|
ceRNA網(wǎng)絡構建 醫(yī)學方前期出品的3個數(shù)據(jù)挖掘的課程廣受學員的好評,其中《GEO、TCGA、Oncomine數(shù)據(jù)庫》課程著重介紹了幾個數(shù)據(jù)庫的基本用法,包括從數(shù)據(jù)的下載、數(shù)據(jù)的預處理、差異基因的篩選、功能富集等等,最快速地帶領大家走入生物信息學的大門,從一開始建立對分析數(shù)據(jù)的自信心。 PC端購買(蘋果用戶建議從PC端進入購買) 打開網(wǎng)頁,輸入課程鏈接: https://ke.qq.com/course/434610 先領取100元優(yōu)惠券,再點擊立即購買 快速購買 關注【醫(yī)學方】公眾號后,點擊右下角的【課程服務】,進入【騰訊課堂】,點擊【課程】,找到【醫(yī)學方|基于TCGA數(shù)據(jù)庫ceRNA網(wǎng)絡構建】,點擊進入購買。 ↓ ↓ 微信掃碼購買 打開微信掃描下面二維碼,即可進入購買網(wǎng)頁 學會用DEseq2進行差異分析 ceRNA又稱競爭性內源RNA,其較好的整合了多分子之間的相互關系,是目前科學研究的一大熱點,同時又是文章發(fā)表的一大亮點,而且其背后所蘊含的各類數(shù)據(jù)清洗和處理的方法也是學習其它組學的奠基石。不可否認,如果可以深度挖掘ceRNA,輕則可以發(fā)paper,重則可以申基金。因此本教程的推出,既可以給大家提供一個發(fā)paper的思路,還可以提升大家的數(shù)據(jù)清洗說的能力,本課程具有以下亮點: ? 一鍵解鎖TCGA的多種數(shù)據(jù)的多種下載方式,可以輕松入門TCGA。 ? miRNA成熟體和前體的區(qū)別以及兩種表達矩陣的下載。 ? 多種方法批量解鎖miRNA靶基因的獲取,不在為幾十個miRNA的靶基因獲取而煩惱。 ? 學會從TCGA中獲取lncRNA的表達矩陣 ? 解鎖lncRNA靶基因的獲取 ? Cytoscape網(wǎng)絡構建與美化 在本次視頻中,希望大家都能學會基于TCGA數(shù)據(jù)庫ceRNA網(wǎng)絡構建。 ① ceRNA背景知識 ② TCGA數(shù)據(jù)下載 ③ lncRNA表達矩陣獲取 ④ miRNA數(shù)據(jù)下載 ⑤ mRNA/lncRNA/miRNA差異分析 ⑥ 基于數(shù)據(jù)庫miRNA靶基因獲取 ⑦ 批量預測miRNA靶基因 ⑧ lncRNA靶基因獲取 ⑨ 基于Cytoscape構建ceRNA調控網(wǎng)絡 ⑩ Cytoscape網(wǎng)絡的美化 |
|
|
來自: 生物_醫(yī)藥_科研 > 《待分類》