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【研發(fā)前沿】淺談塞內(nèi)卡病毒

 長(zhǎng)生果與無(wú)花果 2019-01-29

???一、前言

2002年,研究人員鑒定出一種名為塞內(nèi)卡病毒的新病毒,并被列為塞內(nèi)卡病毒屬中唯一的代表性病毒。此后至2014年底,關(guān)于該病毒的流行病學(xué)、發(fā)病機(jī)制、病理、臨床體征和診斷仍未取得任何進(jìn)展。塞內(nèi)卡病毒病是由A型塞內(nèi)卡病毒引起的動(dòng)物傳染病,主要感染豬,對(duì)不同年齡階段的豬都易感。這種疾病起初被認(rèn)為具有地域性,地域分布有限。北美研究人員或世界范圍的研究團(tuán)隊(duì)并未廣泛的研究該病,盡管這是一種水皰性疾病,可能是由于感染頻率低,僅有北美國(guó)家報(bào)道病例。

在2015年初,巴西、泰國(guó)和中國(guó)首次暴發(fā)了由塞內(nèi)卡病毒引起的水皰性疾病。同年,研究發(fā)現(xiàn)病毒感染與新生仔豬死亡率相關(guān)。與此同時(shí),美國(guó)也出現(xiàn)了同樣的病例。這一系列病例的報(bào)道引起了學(xué)者的關(guān)注,因此,近期關(guān)于塞內(nèi)卡病毒的研究越來(lái)越多。

二、歷史分類和分子特征

2002年,在美國(guó)馬里蘭州學(xué)者從PER.C6(人胚胎視網(wǎng)膜細(xì)胞)細(xì)胞系中偶然分離出塞內(nèi)卡谷病毒。研究人員推測(cè)該病毒可能是通過(guò)使用受污染的胎牛血清或豬胰蛋白酶引入細(xì)胞培養(yǎng)物中。由于該病毒是在位于蓋瑟斯堡(Seneca Creek State Park)附近的Neotropix公司的實(shí)驗(yàn)室中分離的,因此,被命名為Seneca Valley virus(SVV)。

直到2014年,在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中僅有三個(gè)完整的塞內(nèi)卡病毒病毒全基因組序列(GenBank登錄號(hào)NC_011349,DQ641257,KC667560)。因此,很少有基于病毒基因組的研究,其原型毒株為SVV-001(GenBank登錄號(hào)DQ641257)。通過(guò)構(gòu)建種系發(fā)育樹(shù),明確了該病毒的分類學(xué)地位——屬于小核糖核酸病毒科(Picornaviridae),與心病毒屬(Cardiovirus)的親緣關(guān)系較近。2015年,國(guó)際病毒分類委員會(huì)(ICTV)將SVV更名為“A型塞內(nèi)卡病毒(Senecavirus A,SVA)”,其所在的屬命名為“塞內(nèi)卡病毒屬(Senecavirus)”。

SVV-001具有微小RNA病毒基因組的典型特征,具有標(biāo)準(zhǔn)的L-4-3-4布局,即先導(dǎo)蛋白(L)、P1(裂解VP1、VP2、VP3和VP4四種結(jié)構(gòu)蛋白)、P2(裂解成2A、2B和2C三種非結(jié)構(gòu)蛋白)、P3(裂解成3A、3B、3C和3D四種非結(jié)構(gòu)蛋白)。SVV基因組RNA由大約7200個(gè)核苷酸(nt)組成,其中在5’UTR部分中有666 nt,在3’UTR部分中有71nt和poly(A)尾部。該病毒基因組僅有一個(gè)開(kāi)放閱讀框(open reading frames,ORF),編碼約2180個(gè)氨基酸的多聚蛋白。

1 A型塞內(nèi)卡病毒基因組結(jié)構(gòu)

對(duì)SVV-001的5’UTR序列分析,揭示其有高水平的二級(jí)結(jié)構(gòu)。在5’UTR區(qū)域具有內(nèi)部核糖體進(jìn)入位點(diǎn)(Internal ribosome entry site,IRES),其功能是通過(guò)抑制細(xì)胞RNA的翻譯來(lái)獨(dú)立翻譯病毒RNA。406~625 nt序列與丙型肝炎病毒(黃病毒科)的相似性為57.3%,提示該病毒的IRES是IV型。SVA的基因組特征與心病毒屬的成員非常相似,特別是與多肽P1,2C,3C和3D相關(guān)。其中,2A蛋白的C端存在小RNA病毒科病毒的核糖體跳躍基序NPG↓P,3B蛋白(即VPg蛋白)作為病毒RNA合成的引物,3D蛋白構(gòu)成RNA依賴性RNA聚合酶(RdRp),參與病毒復(fù)制。然而,SVV-001與心病毒屬的2B、3A和IRES類型不同。SVV-001的基因組區(qū)2A,2B,3A和3B與所有其它小微RNA病毒科的差異很大。

隨著中國(guó),美國(guó),加拿大和泰國(guó)不斷爆發(fā)由SVA引起的水皰性疾病,目前已測(cè)定出42株病毒的全基因組序列和15株病毒的部分基因組序列(截至到2017年6月8日)。因此,目前在病毒分子流行病學(xué)方面可取得一些進(jìn)展。結(jié)果顯示,2015~2016年間,共檢測(cè)到42個(gè)完整的病毒基因組序列,與參考毒株SVV-001具有較高的同源性(93.8%~99.9%)。基于VP1基因,我們可將SVA分為三個(gè)拓?fù)湫停ㄒ?jiàn)圖2):進(jìn)化枝I包括最初確定的病毒株,包括SVV-001;進(jìn)化枝II包括1988年至1997年間鑒定的美國(guó)病毒株;進(jìn)化枝III包含2001年至2016年在巴西、加拿大、中國(guó)、泰國(guó)和美國(guó)鑒定的毒株。值得注意的是,在進(jìn)化枝III內(nèi)SVA毒株具有明顯的地理隔離(來(lái)自同一個(gè)國(guó)家的毒株聚在同一個(gè)大進(jìn)化枝)。盡管原型毒株和目前的SVA毒株之間存在差異,但是在病毒基因組中的遺傳變化是否改變了病毒的不同生物學(xué)特性,和是否導(dǎo)致了塞內(nèi)卡病毒感染的出現(xiàn)仍然是未知的。

2 基于VP1基因構(gòu)建SVA種系發(fā)育樹(shù)

三、致病性

最初,研究人員認(rèn)為塞內(nèi)卡病毒與任何特定的病理學(xué)沒(méi)有關(guān)聯(lián),對(duì)其的研究主要集中在人類癌癥治療中潛在的溶瘤特性。但是,加拿大(2008)和美國(guó)(2012)通過(guò)RT-PCR在水皰癥狀的豬僅檢測(cè)到SVA,提示SVA可能是引起豬水皰病的病原。

2015年之前,研究人員將SVA感染實(shí)驗(yàn)豬,但觀察不到任何水皰性疾病的臨床癥狀,未能滿足科赫法則,因此,研究人員認(rèn)為SVA不是引起豬水皰病的病原。然而,2015年,學(xué)者對(duì)9周齡豬感染SVA試驗(yàn)中并觀察到水皰病變。之后越來(lái)越多的研究證明SVA與豬原發(fā)性水皰?。╥diopathic vesicular disease,IVD)有關(guān)。SVA感染引發(fā)的水皰病與口蹄疫(foot-and-mouth disease,F(xiàn)MD)、豬水皰病(swine vesicular disease,SVD)、豬水皰疹(vesicular exanthema of swine,VES)和水皰性口炎(vesicular stomatitis,VS)引起的病變極為類似,根據(jù)臨床癥狀,無(wú)法對(duì)豬的五種水皰性疾病進(jìn)行鑒別診斷。

早期的SVA分離株對(duì)豬無(wú)明顯的致病性,感染豬不出現(xiàn)臨床癥狀。近年來(lái),越來(lái)越多的SVA分離株可以導(dǎo)致豬發(fā)病,成年豬感染初期出現(xiàn)厭食、嗜睡和發(fā)熱等癥狀,隨后鼻鏡部、口腔上皮、舌和蹄冠等部位的皮膚、黏膜產(chǎn)生水皰,繼而發(fā)生繼發(fā)性潰瘍和破潰現(xiàn)象,嚴(yán)重時(shí)蹄冠部的潰瘍可以蔓延至蹄底部,造成蹄殼松動(dòng)甚至脫落,病豬出現(xiàn)跛行現(xiàn)象。新生仔豬(7日齡以內(nèi))死亡率顯著增加(高達(dá)30%~70%),偶爾伴有腹瀉癥狀。

四、溶瘤特性研究

SVA不感染人類,但能在具有神經(jīng)內(nèi)分泌功能的腫瘤細(xì)胞中增殖,且其通過(guò)RNA中間體復(fù)制,繞過(guò)DNA階段,因此不能整合到宿主細(xì)胞基因組中,使得該病毒在腫瘤治療中使用是安全的。SVA是一種天然的溶瘤病毒,對(duì)腫瘤的專嗜性高,可以選擇性地感染包括小細(xì)胞肺癌細(xì)胞(Small Cell Lung Cancer,SCLC)在內(nèi)的神經(jīng)內(nèi)分泌特征的腫瘤細(xì)胞以及包括視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤、神經(jīng)母細(xì)胞瘤和髓母細(xì)胞瘤在內(nèi)的小兒實(shí)體腫瘤細(xì)胞。在I期臨床試驗(yàn)采用靜脈注射劑量遞增的患者有神經(jīng)內(nèi)分泌腫瘤,SVA即使在高劑量(1011病毒顆粒/kg)的給藥時(shí),也不會(huì)引起嚴(yán)重的不良反應(yīng)。目前,Neotropix公司將分離到的SVA開(kāi)發(fā)成抗癌治療藥物,NTX-010。

五、展望

SVA在巴西、美國(guó)和我國(guó)幾乎同時(shí)發(fā)生,說(shuō)明其從被發(fā)現(xiàn)至今,或有進(jìn)一步擴(kuò)大和爆發(fā)的可能,而作為新發(fā)傳染病,其潛在影響是不可估量的,不得不引起足夠的重視。雖然,目前已經(jīng)取得SVA的部分進(jìn)展,但仍有許多問(wèn)題亟待更多的科學(xué)家去解決:

(1)病毒的具體特征,包括其生物學(xué)和分子進(jìn)化,pH穩(wěn)定性,受體和共受體,細(xì)胞大分子,復(fù)制周期,環(huán)境生存等;

(2)塞內(nèi)卡病毒流行病學(xué),如病毒如何通過(guò)其它非豬儲(chǔ)存宿主或媒介傳播到其他國(guó)家;

(3)仔豬的致病性;

(4)宿主免疫應(yīng)答,包括初乳中的保護(hù)性抗體滴度。

研發(fā)部王會(huì)寶 編審 祁光宇


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