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我們先來回顧下過去公眾號剛剛發(fā)布的兩篇關(guān)于m6A的熱門爆款文,來理一下自己的科研思路: ① 截止2019年7月m6A熱點(diǎn)領(lǐng)域10分+研究盤點(diǎn) | m6A專題 ② 2019年國自然m6A項(xiàng)目解析及下載 | m6A專題 miRNA一直被認(rèn)為是過氣網(wǎng)紅,但是從今年國自然的資助總額來看,依舊有多達(dá)3億元的項(xiàng)目中標(biāo)。 雖然大家都知道,作為一家低調(diào)的測序公司,聯(lián)川客戶在miRNA方面的CNS文章多如天上的繁星。但同樣作為一家負(fù)責(zé)任的miRNA服務(wù)商,我們也有義務(wù)幫助老師在miRNA上玩出新的花樣。 目前,單純?nèi)ネ鎚iRNA當(dāng)然既無法中國自然,也無法發(fā)表高水平的研究論文。那么這個“被人嫌棄”的miRNA究竟該玩點(diǎn)兒什么套路呢? 外泌體當(dāng)然是OK的,今年總計(jì)有2.5億元的外泌體項(xiàng)目被資助。除了外泌體miRNA,ceRNA機(jī)制也已經(jīng)被徹底玩爛了。當(dāng)然miRNA促進(jìn)翻譯機(jī)制也屬于新機(jī)制,是一個值得關(guān)注的新角度,但是不太好做。 怎么辦呢? 還記得去年7月,我們在公眾號曾經(jīng)刊登過一篇文章——miRNA怎樣蹭上m6A的熱點(diǎn)發(fā)高分?| m6A專題。許多老師紛紛表示,自己處于停滯的項(xiàng)目終于有了一個突破口。 我們再來回顧一下,m6A該怎么跟miRNA“勾搭”上~ 早在2015年,聯(lián)川生物客戶在世界上首次證實(shí)miRNA加工與m6A修飾相關(guān)。一篇Nature(m6A調(diào)控miRNA初級體識別加工)是關(guān)于METTL3參與pri-miRNA上的m6A修飾,敲低METTL3影響了pri-miRNA上m6A修飾,繼而降低miRNA成熟體的表達(dá)量。一篇Cell(m6A識別酶HNRNPA2B1介導(dǎo)RNA加工)證實(shí)了pri-miRNA上m6A被HNRNPA2B1這個reader識別后激活pre-miRNA加工通路,繼而影響成熟體的加工。 2017年1月,天津醫(yī)科大學(xué)和南開大學(xué)兩所高校聯(lián)合在著名的老牌期刊Journal of Biological Chemistry上發(fā)表了一篇名為“MicroRNA-145 Modulates N6-Methyladenosine Levels by Targeting the 3’-Untranslated mRNA Region of the N6-Methyladenosine Binding YTH Domain Family 2 Protein”的文章。 YTHDF2作為reader行使識別帶有m6A修飾的mRNA并將其降解的功能。而YTHDF2被miR-145抑制后,mRNA整體的m6A水平發(fā)生顯著上調(diào)。 中山大學(xué)腫瘤防治中心孫穎/馬駿團(tuán)隊(duì)思路與同濟(jì)大學(xué)的康九紅團(tuán)隊(duì)(linc1281上m6A修飾影響胚胎干細(xì)胞分化)思路比較接近,發(fā)現(xiàn)在鼻咽癌特定的lncRNA上帶有m6A修飾從而影響ceRNA調(diào)控。 林東昕/鄭健課題組及徐瑞華課題組則是經(jīng)典的m6A修飾影響下游miRNA調(diào)控的套路,在胰腺癌中首次發(fā)現(xiàn)m6A修飾直接介導(dǎo)miR-25-3p加工。 同樣的套路,也被南京醫(yī)科大學(xué)的楊海偉課題組以及魏繼福課題組在膀胱癌上玩了一次,METTL3在膀胱癌中直接介導(dǎo)pri-miR-221初級體加工,從而影響miR-221成熟體數(shù)量。 所以,聯(lián)川生物建議,如果有打算做m6A項(xiàng)目的老師可以使用同樣的樣本搭配做一個miRNA測序可能會有驚喜和意外收獲,讓這個過氣網(wǎng)紅煥發(fā)第二春。 做m6A我們是專業(yè)的,做小RNA我們也是專業(yè)的,讓我們一起努力,發(fā)揮1+1>2的效果吧! |
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