碳氮比對微生物的生長代謝起著重要的作用。

碳氮比低，則微生物分解速度快，溫度上升迅速，堆肥周期短；碳氮比過高則微生物分解速度緩慢，溫度上升慢，堆肥周期長。

不同碳氮比對糞堆肥氨氣揮發(fā)和腐熟度的影響：低碳氮比的氨氣揮發(fā)明顯大于高碳氮比處理，說明碳氮比越低，其氮素損失越大；低碳氮比堆肥鹽分過高，會抑制種子發(fā)芽率，而高碳氮比會導致堆肥肥料養(yǎng)分含量不達標。相比之下，碳氮比為24.0和32.4的處理較有利于減小氮素的損失和促進堆肥的腐熟。因此，綜合考慮各方面因素，堆肥的碳氮比控制在25～30為宜。

在糞便堆肥過程中，碳源被消耗，轉化為CO2和腐殖質物質，氮則主要以氨氣的形態(tài)散失，或者轉化為硝酸鹽和亞硝酸鹽，或為微生物生長代謝所吸收。因此，碳和氮的變化是反映堆肥發(fā)酵過程變化的重要特征，總碳含量和總氮含量均呈下降趨勢，且總碳含量下降速度大于總氮含量。而碳氮比，則是用來判斷堆肥反應是否達到腐熟的重要指標，C/N變化為總體上呈現(xiàn)出緩慢下降趨勢。

一般禾本科作物的莖稈如水稻稈、玉米稈和雜草的碳氮比都很高，可以達到60～100：1，豆科作物的莖稈的碳氮比都較小，如一般豆科綠肥的碳氮比為15～20：1。碳氮比大的有機物分解礦化較困難或速度很慢。原因是當微生物分解有機物時，同化5份碳時約需要同化1份氮來構成它自身細胞體，因為微生物自身的碳氮比大約是5：1。而在同化(吸收利用)1份碳時需要消耗4份有機碳來取得能量，所以微生物吸收利用1份氮時需要消耗利用25份有機碳。也就是說，微生物對有機質的政黨分解的碳氮比的25：1。如果碳氮比過大，微生物的分解作用就慢，而且要消耗土壤中的有效態(tài)氮素。

所以在施用碳氮比大的有機肥(如稻草等)或用碳氮比大的材料作堆漚肥時，都應該補充含氮多的肥料以調節(jié)碳氮比.