在臨床上，流式細(xì)胞術(shù)被用于精確檢測(cè)異常細(xì)胞群，如對(duì)血液系統(tǒng)腫瘤進(jìn)行診斷和分型，或在HIV感染時(shí)檢測(cè)CD4 T淋巴細(xì)胞。流式細(xì)胞術(shù)也可用于檢測(cè)生理過(guò)程，例如移植前干細(xì)胞計(jì)數(shù)（CD34陽(yáng)性細(xì)胞計(jì)數(shù)）或組織相容性測(cè)試。

在正常細(xì)胞分化成熟過(guò)程中，不同的抗原會(huì)在其表面或內(nèi)部出現(xiàn)或消失，通過(guò)檢測(cè)這些抗原的存在或缺失，我們能夠確定細(xì)胞的種類和發(fā)育階段。這些在白細(xì)胞表面的抗原，又稱為白細(xì)胞分化抗原或簇分化抗原 (cluster of differentiation, CD)。疾病情況下，例如白血病時(shí)，本來(lái)數(shù)量很少或本不應(yīng)該出現(xiàn)的原始細(xì)胞，大量出現(xiàn)在骨髓或外周血中，通過(guò)檢測(cè)這些細(xì)胞CD分子表達(dá)情況，可以準(zhǔn)確知道這些細(xì)胞的類型，以便進(jìn)行診斷和治療。臨床常用的CD分子見(jiàn)下表(Biomedical Uses of Flow Cytometry.  James L. Weaver and Maryalice Stetler-Stevenson From: Molecular Biomethods Handbook, 2nd Edition. Edited by: J. M. Walker and R. Rapley ? Humana Press, Totowa, NJ 1039)。

WHO血液系統(tǒng)腫瘤的分類基于：

形態(tài)學(xué)(morphology)、

免疫表型(immunophenotype)、

遺傳學(xué)異常(genetic abnormalities)和

臨床特征(clinical features)的。

一些造血系統(tǒng)腫瘤具有特異性的免疫表型，在缺乏免疫表型檢測(cè)的情況下診斷非常困難。因此懷疑血液系統(tǒng)惡性腫瘤的標(biāo)本應(yīng)該通過(guò)流式細(xì)胞術(shù)或免疫組織化學(xué)檢測(cè)免疫表型。與免疫組化檢測(cè)相比，流式具有更高的靈敏度，主觀性更低，也更快速，在幾個(gè)小時(shí)內(nèi)就能夠?qū)Π籽∵M(jìn)行分型。在評(píng)估血液系統(tǒng)疾病是否能夠使用單克隆抗體治療或其治療效果時(shí)，流式也具有明顯的優(yōu)勢(shì)，因?yàn)閱慰沟陌锌乖仨氃诩?xì)胞表面表達(dá)，才能治療有效。

液體標(biāo)本是流式細(xì)胞儀的理想標(biāo)本類型，外周血和骨髓標(biāo)本是最常見(jiàn)的，使用枸櫞酸鈉和EDTA抗凝均可，即使用綠頭或紫頭抗凝管采集流式標(biāo)本。胸水、腹水、腦脊液也是很常見(jiàn)的標(biāo)本類型，因?yàn)檫@些標(biāo)本中細(xì)胞數(shù)量可能比較少，送檢標(biāo)本量要盡可能的多一些。當(dāng)然，能夠獲得單細(xì)胞懸液的固體組織也是可以進(jìn)行檢測(cè)的。流式檢測(cè)的是細(xì)胞表面的抗原，標(biāo)本新鮮很重要，最好在24h內(nèi)送檢，室溫保存即可。

需要注意的是，慢性粒單核細(xì)胞白血病(Chronic myelomonocytic leukemia, CMML)  和陣發(fā)性睡眠性血紅蛋白尿

(paroxysmal nocturnal hemoglobinuria, PNH) 檢測(cè)一定要使用外周血標(biāo)本，

而想要診斷骨髓增生異常綜合征(myelodysplastic syndromes, MDS)，最好使用骨髓標(biāo)本。

血液病患者的整個(gè)病程中需要多次進(jìn)行流式檢測(cè)：初診時(shí)需要流式幫助確診和分型，病程中需要流式監(jiān)測(cè)治療效果，骨髓移植時(shí)需要流式對(duì)供者細(xì)胞進(jìn)行CD34陽(yáng)性細(xì)胞進(jìn)行準(zhǔn)確計(jì)數(shù)，化療或者骨髓移植完全緩解后需要流式進(jìn)行微小殘留病變(minimal residual disease, MRD)的檢測(cè)。同時(shí)，流式還可以通過(guò)抗原表達(dá)模式的不同進(jìn)行疾病診斷。

如下圖左為正常骨髓下階段粒細(xì)胞的CD13/CD16表達(dá)模式，而右圖則是MDS患者下階段粒細(xì)胞的CD13/CD16表達(dá)模式。

一篇發(fā)表在2015年BLOOD雜志上的文章發(fā)現(xiàn)，外周血中CD14 CD16-單核細(xì)胞在單核細(xì)胞群中比例超過(guò)94%時(shí)，診斷CMML的敏感性和特異性都在90%以上。其模式如下，左圖為CMML，右圖為反應(yīng)性單核細(xì)胞增多。

(Characteristic repartition of monocyte subsets as a diagnostic signature of chronic myelomonocytic leukemia. Blood. 2015; 125 (23): 3618- 3626)

流式報(bào)告的形式可以是散點(diǎn)圖、直方圖，也可以是數(shù)值的。我們會(huì)在散點(diǎn)圖中用不同顏色標(biāo)注出異常細(xì)胞和標(biāo)本中殘留的正常細(xì)胞（通常是淋巴細(xì)胞，作為內(nèi)對(duì)照），描述異常細(xì)胞的比例及表達(dá)的抗原，最后給出結(jié)論及建議。下面分別為白血病和PNH的流式報(bào)告，我們分別使用了散點(diǎn)圖和直方圖進(jìn)行報(bào)告。

急性白血病免疫分型

(Acute leukemia immunophenotyping)

淋巴細(xì)胞增殖性疾病免疫分型

(lymphoproliferative disorders Immunophenotyping)

B淋巴細(xì)胞增殖性疾病免疫分型

(B lymphoproliferative disorders immunophenotyping)

T淋巴細(xì)胞增殖性疾病免疫分型

(T lymphoproliferative disorders Immunophenotyping)

CD55、CD59檢測(cè)（PNH）

(CD55、CD59 analysis, PNH)

白血病/淋巴瘤免疫分型(復(fù)查) /微小殘留白血病檢測(cè)

(minimal residual disease, MRD)

MDS免疫表型分型

(MDS immunophenotyping)

漿細(xì)胞疾病免疫分型

(Plasma cell disorders Immunophenotyping)

腦脊液細(xì)胞免疫表型分析

(Cerebrospinal fluid cells Immunophenotyping)

TCRvβ克隆性檢測(cè)

(TCRvβclonality detection)

ZAP70,CD38(CLL/SLL)

(ZAP70 and CD38 detection in CLL/SLL)

CD34陽(yáng)性細(xì)胞計(jì)數(shù)

(CD34 cell count)