(jī)制時(shí)引用) 在自身免疫性疾病系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE)中可見circRNA減少和PKR異?;罨?,并且過表達(dá)circRNA能降低SLE患者外周血單核細(xì)胞(PBMC)中PKR的活性,提示circRNA是SLE等自身免疫疾病的治療靶點(diǎn)。(闡述circRNA治療用途或應(yīng)用價(jià)值時(shí)可加以引用) 一篇好的綜述/論文/文章需要大量的積累,總結(jié)前人的研究,從中提煉觀點(diǎn),佐證自己的科研論點(diǎn),就是站在了巨人的肩膀上,在證明了前人經(jīng)驗(yàn)的同時(shí),也提高了自身研究的可信度。像《Cell》這樣的神刊,是拿來引用并加以佐證的最佳選擇之一了。 |
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