設(shè)有中華海洋文明第一篇章和第二篇章、海洋強(qiáng)國(guó)以及海上對(duì)外交流展區(qū)。

中華海洋文明第一篇章展現(xiàn)了在漫長(zhǎng)的歷史歲月中，中華先民們與海共存，在認(rèn)識(shí)海洋、開(kāi)發(fā)海洋的過(guò)程中，承載的中華民族的寶貴的文化精神和傳統(tǒng)，及其為人類(lèi)海洋文明發(fā)展做出的不可磨滅的貢獻(xiàn)。

 中華海洋文明第二篇章展現(xiàn)了明清之際在禁海與開(kāi)海的不斷爭(zhēng)論中，對(duì)外貿(mào)易與交往的步伐從未停滯，鴉片戰(zhàn)爭(zhēng)引發(fā)了中國(guó)人的海洋危機(jī)意識(shí)，在不屈抗?fàn)幍耐瑫r(shí)，國(guó)人也積極吸納西方海洋文明，發(fā)展海洋經(jīng)濟(jì)，維護(hù)海洋權(quán)益，探索海洋發(fā)展的近代化之路，轉(zhuǎn)型時(shí)代的艱難曲折，失望與希望并存。

海洋強(qiáng)國(guó)展覽通過(guò)模型、多媒體互動(dòng)展現(xiàn)的方式，展示出我國(guó)作為21世紀(jì)的海洋大國(guó)，著眼于中國(guó)特色社會(huì)主義事業(yè)發(fā)展全局，統(tǒng)籌國(guó)內(nèi)外兩個(gè)大局，堅(jiān)持陸海統(tǒng)籌，堅(jiān)持走依海復(fù)國(guó)、以海強(qiáng)國(guó)、人海和諧、合作共贏的發(fā)展道路，扎實(shí)推進(jìn)海洋強(qiáng)國(guó)建設(shè)的歷程。

海上對(duì)外交流展區(qū)以海上對(duì)外交流為主題，展示復(fù)原宋元福船，以及相關(guān)的航海船舶數(shù)據(jù)及航?？萍?，通過(guò)大型展區(qū)陳列，互動(dòng)體驗(yàn)，公共藝術(shù)設(shè)計(jì)，及文物陳列等形式，展現(xiàn)古代人們利用海洋技術(shù)及海洋裝備，與南嶼島國(guó)及沿線國(guó)家進(jìn)行文化和貿(mào)易的交流。

海洋自然展區(qū)包括遠(yuǎn)古海洋、今日海洋、大海星辰、龍的時(shí)代——海洋爬行動(dòng)物展、航海發(fā)現(xiàn)之旅5個(gè)展廳。

遠(yuǎn)古海洋展廳包括洪荒海洋——前寒武紀(jì)海洋、生命海洋——古生代海洋、龍海滄?！猩Ｑ?、新生海洋——新生代海洋四個(gè)部分內(nèi)容，是目前國(guó)內(nèi)展品較全、面積最大的古海洋專(zhuān)題展廳，展覽從地球的形成引出海洋是怎樣形成的思考，通過(guò)對(duì)海洋的認(rèn)知，認(rèn)識(shí)到生命最早起源于海洋，引申出對(duì)生命形成的探索，通過(guò)地質(zhì)年代表揭示地質(zhì)年代與生命進(jìn)化的關(guān)系，最后說(shuō)明地球海洋的變化一刻也不會(huì)停止，現(xiàn)代海洋世界等待觀眾去探索和發(fā)現(xiàn)。

今日海洋展廳包括本底海洋、生命海洋、海洋環(huán)境與可持續(xù)發(fā)展三大部分，將展出標(biāo)本5000余件，整個(gè)展廳將陳列許多令人嘆為觀止的精美標(biāo)本，有長(zhǎng)達(dá)9. 4米的鯨鯊，7米~8米的白鯨等，極其罕見(jiàn)的懷孕雙髻鯊塑化標(biāo)本，海底滑翔機(jī)——蝠鲼、大王烏賊以及300余種五彩斑斕的魚(yú)類(lèi)，100多種海生鳥(niǎo)類(lèi)，還有目前世界上最完整的一套中國(guó)海域無(wú)脊椎動(dòng)物標(biāo)本，其品類(lèi)多達(dá)4600余種，展覽面積超過(guò)30平方米。

大海星辰展廳包括星漢燦爛、日月之行、遨游太陽(yáng)系、星海漫游、星際大航海時(shí)代、超越目力6個(gè)部分。廣闊與神秘是大海和星空共同的特點(diǎn)，本展廳以海洋為主線，向觀眾展示人們?cè)谔剿骱Ｑ筮^(guò)程中的天文學(xué)發(fā)現(xiàn)與發(fā)明。

龍的時(shí)代——海洋爬行動(dòng)物展包括科學(xué)與傳說(shuō)，陸地、海洋和天空，“龍”的時(shí)代三個(gè)主要展示內(nèi)容，展廳面積1000平方米，展覽以海洋是生命的搖籃為主題，講述地球生命起源于海洋，自誕生那一刻起就開(kāi)始努力擺脫水環(huán)境，踏上征服陸地的旅程，富于戲劇性的是，它們歷經(jīng)千辛萬(wàn)苦征服陸地后，不久便大規(guī)模地重返海洋，最終這一幕在6500萬(wàn)年以前戛然而止，絕大多數(shù)海洋爬行動(dòng)物和陸地上的恐龍一起滅絕了，成為這地球生命演化史上最為波瀾壯闊的一幕。

航海發(fā)現(xiàn)之旅展廳包括序廳、達(dá)爾文的環(huán)球考察、探秘大洋洲、冰凍荒原、非洲之旅、深入新大陸、奇境歐亞7個(gè)板塊。展覽以演化是物種形成理論為科學(xué)依據(jù)，以人類(lèi)的航海大發(fā)現(xiàn)為故事基礎(chǔ)，形成一條海洋生態(tài)與陸生動(dòng)物有機(jī)結(jié)合的故事線，以海洋對(duì)地理環(huán)境物種分布造成的影響為自然線索，以航海探險(xiǎn)科學(xué)發(fā)現(xiàn)為人文線索，讓觀眾跟隨科學(xué)家勇敢的腳步探索各大洲，感受波瀾壯闊的航海時(shí)代，開(kāi)啟一段精彩的航海發(fā)現(xiàn)之旅。

海洋科普教育區(qū)有4個(gè)科普教室，一個(gè)三角形開(kāi)放教室和一個(gè)寬大開(kāi)放活動(dòng)廳組成，教育區(qū)的主要服務(wù)對(duì)象是學(xué)齡兒童，主要承擔(dān)青少年海洋科普教育主題活動(dòng)，注重參與性，寓教于樂(lè)，增強(qiáng)親海、識(shí)海、護(hù)海意識(shí)。

海洋生態(tài)展區(qū)包括活體珊瑚生態(tài)展、活體魚(yú)類(lèi)展、活體水母展三個(gè)展廳，該展廳將與專(zhuān)業(yè)公司進(jìn)行合作展覽，采用由館方管理，專(zhuān)業(yè)公司飼養(yǎng)的方式。