1.1采購環(huán)節(jié)

1.1.1虛列購進(jìn)成本，虛增進(jìn)項稅額；主要產(chǎn)生在中藥材收購中，隨意開具收購發(fā)票，用于虛增成本、虛抵進(jìn)項稅額。

1.2促銷環(huán)節(jié)

1.2.1各類促銷與宣傳環(huán)節(jié)，贈送禮品、樣品未視同銷售。

1.3庫存環(huán)節(jié)

1.3.1外購原材料、在產(chǎn)品以及產(chǎn)成品發(fā)生非正常損失，未轉(zhuǎn)出進(jìn)項稅。

1.3.2過期、滯銷或淘汰原因，將材料產(chǎn)品做報廢處置，未及時做資產(chǎn)損失備案。

1.4 銷售環(huán)節(jié)

1.4.1 適用稅率選擇錯誤；主要是藥品種類較多，且存在多種稅率，并且增值稅率變動較為頻繁，造成適用稅率錯誤。

1.4.2 未按照納稅義務(wù)時間申報納稅；實(shí)際工作中，很多開票收款后再進(jìn)行申報的情況，并未按照法定納稅義務(wù)時間申報納稅。

1.4.3 適用簡易計稅的業(yè)務(wù)進(jìn)項稅額轉(zhuǎn)出不合規(guī)；

1.4.4 銷售費(fèi)用占比過高；行業(yè)性問題，是目前最大問題，主要是各種費(fèi)用需要“出口”，造成虛開、虛抵，風(fēng)險較大。

1.4.5  返利返點(diǎn)的稅收風(fēng)險；返利是行業(yè)普遍手段，而代理商或者經(jīng)紀(jì)人的這部分返利沒有繳稅，風(fēng)險較大。

1.5 資金環(huán)節(jié)

1.5.1 取得財政補(bǔ)貼作為不征稅收入的合理性；很多醫(yī)藥企業(yè)取得政府的專項資金，但是在撥付文件、管理辦法以及單獨(dú)核算上存在瑕疵，造成稅收風(fēng)險。

1.5.2 政策性搬遷所得未確認(rèn)搬遷收入。

1.6 投資環(huán)節(jié)

1.6.1 股權(quán)轉(zhuǎn)讓風(fēng)險；股權(quán)轉(zhuǎn)讓要注意納稅義務(wù)時間、轉(zhuǎn)讓所得、定價偏低、代扣代繳等問題。

1.7 人力與薪酬環(huán)節(jié)

1.7.1 股權(quán)激勵風(fēng)險；要注意個人所得稅及時扣繳，企業(yè)所得稅的稅會差異問題。

1.7.2 發(fā)送補(bǔ)貼、補(bǔ)助、現(xiàn)金以及實(shí)物的風(fēng)險；企業(yè)發(fā)放的上述各種補(bǔ)貼，均需要按照個人所得稅法的要求繳納個稅。

1.7.3 銷售費(fèi)用憑票報銷的風(fēng)險；銷售人員取得各種收入，要申報繳納個稅，并且，報銷的各種費(fèi)用應(yīng)真實(shí)、合法。

1.7.4 為員工購買商業(yè)保險的風(fēng)險；對于商業(yè)保險按照稅法的要求，需要扣繳個稅。

1.7.5 對外贈送禮品的風(fēng)險；在年會、座談會、促銷會、慶典等活動中，向本單位以外個人贈送物品、有價證券等禮品，要扣繳個人所得稅。

2.1 虛開發(fā)票的風(fēng)險；主要指虛開農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票問題。

2.2 研發(fā)費(fèi)用加計扣除風(fēng)險；主要表現(xiàn)在擴(kuò)大加計扣除范圍和金額。

2.3 高額回扣的風(fēng)險

2.3.1高額回扣形式多樣；主要有付款獎、銷售總量獎、商業(yè)返利、信息費(fèi)、勞務(wù)費(fèi)、宣傳費(fèi)會務(wù)費(fèi)、贊助費(fèi)、倉儲費(fèi)等名義。

2.3.2 名義贈送樣品實(shí)際實(shí)物回扣。

2.3.3 贈送禮物、報銷費(fèi)用等方式的回扣。

2.3.4 提供境內(nèi)外旅游、考察等方式的回扣。

2.4 “走票”、“掛靠”的風(fēng)險；從事醫(yī)藥銷售的個人掛靠在醫(yī)藥公司，松散的管理方式導(dǎo)致虛開發(fā)票的風(fēng)險。