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瓊脂糖凝膠電泳拖尾了怎么辦? – 英格恩技術(shù)的博客

 永隆統(tǒng) 2019-05-09

跑過瓊脂糖凝膠電泳的小伙伴,是不是經(jīng)常遇到過電泳拖尾的現(xiàn)象???相信不少人點頭如搗蒜了。提個質(zhì)粒拖尾,提個DNA拖尾,連PCR也拖尾,拖尾什么的最常見了。驗證也就算了,關(guān)鍵是圖片拍出來不好看了,發(fā)文章什么的太影響檔次了。下面我就跟據(jù)自己的經(jīng)驗跟大家講講瓊脂糖凝膠電泳為什么會拖尾,有不足的希望大家多多評論補足?。ㄈ诵斜赜形?guī)熉铮。?a >圖片1

那瓊脂糖凝膠電泳為什么會拖尾呢?

1.    PCR產(chǎn)物出現(xiàn)拖尾的因素有很多,總結(jié)為一條,就是非特異性擴增過多。原因可能是:
(1)    模板不純:純化模板
(2)    Buffer不合適:更換Buffer
(3)    退火溫度偏低:適當(dāng)提高退火溫度
(4)    酶量過多:適量用酶,或調(diào)換另一種酶
(5)    dNTP、Mg2+濃度偏高:適當(dāng)降低dNTP和鎂離子的濃度
(6)    循環(huán)次數(shù)過多:減少循環(huán)次數(shù)
(7)    模板量少或引物量過多:增加模板量,減少引物的用量

2.    提質(zhì)粒的時候經(jīng)常有這種個現(xiàn)象,有可能是樣品濃度過高了。這種情況簡單,稀釋一下就行了。

3.    提基因組DNA的時候也常出現(xiàn)拖尾,最可能的就是提的DNA中摻雜有蛋白質(zhì),蛋白質(zhì)會拽DNA的泳動。所以一定要注意提取基因的操作,減少蛋白質(zhì)等雜質(zhì)的出現(xiàn)。

4.    樣品破碎或是被降解

5.    存在RNA:DNA前面的一片一般都是未清除的RNA,經(jīng)過純化,RNAse處理,就沒有了

6.    電泳體系的問題:觀察你的marker是否也存在拖尾現(xiàn)象,作為對照
(1)電泳緩沖液TAE或者TBE的污染:。建議更換緩沖液。
(2)上樣時樣品漂了,建議增加上樣緩沖液的用量,以及小心加樣。
(3)電壓太高:適當(dāng)降低電壓
(4)根據(jù)核酸片斷大小,適當(dāng)把加大凝膠濃度。凝膠濃度的選擇取決于DNA分子的大小。分離小于0.5kb 的DNA片段所需膠濃度是1.2-1.5%, 分離大于10kb的DNA分子所需膠濃度為0.3-0.7%, DNA片段大小間于兩者之間則所需膠濃度為0.8-1.0%。

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