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Nature里程碑:人類肝臟細(xì)胞圖譜問世,將成肝癌治療重磅數(shù)據(jù)庫!

 醫(yī)藥魔方 2020-11-05

肝臟是人類一個(gè)必不可少的多功能器官,既負(fù)責(zé)將食物中的糖、蛋白質(zhì)和脂肪轉(zhuǎn)化為對身體有用的物質(zhì)(代謝功能),也負(fù)責(zé)血液排毒(免疫功能)

目前,肝臟疾病(如脂肪肝、肝癌或肝炎)已成為全球最大的健康問題之一,其發(fā)病率不斷上升,是導(dǎo)致死亡的主要原因。

圖片來源:Nature

7月10日,發(fā)表在Nature雜志上的一項(xiàng)研究中[1],來自德國Max Planck免疫生物學(xué)與表觀遺傳學(xué)研究所等機(jī)構(gòu)的科學(xué)家們發(fā)表了一份完整的人類肝臟細(xì)胞圖譜。Nadim Aizarani等利用單細(xì)胞RNA測序技術(shù),成功繪制了健康人類肝臟中細(xì)胞群的詳細(xì)地圖。這一里程碑成果將對改善肝癌等疾病的治療具有重要意義。

單細(xì)胞測序技術(shù)被用于確定一個(gè)細(xì)胞中每個(gè)基因有多少信使RNA(mRNA)。測序前,被調(diào)查的器官組織需要被離解成單個(gè)細(xì)胞,然后對每個(gè)細(xì)胞進(jìn)行單獨(dú)測序。

“通過測量細(xì)胞在某一特定時(shí)間點(diǎn)存在哪些RNA分子,我們可以確定哪些基因是活躍的。這使我們能夠了解細(xì)胞所執(zhí)行的功能,以及在疾病發(fā)生時(shí),細(xì)胞內(nèi)的基因表達(dá)是如何調(diào)控的?!鳖I(lǐng)導(dǎo)該研究的Dominic Grün解釋道。

單細(xì)胞RNA測序揭示了成人肝臟中的細(xì)胞類型(圖片來源:Nature)

基于對來自9名人類捐贈者的10,000個(gè)細(xì)胞的分析,細(xì)胞圖譜揭示了所有重要的肝臟細(xì)胞類型,包括肝臟主要的代謝細(xì)胞——肝細(xì)胞、血管內(nèi)皮細(xì)胞、肝內(nèi)巨噬細(xì)胞及其它免疫細(xì)胞、膽管細(xì)胞和肝臟上皮祖細(xì)胞。

研究還發(fā)現(xiàn)了肝細(xì)胞、內(nèi)皮細(xì)胞和巨噬細(xì)胞的新亞型,以及膽管細(xì)胞其中一個(gè)亞群一些此前未知的特性。

在成人肝臟中鑒定出了一種祖細(xì)胞群(圖片來源:Nature)

膽管貫穿整個(gè)肝臟,將膽汁輸送到膽囊。該研究顯示,一個(gè)罕見的膽管細(xì)胞亞群本質(zhì)上是前體細(xì)胞或祖細(xì)胞,他們不僅能夠形成類器官(這是干細(xì)胞的一個(gè)顯著特征),還具有發(fā)育成不同細(xì)胞類型的潛能。在培養(yǎng)基中培養(yǎng)時(shí),這些祖細(xì)胞要么分化成肝細(xì)胞,要么分化成膽管細(xì)胞。研究者們相信,這種前體細(xì)胞群在肝臟再生中發(fā)揮著重要作用,也可能參與肝臟疾病或腫瘤的發(fā)展。

在這項(xiàng)研究中,科學(xué)家們還證實(shí)了“人類肝臟細(xì)胞圖譜將成為肝癌研究的重要參考數(shù)據(jù)庫。” 他們將來自細(xì)胞圖譜中健康組織的數(shù)據(jù)與來自肝細(xì)胞癌(最常見的原發(fā)性肝癌)組織的數(shù)據(jù)進(jìn)行了比較,并鑒定出了新的腫瘤細(xì)胞標(biāo)志物以及腫瘤內(nèi)不同細(xì)胞類型的基因活動模型。

對來源于患者的肝細(xì)胞癌進(jìn)行單細(xì)胞測序揭示了癌癥特異性基因特征以及被擾亂的細(xì)胞表型(圖片來源:Nature)

目前,分析病變組織(如腫瘤組織)的方法只能提供整個(gè)組織樣本中活躍基因濃度的平均值,這種情況下,罕見細(xì)胞類型或單個(gè)細(xì)胞在其中的“貢獻(xiàn)”就消失了。而也許,正是這些少數(shù)細(xì)胞決定了一個(gè)組織的健康與否,癌變與否。因此,細(xì)胞圖譜和單細(xì)胞RNA測序?qū)椭M(jìn)一步提高癌癥診斷及治療水平具有巨大的潛力。

研究人員對分離自9名捐贈者肝臟組織的單細(xì)胞進(jìn)行了單細(xì)胞RNA測序,繪制了一張人類肝臟細(xì)胞圖譜,并鑒定出了先前未知的肝臟細(xì)胞亞型。此外,研究人員發(fā)現(xiàn),肝臟中膽管細(xì)胞的一個(gè)罕見亞型具有發(fā)育成不同細(xì)胞類型(如肝細(xì)胞或膽管細(xì)胞)的潛能。(圖片來源:MPI of Immunobiology and Epigenetics, Freiburg, Grün)

研究人員認(rèn)為,單細(xì)胞測序可以捕捉待檢測樣本中每個(gè)健康或患病細(xì)胞的分子特征。通過與來自健康組織的參考數(shù)據(jù)進(jìn)行比較,科學(xué)家可以靶向腫瘤細(xì)胞的致病分子特性,開發(fā)更有效的抗癌療法。

總結(jié)來說,人類肝臟細(xì)胞圖譜將幫助研究者或醫(yī)生更確切地了解肝臟中的各種細(xì)胞在發(fā)育或疾病進(jìn)展時(shí)究竟發(fā)生了怎樣的變化,為生物醫(yī)學(xué)的發(fā)展奠定了重要基礎(chǔ)。這些發(fā)現(xiàn)將促進(jìn)對肝臟疾病分子水平的理解,未來可能會研發(fā)出新型治療策略。

小結(jié)

領(lǐng)域:肝臟疾病

雜志:Nature

亮點(diǎn):來自德國Max Planck免疫生物學(xué)與表觀遺傳學(xué)研究所等機(jī)構(gòu)的科學(xué)家們利用單細(xì)胞RNA測序技術(shù)成功繪制了一份完整的人類肝臟細(xì)胞圖譜。這一里程碑成果將對改善肝癌等疾病的治療具有重要意義。

相關(guān)論文:

[1] Nadim Aizarani et al. A human liver cell atlas reveals heterogeneity and epithelial progenitors. Nature(2019).

參考資料:

1# Scientists discover previously unknown subtypes of liver cells in health and disease

新靶點(diǎn)

NKG2A | GARP | CD22 | 628個(gè)靶點(diǎn) | LIF | CDK2 | 

WWP1 | VCAM1 | CA19-9

新療法

雙特異性抗體 | PROTACs技術(shù) | 第四代EGFR抑制劑 | RNAi藥物 | GCGR抗體 | AMPK激動劑 | 神奇膠囊CAR-T療法 | 降膽固醇新藥 | 光照+聲音 |  調(diào)節(jié)代謝 | 基因治療 | 先天免疫 | 細(xì)胞治療 | 智能i-胰島素 | 胎盤干細(xì)胞 | 河豚毒素 | 感冒病毒 | 腸道細(xì)菌 | 腫瘤疫苗 | 溶瘤病毒 

新機(jī)制

PD-1抗體與腸道菌群 | 細(xì)菌與癌癥 | CCR5與中風(fēng)康復(fù) | 糖促進(jìn)腫瘤 | 黃金鉀 | PD-1加速腫瘤生長 | 癌細(xì)胞神秘偷渡PD-L1 | 乳腺癌耐藥性 | 鐵死亡 | PARP抑制劑 | 哮喘鼻炎之謎 | 致命心臟病 | TOX | 帕金森病 | 肺癌轉(zhuǎn)移 | 高血壓 | 減肥藥 | 超級細(xì)菌毒力開關(guān)

流行病學(xué)

腦卒中 | 炎癥性腸病 | 兒童癌癥 |  淋巴瘤和骨髓瘤 | 胃癌 | 多發(fā)性硬化 | 中國前十大死因

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