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作者：小丫 來源：嘉因 同樣算read counts，為什么公司跟師兄算的結(jié)果不一樣？| Ensembl、UCSC、Refseq，該用哪個一文推薦用ensembl的gene model，哪些已經(jīng)測序的植物有ensembl基因組注釋呢？
列在這里，加上了中文名和漢語拼音，便于小伙伴兒們查找。
| Species | 中文名 | | Aegilops tauschii | 節(jié)節(jié)麥 | | Amborella trichopoda | 無油樟 | | Arabidopsis lyrata | 琴葉擬南芥 | | Arabidopsis thaliana | 擬南芥 | | Beta vulgaris | 甜菜 | | Brachypodium distachyon | 二穗短柄草 | | Brassica napus | 油菜 | | Brassica oleracea | 甘藍(lán) | | Brassica rapa | 白菜 | | Chlamydomonas reinhardtii | 萊茵衣藻 | | Chondrus crispus | 皺波角叉菜 | | Corchorus capsularis | 圓果黃麻 | | Cyanidioschyzon merolae | 紅藻 | | Galdieria sulphuraria | 紅藻 | | Glycine max | 大豆 | | Hordeum vulgare | 大麥 | | Leersia perrieri | 假稻屬 | | Medicago truncatula | 蒺藜苜蓿 | | Musa acuminata | 小果野蕉 | | Oryza barthii | 稻屬 | | Oryza brachyantha | 花藥野生稻 | | Oryza glaberrima | 非洲栽培稻 | | Oryza glumaepatula | 展穎野生稻 | | Oryza indica | 秈稻 | | Oryza longistaminata | 長雄野生稻 | | Oryza meridionalis | 南方野生稻 | | Oryza nivara | 野生稻 | | Oryza punctata | 斑點(diǎn)稻 | | Oryza rufipogon | 野生稻 | | Oryza sativa | 稻 | | Ostreococcus lucimarinus | 鞭毛藻 | | Physcomitrella patens | 小立碗蘚 | | Populus trichocarpa | 楊樹 | | Prunus persica | 桃 | | Selaginella moellendorffii | 江南卷柏 | | Setaria italica | 小米 | | Solanum lycopersicum | 番茄 | | Solanum tuberosum | 馬鈴薯 | | Sorghum bicolor | 高粱 | | Theobroma cacao | 可可樹 | | Trifolium pratense | 紅三葉草 | | Triticum aestivum | 小麥 | | Triticum urartu | 烏拉爾圖小麥 | | Vitis vinifera | 葡萄 | | Zea mays | 玉米 |
用ensembl基因組的理由： 
同樣用Ensembl算TPM，結(jié)果還是不一樣？ | Ensembl的注意事項(xiàng)
http://blog.sciencenet.cn/blog-3372875-1090618.html
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