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2018年全球新藥研發(fā)領域興起的七大新潮

 42ZB432 2019-01-31

前言


這幾年,我國的創(chuàng)新藥研發(fā)逐漸興起,但大多數(shù)創(chuàng)新藥研發(fā)企業(yè)都是在跟著國外走,選擇有潛力的靶點做Me-Too,部分企業(yè)所謂的新藥研發(fā)更是簡單到拿別人的藥物分子,輕微做一下結構改動就報上去了,有的項目總共合成的分子數(shù)都不超過100個。在這里,筆者對此不予置評,畢竟有的人運氣就是那么好,還能拿到風險投資,為什么不賭一賭呢?筆者撰寫此文,是希望大家在埋頭做研發(fā)的同時,也看看國外發(fā)展起來的一些研發(fā)新思路和新方法,從國外的思潮中,找到所謂的他山之石。


一. 人工智能的應用

人類的科技正在高速發(fā)展,創(chuàng)新藥研發(fā)的手段也隨著科技的進步而逐漸改進。早在50年前,人們的藥物篩選還處于“刀耕火種”的時代,效率低,速度慢。60年代后期,史克公司的科學家首次引入了現(xiàn)代化的藥物篩選理念,使用細胞對藥物進行初篩,并且第一個產(chǎn)品西咪替丁在1977年獲得FDA批準。80年代以后,人們開始考慮使用計算機模擬的方法輔助藥物篩選,ALZA的創(chuàng)始人聯(lián)合當時的科學家開發(fā)出全球第一個計算機模擬的藥物篩選軟件,然而這些手段似乎一直沿用至今。

近年來最大的科技進步當屬人工智能(artificial intelligence,AI),有的人甚至把人工智能的誕生視為第三次工業(yè)革命的結束和第四次工業(yè)革命的開啟。在研發(fā)領域引入AI或許是2018年來最大的變化,而且就在前幾天,諾和諾德宣布裁減研發(fā)人員,重組研發(fā)模式,并引入AI的應用。盡管諾和諾德此公告一出,引發(fā)了廣泛關注,然而諾和諾德并非第一家布局AI的公司。

Atomwise 是一家2012年才創(chuàng)建的公司,也是第一家使用深度神經(jīng)網(wǎng)絡“Deep neural networks”進行藥物結構設計的公司,目前該公司已經(jīng)獲得4500萬美元的融資,以發(fā)展AI驅動藥物設計的技術。該公司是計算機篩選藥物的集大成者,通過該公司的AtomNet平臺,每天可同時對1000萬個分子進行監(jiān)控,并預測它們的活性、毒性和不良反應等。截止目前,Atomwise已經(jīng)擁有50多個分子發(fā)現(xiàn)程序,可基于AI進一步迅速改良,不但已經(jīng)于默沙東、艾伯維等制藥公司達成合作,還與哈弗和杜克等知名大學達成了協(xié)議。

除了Atomwise,Sirenas、Insilico Medicine、Datavant、Verge Genomics、Engine Biosciences、XtalPi、Owkin和E-Therapeutics等都是AI驅動藥物設計與篩選的新銳,盡管他們的誕生時間并不長,但已經(jīng)廣泛引起了制藥巨頭的關注,其中Sirenas已經(jīng)與BMS達成了戰(zhàn)略合作??偠灾?,AI的潛力無窮大,AI用于新藥研發(fā)已經(jīng)初現(xiàn)端倪,相信在不遠的未來,隨著AI的高速發(fā)展,AI將從頭到尾地影響你我的制藥生活。

二. 小分子藥物的探索范圍大幅擴大

不要看到近年來生物藥開始斬頭露角就覺得小分子化學藥已經(jīng)日薄西山,相反,人們對小分子化藥的認識只是剛剛開始。一方面,簡單的碳原子通過復雜地組合可以形成數(shù)百億計的新有機分子,但人類上市的新分子化學實體不過幾千個而已,加上研究失敗的,人類研究過的小分子化合物也只是冰山一角。另一方面,人們對已知分子的認識也只是基于某一個或某幾個靶點,隨著人類對靶點和疾病信息通路認識的逐漸系統(tǒng)化,對已知分子的重新定位是一件非常有意義的事情。近年來,隨著篩選技術的不斷進步和AI技術的應用,這些看似不可能的事,漸漸地已經(jīng)變成了可能,它們正在推動小分子化藥突破瓶頸,向更寬、更深的空間發(fā)展。

截止目前,國外已經(jīng)有企業(yè)在著手發(fā)展這些技術,比如打造強大的數(shù)據(jù)庫,收集盡量多的分子,以實現(xiàn)藥物的廣義篩選和大規(guī)模篩選,比如GDB-17數(shù)據(jù)庫、ZINK數(shù)據(jù)庫、REadily AvailabLe數(shù)據(jù)庫和EnamineStore數(shù)據(jù)庫等,這些數(shù)據(jù)庫已收錄了數(shù)億計的分子,在人工智能的幫助下,可實現(xiàn)分子與靶點進行自動匹配和定位。

總而言之,時代在改變,我們也需要隨時應變,隨便基于原有的藥物分子合成幾個相似分子就想搞出Me-Too的思想已經(jīng)過時了。

三. RNA藥物

之前人們對藥物的認識主要集中在小分子化合物和大分子蛋白上,對RNA藥物的研究和認識一直都是不溫不火。然而RAN在蛋白表達中起到至關重要的作用,通過合成一些短鏈的RNA可以干擾基因的表達,彌補部分基因的缺失或矯正不正常基因的表達。隨著近年來幾個RNA或RNAi藥物相繼獲批上市,RNA藥物也逐漸火了起來。截止目前,至少有十幾家公司有專門的RNA藥物研究計劃,包括大型制藥公司(Biogen,默沙東,諾華,賽諾菲和輝瑞),以及像Arrakis Therapeutics和Expansion Therapeutics 這樣的生物技術初創(chuàng)公司,兩家公司已經(jīng)分別獲得3800萬美元和5500萬美元的A輪融資。


四. 新型抗生素研發(fā)


1924年,弗萊明發(fā)現(xiàn)了青霉素,開啟了人類探索抗生素的先河,40年代以后,成千上萬的抗生素陸續(xù)被開發(fā)出來,80年代以后,人類的常見細菌感染疾病已經(jīng)得到有效控制,抗生素的開發(fā)也隨著走入低谷。長期以來,抗生素的研發(fā)沒有實質性的突破,而且新型抗生素上市后大多都被限制使用,研發(fā)抗生素變得無利可圖。

然而近年來的超級菌事件讓人們陷入了恐慌,有科學家認為每年將有70萬人死于超級菌,而且這一數(shù)字將在2050年上漲到1000萬人。嚴峻的局勢加上各國政府的鼓勵,新型抗生素的研發(fā)又再次熱了起來。值得注意的是,最近抗生素領域最令人興奮的突破之一是,東北大學抗菌發(fā)現(xiàn)中心主任Kim Lewis及其他的團隊于2015年發(fā)現(xiàn)了Teixobactin及其類似物。這種強大的新抗生素類被認為有抵抗超級菌的潛力。去年,林肯大學的研究人員成功合成了teixobactin,向前又邁出了重要一步。

截止目前,teixobactin和其部分衍生物已經(jīng)進入臨床試驗,而且也有部分制藥企業(yè)加入了這一領域的競賽,如果不出意外,6-8年之后,這一類抗生素將步入市場,成為人類對抗超級菌的強有力武器。

五. 現(xiàn)代化的表型篩選

何為現(xiàn)代化的表型篩選?表型藥物篩選是基于生物體表型的藥物篩選方法,傳統(tǒng)表型藥物篩選是在動物疾病模型上篩選能夠改變表型的化合物,再深入探索化合物發(fā)揮藥理作用的靶點及作用機制。近年來,表型藥物篩選重新受到廣泛重視,并被賦予新的內(nèi)涵,形成了現(xiàn)代表型藥物篩選。隨著生物學研究相關技術和儀器設備的迅速發(fā)展,現(xiàn)代表型篩選與傳統(tǒng)表型篩選有些不同,可涉及更多更復雜的生理和病理過程,研究內(nèi)容深入到細胞水平,通過細胞水平的表型變化來發(fā)現(xiàn)新型藥物。

2011年,David Swinney和Jason Anthony發(fā)表了一篇文章,對1999-2008年間上市藥物的發(fā)現(xiàn)方法進行了研究,結果發(fā)現(xiàn),大部分First-in-class藥物 (28 個中的個17個)在發(fā)現(xiàn)過程中都采用了 現(xiàn)代化的表型篩選。這一有影響力的分析引發(fā)了自2011年以來表型藥物篩選的范式復興 ,最近,諾華公司的科學家對這一趨勢的現(xiàn)狀進行了回顧,并得出結論,雖然制藥研究組織在表型方法方面遇到了相當大的挑戰(zhàn),但在過去的5年里,基于傳統(tǒng)靶點篩選出的藥物數(shù)量正在減少,而表型篩選卻在進一步增加,2018年更是大潮的到來。

六.數(shù)字化的器官

去年年底,F(xiàn)DA批準了大冢制藥的數(shù)字化阿立哌唑,該藥物中含有一顆芯片,可實時監(jiān)控藥物在患者體內(nèi)的處置過程。雖然這是一個數(shù)字化醫(yī)療的典型案例,但這只是冰山一角,除了數(shù)字化的制劑,國外的先驅們已經(jīng)著手探索數(shù)字化的器官,以輔助藥物的篩選。

活細胞內(nèi)襯的微芯片不但可以徹底改變藥物的研發(fā)方式,而且對疾病的建模和個性化醫(yī)療都有幫助。這種植入細胞的微晶芯片被稱為“organ-on-a-chip”的藥物篩選模式,可以為科學家提供實時的數(shù)據(jù),可有效彌補動物篩選藥物的不足。當然了,這種過于理論化的高科技仍然面臨著實用性的問題,而且也有人在倫理上懷疑這種方式的合法性。

七. 生物打印


這十幾年來,人們一直在探索3D打印技術,而且3D打印的藥片已經(jīng)獲得FDA批準,然而3D打印藥片在醫(yī)藥界只是一種比較“Low”的手段,目前國外科學家已經(jīng)開始探索生物打印了。何為生物打印,簡單地說就是一種類似3D打印的技術,但打印出來的不是一般東西,而是有生命的器官。

人類的很多疾病通過器官移植就能夠解決,這就好比汽車壞了可以更換零件一樣。然而人類的器官目前并不能按照零件一樣批量生產(chǎn),生物打印技術有望讓這一愿望成為可能。不但如此,生物打印的器官還有望促進藥物的研發(fā),讓藥物篩選變得簡單化。

Cellink是一家成立于2016年的公司,是世界上首批能夠提供3D打印生物聚合物的公司之一,Cellink已經(jīng)與法國醫(yī)療技術公司CTI Biotech達成合作,專門生產(chǎn)癌癥組織,以大幅推進癌癥研究和藥物發(fā)現(xiàn)領域的發(fā)展。除了Cellink,OxSyBio也在積極探索生物打印技術,OxSyBio是一家從牛津大學剝離出來的公司,目前已經(jīng)完成了1000萬英鎊的A輪融資。



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