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網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析揭示的常用活血化瘀中藥抗炎-抗血栓作用

 生物_醫(yī)藥_科研 2019-02-11

小編有話說(shuō):
【論文速遞】是我們新開的欄目,旨在把使用中醫(yī)傳承輔助平臺(tái)軟件發(fā)表的最新論文呈現(xiàn)在大家面前,供老師同學(xué)們參考。希望能為大家的研究工作開拓思路。


⊙作者:呂明,王泰一,田曉軒,石鑫慧,樊官偉,張硯,朱彥

⊙編輯:小余



以通利血脈、促進(jìn)血行和消散淤血為主要功效,用于治療淤血病證的藥物,稱為活血化瘀藥?;钛鲋谐伤帲╬romotingblood circulation and removing blood stasis, PBCRBS)臨床上常用于心腦血管相關(guān)疾病,具有抗血栓、抗凝血及防治動(dòng)脈硬化斑塊形成等作用,尤其在抗血栓方面,具有顯著療效。與抗血栓西藥相比,活血化瘀中藥盡管抗血栓作用平和,但具有多途徑、多靶點(diǎn)且不良反應(yīng)少等優(yōu)點(diǎn)。目前,活血化瘀中成藥的應(yīng)用十分廣泛,具有很好的療效,但因種類繁多、成分復(fù)雜,其協(xié)同配伍機(jī)制尚不明確。另外,與西藥相比,中成藥功能主治的描述普遍缺乏精準(zhǔn)的適應(yīng)癥表述,制約了其臨床的有效和安全應(yīng)用。因此,運(yùn)用簡(jiǎn)便有效的研究思路,分析活血化瘀中成藥配伍規(guī)律及其協(xié)同配伍抗血栓作用機(jī)制甚為有益。


材料與方法


方劑和單體收集

方劑主要來(lái)源于藥源網(wǎng)、找藥網(wǎng)及《中國(guó)藥典》和其他參考文獻(xiàn)。遴選原則:

①藥品說(shuō)明書功效主治中含有“活血化瘀”或“抗血栓”相關(guān)字樣。

②經(jīng)國(guó)家食品藥品管理總局(CFDA)網(wǎng)站查詢,具有“國(guó)藥準(zhǔn)字Z****”批準(zhǔn)文號(hào)。

③藥品主要成分為2味或2味以上中藥復(fù)方。

④成分相同、劑型不同的方劑按一個(gè)品種統(tǒng)計(jì)。單體主要通過(guò)TCMSP、TCMID、TCM-ID和TCMDatabase@Taiwan等數(shù)據(jù)庫(kù)查詢整理,結(jié)合PubChemeMolecules數(shù)據(jù)庫(kù)查詢單體對(duì)應(yīng)的CID或CAS號(hào),建立中藥單體數(shù)據(jù)源。


信息錄入

將上述遴選出的方劑經(jīng)專人分類整理后,輸入中醫(yī)傳承輔助平臺(tái)(TICMISS,V2.0),由雙人負(fù)責(zé)校準(zhǔn),確保數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性。將建立的中藥單體數(shù)據(jù)導(dǎo)入ingenuitypathway analysis(IPA)中,IPA通過(guò)單體的CID或CAS號(hào)識(shí)別數(shù)據(jù)。


分析方法

方劑分析:使用中醫(yī)傳承輔助系統(tǒng)“方劑優(yōu)化分析”功能,對(duì)活血化瘀中成藥進(jìn)行顯性和隱性配伍規(guī)律分析。

靶點(diǎn)分析:以血栓(thrombosis)為模型進(jìn)行檢索,得到相關(guān)分子靶點(diǎn)197個(gè),設(shè)為集合A;IPA識(shí)別的中藥單體共計(jì)128個(gè)(丹參33個(gè)、紅花47個(gè)、川芎48個(gè))設(shè)為集合B,二者進(jìn)行“PathExplorer”作用關(guān)系分析。用“moleculeactivity predictor(MAP)”功能預(yù)測(cè)單體對(duì)分子的上調(diào)或下調(diào)作用。用“coreanalysis”功能對(duì)作用靶點(diǎn)及相關(guān)通路信息進(jìn)行總結(jié)分析。


結(jié)果


1 活血化瘀中成藥單味藥頻次統(tǒng)計(jì)

收集到的224種活血化瘀類中成藥,其中含320味中藥。頻次統(tǒng)計(jì)(頻次≥10)結(jié)果顯示,35個(gè)常用中藥中,配伍使用最多的3味藥依次為丹參、川芎和紅花,見表1。




2 活血化瘀中成藥配伍規(guī)律分析

2.1 活血化瘀中成藥高頻配伍分析 活血化瘀組方配伍規(guī)律結(jié)果顯示,3味藥配伍使用最多的是丹參、川芎和紅花,見表2。設(shè)置支持度22、置信度0.9,進(jìn)行關(guān)聯(lián)規(guī)則分析。結(jié)果顯示,在活血化瘀中藥中,當(dāng)含有丹參、紅花時(shí),川芎出現(xiàn)的概率約為94%,進(jìn)一步說(shuō)明3味藥的配伍使用頻繁,見表3。同時(shí)含有這3味藥的代表中成藥有:丹芎通脈顆粒、精制冠心片、樂脈顆粒、丹紅化瘀口服液和血必凈注射液等。配伍使用最多的藥對(duì):丹參和川芎,代表方劑為通脈口服液;川芎和紅花,代表方劑為腦得生膠囊;三七和丹參,代表方劑為三七丹參片;丹參和紅花,代表方劑為丹紅注射液。




2.2 活血化瘀中成藥核心配伍分析 設(shè)置不同的支持度,對(duì)活血化瘀中成藥核心藥物組合進(jìn)行深度分析。結(jié)果顯示,隨著支持度的增加,既能體現(xiàn)不同藥物組合間的個(gè)性特征,又能突顯藥物間的核心組合。在支持度為20%時(shí),可以明顯看到丹參、川芎、紅花三者之間在活血化瘀中成藥中核心配伍關(guān)系;隨著支持度的遞減,除上述3味活血化瘀藥外,一些清熱、補(bǔ)氣、補(bǔ)血和開竅等藥物的配伍得到體現(xiàn),見圖1。


Figure 1 Network on core combinations in depth of PBCRBS formulae(support degree:10%,15%, 20%,confidence≥ 0.9)


3 基于IPA分析含丹參、川芎和紅花活血化瘀中成藥抗血栓作用機(jī)制

3.1 分析丹參、川芎和紅花所含單體與血栓相關(guān)靶點(diǎn)的作用關(guān)系 通過(guò)上述中醫(yī)傳承輔助平臺(tái)對(duì)活血化瘀中成藥的數(shù)據(jù)挖掘分析,無(wú)論在用藥頻率還是藥物的核心組合方面,丹參、川芎和紅花的作用得以凸顯,但其協(xié)同配伍作用機(jī)制尚不清楚。通過(guò)IPA的“PathExplorer”分析和“MAP”預(yù)測(cè)功能,總結(jié)含丹參、川芎和紅花活血化瘀中成藥的協(xié)同配伍抗血栓作用機(jī)制。分析結(jié)果得到丹參(9個(gè))、川芎(4個(gè))和紅花(8個(gè))所含活性成分(25個(gè))之間協(xié)同配伍與血栓相關(guān)分子(29個(gè))的作用關(guān)系及對(duì)分子靶點(diǎn)的上調(diào)、下調(diào)作用,其中6個(gè)分子上調(diào),19個(gè)分子下調(diào),4個(gè)分子雙向調(diào)節(jié),見圖2。


Figure 2 Analysis network on collaborativecompatibility of anti-thrombotic mechanism of Danshen, Chuanxiong, Honghua


3.2 29個(gè)血栓相關(guān)分子深度核心分析 通過(guò)IPA的“coreanalysis”功能對(duì)丹參、川芎和紅花可調(diào)控的29個(gè)血栓相關(guān)分子進(jìn)行深度分析。分析結(jié)果顯示,29個(gè)血栓相關(guān)分子中有23個(gè)分子與炎癥反應(yīng)有關(guān),如圖3。由IPA的“canonicalpathways”功能分析得知,23個(gè)炎癥反應(yīng)相關(guān)分子涉及到的通路較多,重點(diǎn)選擇與心血管(cardiovascular)疾病相關(guān)的通路進(jìn)行分析,并按照涉及的分子個(gè)數(shù)多少排序(-Log p-value為柱高,代表通路相關(guān)性;Ratio代表分子個(gè)數(shù)與通路分子總數(shù)的比值),相關(guān)性較高的為endothelin-1signaling、HF1α signaling和atherosclerosissignaling,如圖4。根據(jù)所得結(jié)果提示的信息,進(jìn)一步對(duì)丹參、川芎、紅花與29個(gè)分子的相關(guān)程度進(jìn)行總結(jié),分析其潛在的協(xié)同配伍機(jī)制。得到3味活血化瘀中藥所含單體與NOS2(受13個(gè)單體調(diào)節(jié))、PTGS2(受11個(gè)單體協(xié)同調(diào)節(jié))2個(gè)炎癥相關(guān)分子及IL-6(受9個(gè)單體協(xié)同調(diào)節(jié))、TNF(受9個(gè)單體協(xié)同調(diào)節(jié))、IL-1β(受6個(gè)單體協(xié)同調(diào)節(jié))3個(gè)炎癥因子關(guān)系最為密切,并且對(duì)這5個(gè)分子的作用關(guān)系均為下調(diào)。5個(gè)炎癥相關(guān)分子涉及的經(jīng)典通路相關(guān)性最高的為atherosclerosissignaling,見圖5。3味中藥所含單體和5個(gè)炎癥相關(guān)分子的詳細(xì)信息,見表4。由上述基于IPA的深度分析顯示,炎癥反應(yīng)與血栓形成的關(guān)系十分密切。通過(guò)對(duì)炎癥與血栓關(guān)系的相關(guān)文獻(xiàn)整理得知,抗炎治療可以抑制血栓的形成,抗血栓治療又可以抑制炎癥反應(yīng);炎癥誘導(dǎo)的靜脈血栓甚至在血管未損傷的情況下仍能形成。同時(shí),丹參、川芎和紅花3味中藥不但具有較好的抗血栓作用,而且抗炎效果顯著。3味中藥在方劑配伍中,多以君藥或臣藥與其他藥物配伍使用,在治療血栓相關(guān)疾病中起核心作用,具有顯著的臨床療效。由此推測(cè),含丹參、川芎和紅花活血化瘀中成藥的抗血栓作用主要與其抑制炎癥反應(yīng)有關(guān)。



Figure 3 The relationship between inflammatory responseand thrombosis



Figure 4 23 genes of inflammatory response related cardiovascularcanonical pathways (-Log p-value: therelevance of the molecules and pathways, ratio: molecules number / total moleculesnumber of pathway)



Figure 5 5 important genes of inflammatory responserelated cardiovascular canonical pathways(-Log p-value: the relevance of the molecules and pathways, ratio:molecules number / total molecules number of pathway)




討 論


剖析中成藥治療疾病的協(xié)同配伍作用機(jī)制是當(dāng)今中藥研究的熱點(diǎn)和難點(diǎn)。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)為藥物多成分、多靶點(diǎn)的研究與分析提供了很好的平臺(tái)。李慧穎等使用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的方法,通過(guò)網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫(kù)整理,建立計(jì)算模型,預(yù)測(cè)作用靶點(diǎn)等途徑分析了中成藥葛根芩連湯抗二型糖尿病的可能作用網(wǎng)絡(luò),具有很好的借鑒和指導(dǎo)意義。中醫(yī)傳承輔助系統(tǒng)和IPA軟件的結(jié)合使用,能夠在挖掘中成藥配伍規(guī)律的基礎(chǔ)上,分析藥物協(xié)同配伍與靶點(diǎn)的作用關(guān)系。不但為后續(xù)的研究提供了一個(gè)相對(duì)簡(jiǎn)易的分析研究方法,對(duì)闡明中成藥的物質(zhì)基礎(chǔ)和作用機(jī)制也具有較大意義。在今后的臨床用藥和活血化瘀中成藥的研發(fā)中,根據(jù)臨床適應(yīng)癥,可以考慮與丹參、川芎和紅花中的單味或多味藥配伍使用,或許會(huì)達(dá)到更好的臨床療效。


活血化瘀中成藥功效主治多以血瘀證、血栓相關(guān)疾病等為主。因此,本文選用血栓為模型,研究活血化瘀中成藥的抗血栓作用機(jī)制。血栓相關(guān)疾病包括心肌梗死、腦梗死和肺栓塞;組織器官缺血、壞死等,嚴(yán)重威脅人體健康。炎癥反應(yīng)是很多疾病引發(fā)的源頭并伴隨疾病的整個(gè)過(guò)程。炎癥可誘導(dǎo)內(nèi)皮損傷,從而導(dǎo)致生理抗凝劑的缺失,血管舒張功能減弱;炎癥還可以增加促凝因子的釋放,抑制溶解纖維蛋白的活性,從而促進(jìn)血栓形成。雖然,在過(guò)去一個(gè)多世紀(jì),血小板作為血栓與止血的中樞介質(zhì)一直是血小板生物學(xué)的研究重點(diǎn),但近10年中,大量的實(shí)驗(yàn)證據(jù)表明血小板除止血功能外,在介導(dǎo)多種炎癥、免疫和惡性疾病的過(guò)程中也起著關(guān)鍵作用??寡ê涂寡姿幬锏穆?lián)合使用已成為心血管藥物研發(fā)的熱點(diǎn)之一


本研究創(chuàng)新點(diǎn)在于

①近年諸多學(xué)者使用中醫(yī)傳承輔助平臺(tái)分析治療一些疾病的組方規(guī)律或含一些指定中藥的用藥規(guī)律,前期的工作對(duì)指導(dǎo)方劑的配伍使用有較好的參考性。本文在此基礎(chǔ)上,結(jié)合TCMSP、TCM-ID、PubChem和eMolecules等一些現(xiàn)代的生物信息學(xué)方法,并通過(guò)IPA特有的靶點(diǎn)分析功能,為后續(xù)活血化瘀中成藥協(xié)同配伍抗血栓作用機(jī)制研究提供了一定的參考價(jià)值。

②本文選擇的分析對(duì)象為市售活血化瘀類中成藥,患者易遵醫(yī)囑選擇購(gòu)買,分析其配伍規(guī)律具有很好的現(xiàn)實(shí)意義。

③通過(guò)中醫(yī)傳承輔助系統(tǒng)和IPA等生物信息方法的聯(lián)合應(yīng)用,形成了從宏觀到微觀、從臨床應(yīng)用到生物學(xué)本質(zhì)的研究思路,為中藥的協(xié)同配伍作用機(jī)制研究提供依據(jù)。


本研究局限性

①IPA收錄標(biāo)準(zhǔn)為影響因子大于3的文獻(xiàn),因此可能會(huì)造成一些有效單體數(shù)據(jù)的遺漏,但在一定程度上也確保了數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性。

②本文所得結(jié)論需要得到臨床和實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步驗(yàn)證分析。


綜上所述,丹參、川芎和紅花3味中藥在活血化瘀中成藥中配伍使用最為頻繁。含丹參、川芎和紅花活血化瘀中成藥抗血栓作用,主要與其抑制炎癥反應(yīng)有關(guān),抑制炎癥相關(guān)分子NOS2、PTGS2、IL-6、TNF和IL-1β及其相關(guān)通路,在今后含丹參、川芎和紅花活血化瘀中成藥抗血栓作用機(jī)制的研究中應(yīng)得以重視和關(guān)注。


參考文獻(xiàn):略。

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