藻類是生活在淡水和海水的光合自養(yǎng)型生物，通過光合作用向水體供氧，增加水體的溶解氧，供好氧，菌就不斷地降解有機質(zhì)，而藻類可以利用細菌降解有機質(zhì)產(chǎn)生的 CO 2 進行光合作用，如此循環(huán)形成的體系，稱為“藻菌共生”

1、藻類與細菌的相互促進

    藻類與細菌具有錯綜復(fù)雜的關(guān)系，每種藻形成自己獨特的菌群且兩者之間存在特異的種間關(guān)系。藻類主要通過營養(yǎng)物質(zhì)交換，氣體、酸堿度調(diào)節(jié)等促進細菌生長。小球藻通過直接吸收和利用水體的NH₄⁺-N 及提高溶解氧，能夠促進好氧異養(yǎng)芽孢桿菌的生長。細菌作為水生態(tài)系統(tǒng)中重要的分解者，通過復(fù)雜的代謝活動參與水環(huán)境內(nèi)多種物質(zhì)的分解與轉(zhuǎn)化過程，從而作為微藻營養(yǎng)物質(zhì)的提供者與加工者;同時細菌還可以通過產(chǎn)生或分泌對微藻有益的代謝物質(zhì)或胞外產(chǎn)物，從而呈現(xiàn)對微藻的促進作用。例如，水體中的氨化細菌和硝化細菌能夠?qū)⒑袡C物質(zhì)分解并進一步通過硝化作用將其轉(zhuǎn)化為 NH₃⁺-N，為藻類生長提供無機氮;好氧細菌通過利用微藻周圍水體中高濃度的溶解氧，為藻類提供還原性較強的生存環(huán)境

2、藻類與細菌的相互抑制

     藻類具有產(chǎn)生活性次生代謝產(chǎn)物的基本機制，這些代謝產(chǎn)物包括脂肪酸、酚類、多糖等種類，它們具有抑制或消滅某些細菌的作用，顫藻對地衣芽孢桿菌的抑制是通過其胞外產(chǎn)物而非通過營養(yǎng)物質(zhì)的競爭而產(chǎn)生的。藻類直接與細菌競爭營養(yǎng)物質(zhì)而起到間接抑制作用，高種群密度微囊藻的生長對硝化細菌的生長有明顯的抑制作用微囊藻與硝化細菌之間對 NH ₄⁺-N 等存在競爭性利用。細菌對藻類的抑制或拮抗作用表現(xiàn)在多個方面，主要通過營養(yǎng)競爭、產(chǎn)生化學(xué)毒素、釋放溶藻酶等方式實現(xiàn)。在特定的水環(huán)境中，當(dāng)沒有外源營養(yǎng)物質(zhì)補充時，通過對營養(yǎng)的競爭，細菌就會抑制藻類的生長。假單胞菌、蛭弧菌、芽孢桿菌、腐螺旋菌等細菌均可產(chǎn)生化學(xué)毒素釋放于水體中，進而抑制某些微藻如甲藻和硅藻的生長，甚至殺死藻細胞。

3、水體生態(tài)平衡

      水體中藻類與細菌間的相互促進、相互抑制的作用，才能將環(huán)境中的污染物在一定的時間范圍內(nèi)自然降解，保持水體的自然生態(tài)鏈，即為水體的自凈作用。當(dāng)水體中溶入了過多的營養(yǎng)物質(zhì)，生態(tài)鏈?zhǔn)艿經(jīng)_擊，在生態(tài)鏈承受的范圍內(nèi)，細菌和藻類的共生關(guān)系仍然在延續(xù)，但由于藍藻自身的生理特點，細菌對藻類的抑制作用處于劣勢，水體朝富營養(yǎng)化的方向發(fā)展，此時，向水體中投加微生物，與藻類競爭N、P等營養(yǎng)，有效修復(fù)微生物菌群結(jié)構(gòu)，增強細菌的抑制能力，可有效防止水體向富營養(yǎng)化的方向發(fā)展，維持水體基本的生態(tài)平衡。

     當(dāng)營養(yǎng)物質(zhì)的量超過了生態(tài)鏈的承受范圍，生態(tài)鏈就會受到破壞。結(jié)合諸多外在因素，包括溫度、光照、營養(yǎng)鹽、水文等，藻類不再依賴細菌的代謝產(chǎn)物，直接利用水中的營養(yǎng)物質(zhì)迅速繁殖，細菌對藻類的抑制作用迅速崩潰，甚至受到藻毒素的危害；水中的捕食者（水生動物）的獵食速度遠遠低于藻類的生長速度，藻類生長不受限制，水體成了藻類的天下。藻類在大量繁殖的同時，部分細胞也在老化衰亡，衰亡的細胞破裂降解，消耗了水體氧氣，造成溶氧急劇下降，除此之外，破裂的藍藻會釋放藍藻毒素、氨氮、亞確酸鹽等有毒有害物質(zhì)，對水域生態(tài)系統(tǒng)帶來一系列嚴重后果。此時水體中的細菌生長繁殖受到抑制，處于休眠狀態(tài)或部分死亡，溶藻菌和噬藻體雖然可存活，但對藻類的抑制作用效果甚微。此時，在水體中投放微生物的效果微乎幾微，必需尋求一種生態(tài)的、綜合的治理方法方可修復(fù)水體的生態(tài)平衡。

4、生態(tài)平衡的恢復(fù)

      在水體富營養(yǎng)化時，及時向水體中投放微生物，保持水體菌相與藻相的平衡，維持菌藻共生的關(guān)系，是防止水體富營養(yǎng)化的一種行之有效的途徑。但當(dāng)富營養(yǎng)化未能及時控制導(dǎo)致藻華等一系列嚴重后果時，單一的物理、化學(xué)或生物方法都不能達到理想的效果，即只能治標(biāo)而不能治本。生態(tài)的綜合治理方法包括物理、化學(xué)除藻，再利用生物酶將水體中的藻毒素降解，改善底泥（破裂藻細胞沉積物），最后投放復(fù)合微生物菌劑，抑制藻類的生長，維持菌種共生的關(guān)系，從根本上恢復(fù)水體的生態(tài)平衡。