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基因突變豐度越高,療效越好?

 成靖 2019-08-06

 2019-08-06 09:51:01

Haalthy導(dǎo)讀

靶向治療前需要進(jìn)行基因檢測(cè),查找突變的基因,從而選擇合適的藥物。但是在基因檢測(cè)報(bào)告上,不僅僅有基因突變的類型,還有一項(xiàng)重要的參考項(xiàng)目:突變豐度。

基因突變豐度是什么呢?豐度值的高低有統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)嗎?豐度值高好還是低好呢?想知道這些問題,一起看下今天的文章吧。

基因突變豐度是什么?

拿到一份基因檢測(cè)的報(bào)告,我們常??梢钥吹揭豁?xiàng)參考數(shù)值:豐度,這個(gè)數(shù)據(jù)令很多病友不解,“豐度”究竟是什么呢?以肺癌中最常見的EGFR突變?yōu)槔?/p>

“豐度”可以簡要理解為EGFR突變頻率占總的DNA中的濃度,也有學(xué)者將豐度定義為EGFR突變和野生型拷貝的比值,目前沒有明確的定義。

為什么不同的患者突變豐度不同?

不同的患者基因檢測(cè)的突變豐度會(huì)有很大的差異,這種差異主要與腫瘤異質(zhì)性相關(guān),過去我們認(rèn)為同一個(gè)體中腫瘤細(xì)胞是相同的,基因相同、空間結(jié)構(gòu)也相同;然而,隨著檢測(cè)技術(shù)逐漸精準(zhǔn)化,我們才發(fā)現(xiàn)同一份樣本組織中,腫瘤細(xì)胞的基因、蛋白等各個(gè)結(jié)構(gòu)并不一致。

這種特征更通俗而言,可以用一句古語表達(dá)“一母生九子,九子各不同”,原來定居的腫瘤細(xì)胞不斷演變出不同的后代。同一部位腫瘤會(huì)產(chǎn)生不同的基因表達(dá),不同部位的腫瘤表達(dá)又有可能出現(xiàn)新的改變,不同人之間又會(huì)有區(qū)別,從宏觀上看是人和人不同,微觀上看腫瘤和腫瘤也不同。

也就造成了不同的患者即使具有相同的基因突變,彼此之間突變的豐度也會(huì)有所不同,進(jìn)而表現(xiàn)為對(duì)于同一種藥物的反應(yīng)也不同。

高、低豐度判斷標(biāo)準(zhǔn)

早期,豐度高低的定義與基因檢測(cè)方法敏感性有關(guān),如直接測(cè)序法需要EGFR突變頻率達(dá)到20%-30%才能發(fā)現(xiàn),而ARMS檢測(cè)只需要EGFR突變頻率達(dá)到1%即可檢測(cè)到。只要檢測(cè)到突變即為高豐度。但這種定義過于籠統(tǒng)化,不具有區(qū)分性。

但目前對(duì)于基因檢測(cè)的豐度高低值判斷仍舊沒有統(tǒng)一的區(qū)間標(biāo)準(zhǔn)。不同的測(cè)序方法不同的檢測(cè)公司會(huì)有不同的數(shù)值設(shè)定。

基因突變豐度高可能提示TKI治療效果好

有中國學(xué)者發(fā)現(xiàn)EGFR突變豐度可以預(yù)測(cè)EGFR- TKI治療晚期非小細(xì)胞肺癌的療效。研究選取了100個(gè)樣本,其中有51例EGFR突變患者豐度較高,18例EGFR突變患者豐度較低,31例患者攜帶野生型EGFR。

將這100例患者同時(shí)進(jìn)行直接DNA測(cè)序ARMS檢測(cè)

兩種方法檢測(cè)均為陽性則為EGFR突變高豐度;

ARMS檢測(cè)陽性、直接DNA測(cè)序?yàn)殛幮詣t為低豐度;

二者均為陰性則為攜帶野生型EGFR。

所有患者均接受吉非替尼治療,檢測(cè)標(biāo)本腫瘤細(xì)胞超過50%。分析了EGFR突變豐度與吉非替尼治療臨床療效的關(guān)系結(jié)果如圖所示:

基因突變豐度越高,療效越好?

圖一:EGFR突變豐度高、EGFR突變豐度低和EGFR野生型三者比較

中位無進(jìn)展生存期(mPFS)

11.3個(gè)月 vs 6.9個(gè)月 vs 2.1個(gè)月;

客觀緩解率(ORR)

62.7% vs 44.4% vs 16.1%;

總生存期(OS)

15.9 個(gè)月 vs 10.9個(gè)月 vs 8.7個(gè)月

由此得出,基線相對(duì)EGFR突變豐度可以預(yù)測(cè)TKI 獲益程度。突變豐度越高,也就越有可能獲益。

對(duì)于該研究的三個(gè)延展性問題

結(jié)果有差異

由于腫瘤異質(zhì)性、基因檢測(cè)的方法、獲取的標(biāo)本、研究者關(guān)于豐度的定義等因素并不統(tǒng)一,因此不同試驗(yàn)會(huì)得出不同的結(jié)論。

如,有研究者用同樣的方法,結(jié)果發(fā)現(xiàn)高低豐度患者對(duì)TKI反應(yīng)沒有顯著不同,直接測(cè)序和ARMS法檢測(cè)突變結(jié)果不同的患者和相同的患者,PFS分別是13.4和10.9個(gè)月,沒有顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,可能與該試驗(yàn)的標(biāo)本選擇有關(guān)。

總之,EGFR基因突變豐度高可能提示EGFR-TKI治療效果好,但二者之間不存在必然關(guān)系。

豐度動(dòng)態(tài)變化也可以反應(yīng)TKI治療效果

有研究顯示:血漿中EGFR突變快速降低可能預(yù)示更好的TKI反應(yīng)。FASTACT-2研究顯示第3周期時(shí)血漿EGFR突變依舊陽性可能預(yù)示較差的臨床結(jié)局。

其他基因突變豐度是否具有相同的結(jié)論

目前,沒有資料顯示其他基因突變豐度對(duì)于靶向治療效果的研究,因此,能否將同樣的結(jié)論類比到其他的基因突變豐度,尚待考量。

以上是肺騰助手為病友們整理的基因檢測(cè)突變豐度的小知識(shí),希望對(duì)大家有幫助!

參考資料:

[1].https:///doi/pdfdirect/10.1200/JCO.2010.33.3757

[2].邵宜,鐘殿勝 .EGFR突變豐度的檢測(cè)及其臨床意義[J].中國肺癌雜志,2017,20(8):578-582

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