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韋恩圖又稱文氏圖,是科研文章中最常見的圖,可以用來表示多個數(shù)據(jù)集之間的關系。當然也可以進行集合運算。今天給大家分享兩個快捷畫韋恩圖的工具。 Draw Venn Diagram 網(wǎng)址: http://bioinformatics.psb./webtools/Venn/ 打開首頁是這樣的: 左側(cè)輸入數(shù)據(jù),這里既可以導入文件,也可以直接輸入組合的列表,如果輸入框不夠,可以點擊'Add'添加新的輸入框。 右側(cè)可填寫對應組合的名稱。 例如我要取兩個數(shù)據(jù)集的交集基因,那就分別上傳兩個文件,并且命好名字,最后點擊提交就可以了。 接著就是下載結(jié)果: 首先是輸入數(shù)據(jù)的統(tǒng)計情況,之后是得到的維恩圖,有兩種格式(PNG和SVG)可以下載,最后是各區(qū)域的基因列表,此文件可以導出。 BioVenn 網(wǎng)址: http://www./index.php BioVenn只能繪制3維及以下的韋恩圖,不過圓圈的大小可以隨數(shù)據(jù)集大小而變化,并且對圖片的編輯選項也更多,更能映射到Ensembl gene ID。 打開首頁如下,框選部分為按照實際的項目情況填寫圖片標題、副標題和3個數(shù)據(jù)集名稱。(注意:該軟件只能進行 2 組以及 3 組之間的比較) 打開 OTU 豐度表,若組內(nèi)有多個重復,可以求和,然后篩選出和大于 0 的 OTU,并將 OTU 名稱輸入 ID set 框內(nèi),或選擇 txt 文件導入(excel 格式不識別)。 點擊 Embedded SVG 矢量圖生成即可,由于矢量圖清晰度比較高,建議生成 SVG 格式。 修改參數(shù)后生成如下維恩圖,圖中文字可以直接拖拽。 Bio-Venn 提供的在線繪圖方式簡單易懂,只需要在文本框中輸入這些標識符的列表,并按下提交按鈕即可。顏色和文本大小等參數(shù)可以通過 web 界面輕松調(diào)整,文本的位置可以根據(jù)“拖放”原則進行調(diào)整,輸出的維恩圖可以顯示為嵌入在web應用程序中的SVG或PNG圖像,或者作為一個獨立的 SVG 或 PNG 圖像。 好了,今天小編就先給大家介紹這兩款簡單易用的韋恩圖繪圖工具,希望對您的科研能有所幫助! 來源:互聯(lián)網(wǎng) |
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