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皇帝的疾病史,一定程度上決定了歷史中的宮幃政治走向。我們亦可將其抽離出來,作為專門的病理學主題加以研究。糖尿病,當今時代的常見病之一,在中國古代,往往由鐘鳴鼎食之家的皇親國戚所罹患。如漢高祖劉邦、漢武帝劉徹等,都曾飽受這份“甜蜜負擔”的困擾。 1921年,加拿大科學家班廷以狗為實驗動物進行研究(據(jù)傳,由于經(jīng)費不足,當時街上的流浪狗經(jīng)常神秘失蹤),初步揭示了糖尿病與胰島素之間的關聯(lián),并榮獲了諾貝爾生理學和醫(yī)學獎。之后,產(chǎn)業(yè)界通過生物工程技術,逐步實現(xiàn)了胰島素的體外表達生產(chǎn),解決了產(chǎn)量、純度和價格問題。而學術界則在一直孜孜探索糖尿病背后的詳細發(fā)病機理。得益于分子生物學技術的突飛猛進,很多糖尿病相關的基因已被鎖定,而二代測序技術的通量及深度,又進一步將胰島素分泌調(diào)控相關的 SNP 一一解析。今天,我們就來分享一篇文章,講述胰島素分泌調(diào)控與單核苷酸多態(tài)性 SNP 之間的關系。 文章發(fā)表在《NatureGenetics》:作者先通過 GWAS 分析,發(fā)現(xiàn)了 PAM 基因(酰胺化單加氧酶)上與正常人存在差異的兩個等位基因 SNP,rs78408340 和 rs35658696。隨后通過電化學發(fā)光 MSD 技術測定了對應的胰島素含量,揭示了其功能表型。發(fā)現(xiàn) rs78408340 的錯義會影響 PAM 的功能:正常情況下,PAM 定位于高爾基體。而發(fā)生錯義后,PAM 則會定位在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上,PAM 蛋白的正確折疊將被干擾,最終阻礙了胰島素的正常分泌。當 PAM 被基因沉默后,與對照組相比,β-cell 在高糖條件(攝食之后)下分泌的胰島素顯著下降。這說明 PAM 基因的 rs78408340SNP 參與調(diào)節(jié)了胰腺 β-cell 的胰島素分泌。 PAM是如何影響 β-cell 胰島素的分泌呢? 研究者發(fā)現(xiàn)了 PAM 的下游效應蛋白 CgA(嗜鉻粒蛋白),CgA 是 PAM 的作用底物,PAM 被沉默后,CgA-Gly 的表達量明顯上升進而導致 β-cell 分泌胰島素的含量下降。 文章要點提煉 1. 細胞因子檢測 +GWAS-SNP 分析,能完整揭示基因型與表型之間的對應關系; 2. PAM 參與 β-cell 的分泌途徑,調(diào)節(jié)胰島素的分泌; 3. 單個 SNP 會導致 PAM 功能的變化,影響胰島素的分泌; 無獨有偶,《Cell》上也有一篇文章采取了相似的研究思路,探索了 FOXO3 基因的 SNP 與 TGF-β 通路細胞因子分泌調(diào)控間的關系。發(fā)現(xiàn)攜帶 rs12212067 的 SNP 影響了單核細胞細胞因子的分泌,在降低 TNFα 表達的同時,促進了抑炎因子 IL-10 的釋放。 很多 SNP 并無顯著可見的功能,文章通過基因型加表型分析,發(fā)現(xiàn)了單個 SNP 與糖尿病之間隱藏至深的勾連,也算從眾多碌碌無為、無甚明顯功能的 SNP 之中脫穎而出,實現(xiàn)了其人生價值。但生物的適應性本就是基因與環(huán)境的匹配磨合。一定生活環(huán)境下的劣勢基因,換個時代,換個地域,可能反具備生存優(yōu)勢。縱觀整個人類歷史,悠悠漫長,衣食無憂僅是近100年,甚至近幾十年的事,漫長的食物不足甚至饑荒年代,對攜帶 SNPrs78408340 的人群,通過減少胰島素的分泌,相對其他個體,也許更適應彼時的代謝需求。與此類似,基因突變導致的鐮刀型紅細胞貧血癥影響了紅細胞的攜氧功能,卻在瘧疾肆虐的非洲地區(qū)巧妙地減少了瘧原蟲的侵襲。 SNP,福兮,禍兮?誰又能說得清……不過,倘因糖尿病而早逝的古人活在當代,至少能向天再借幾十年。 諾禾致源提供 MSD 細胞因子檢測 +GWAS-SNP 分析服務,其中與代謝炎癥相關的細胞因子見下表,包括人、鼠、兔子、犬齒類、非人類靈長類動物。 如果您有檢測需求,請與天津諾禾致源當?shù)劁N售聯(lián)系。MSD 完整因子列表請向pid@novogene.com索取。 聯(lián)系方式:pid@novogene.com 參考文獻 [1] Soren K. Thomsen,Anne Raimondo, Benoit Hastoy, et al. Type2 diabetes risk alleles in PAM impact insulin release from human pancreaticβ-cells[J]. Nature Genetics, 2018, 50:1122–1131. [2] Lee J , Espéli,Marion, Anderson C , et al. Human SNPLinks Differential Outcomes in Inflammatory and Infectious Disease to aFOXO3-Regulated Pathway[J]. Cell, 2013, 155(1):57-69. 免疫定量事業(yè)部 李軍輝、 宋 美 | 文案 圖片來源網(wǎng)絡,侵刪 END 為你讀文獻 為你分享資源 為你分析研究思路 為你提供最前沿的科研動態(tài) 學霸,逗逼,科學家,文藝青年同在! 諾禾質(zhì)譜丨提供領先的蛋白質(zhì)組學與代謝組學方案 諾禾質(zhì)譜丨提供領先的蛋白質(zhì)組學與代謝組學方案 |
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