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RNA質(zhì)檢參數(shù)OD260/OD280、OD260/OD230的意義

 ypgao 2018-05-16
280、320、230、260nm下的吸光度分別代表了核酸、背景(溶液渾濁度)、鹽濃度和蛋白等有機(jī)物的值。
A230 測(cè)定其它碳源物質(zhì),如酚,糖類(lèi)等;
A260 是核酸的吸收峰測(cè) RNA 和 DNA,引物等的濃度用的;
A280 是蛋白質(zhì)的吸收峰。
一般的,我們只看 OD260/OD280(Ratio,R)——1.8~2.0時(shí),我們認(rèn)為RNA中蛋白或者時(shí)其他有機(jī)物的污染是可以容忍的,不過(guò)要注意,當(dāng)用 Tris 作為緩沖液檢測(cè)吸光度時(shí),R 值可能會(huì)大于2(一般應(yīng)該是<2.2的)。當(dāng) R<1.8時(shí),溶液中蛋白或者其他有機(jī)物的污染比較明顯,你可以根據(jù)自己的需要決定這份RNA的命運(yùn)。當(dāng) R>2.2時(shí),說(shuō)明 RNA 已經(jīng)水解成單核酸了。 純RNA 的A260/A280的比值為 2.0。
OD260/OD230的比值還表明 RNA 的純度——其值 <2.0 表明裂解液中有亞硫氰胍和β-巰基乙醇?xì)埩?,其?2.4,需用乙酸鹽,乙醇沉淀 RNA。
附:
260/230的值,一般不要小于2.0,小的話表明有異硫氰酸胍,β-巰基乙醇或乙醇的殘留。補(bǔ)救的方法是再沉淀一次,然后重復(fù)乙醇洗滌的過(guò)程。但從我的經(jīng)驗(yàn)看,后面RNA丟得很多……因此提RNA時(shí)就注意了
個(gè)人經(jīng)驗(yàn),260/230偏小的話,提取時(shí)可以改進(jìn)以下幾點(diǎn):
1.加氯仿抽提后取少一點(diǎn)上清,不要貪多。
2.加乙醇洗的時(shí)候,多晃幾次,盡量讓RNA沉淀整片懸浮起來(lái)(有時(shí)候確實(shí)浮不起來(lái)也沒(méi)辦法。)
3.棄乙醇的時(shí)候,用槍吸而不是傾倒,倒的話經(jīng)常有液滴留在管壁上,倒不干凈。第一次用藍(lán)槍頭吸,可以不完全吸干,免得吸到沉淀;然后短暫離心把殘余酒精甩到管底,看準(zhǔn)了用白槍頭盡量吸干凈。RNA量大,被白槍頭弄掉一點(diǎn)也沒(méi)關(guān)系。
4.溶解前晾干的時(shí)間可以長(zhǎng)一點(diǎn),5分鐘也沒(méi)關(guān)系的。標(biāo)準(zhǔn)的做法說(shuō)是不能晾太久,等沉淀開(kāi)始變透明就要加水溶解,但是我晾過(guò)10分鐘的,后面RNA量也很大??赡芰看?,雖然有些溶解不了,最后濃度還是高。
可能不完全正確,但是以前我出現(xiàn)過(guò)260/230偏小的問(wèn)題,按上面方法改進(jìn)了操作,后面就好了。
還有一種原因可能是多糖類(lèi)雜質(zhì)殘留,可試試用LiCl沉淀。
RNA溶液的

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