1904年,德國微生物學家LorenzHiltner提出了根際概念,他將根際定義為根系周圍、受根系生長影響的土體。植物根際微生物既包括抑制植物生長的有害微生物,又包括促進植物生長的有益微生物。有害微生物與連作時減產(chǎn)有關,它主要通過分泌植物毒素,競爭營養(yǎng)物質(zhì),還可能通過抑制菌根功能,從而抑制植物的生長;根際有益的微生物群落,包括生防微生物、能生產(chǎn)植物生長激素的微生物和固氮菌等。在農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)中,充分利用這些微生物的生物學潛力將有助于減少化肥和農(nóng)藥投入、促進植物生長、減輕環(huán)境污染,實現(xiàn)農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展。

細菌是根際微生物中數(shù)量最多的類群,可達106～108cm³。根際主要存在著G^-桿菌,常見的有假單胞菌(Pseudomonas)、黃桿菌(Flavobacterium)、產(chǎn)堿桿菌(Alcaligenes)、色桿菌(Chromobacter)和無色桿菌(Achromobacter)等。其中,根際細菌具有防病促生的潛能,最多的是假單胞菌屬(Pseudomonas)、次為芽胞桿菌屬(Bacillus)、農(nóng)桿菌屬(Agrobacterium)、埃文氏菌屬(Eriwinia)、黃桿菌屬(Flavobacterium)、巴斯德氏菌屬(Pasteuria)、沙雷氏菌(Serratia)、腸桿菌(Enterobacter)等。

根際放線菌主要是鏈霉菌屬(Streptomyces)、小單孢菌屬(Micromonospora)和諾卡氏菌屬(Nocardia),它們的存在對于根際細菌有明顯的抑制與拮抗作用。

根際真菌在不同土壤中的根土比為3～200,在不同作物上為10～20左右。常見的根際真菌屬有:鐮刀菌屬(Fusarium)、粘帚霉屬(Gliocladium)、青霉屬(Penicillium)、根柱孢屬(Cylindrocarpon)、絲核菌屬(Rhizoctonia)、被孢霉屬(Mortierella)、曲霉屬(Aspergillus)、腐霉屬(Pythium)和木霉屬(Trichoderma)等。