|
在一些NB文章中經(jīng)?？吹絊anger測序峰圖，峰圖的具體用法可以參考下面幾篇文章：Naturebiotechnology, 2015, 33(5): 445-449（下圖，左）; Genome Res.2016 26: 499-509（下圖，右上）; PLoS Genet 10(4): e1004274（下圖，右下）。 很多軟件都可以打開Ab1文件查看峰圖，比如常見的BioEdit、SnapGene、Chromas。但這三個軟件都沒有明確的 “圖片另存為”或 “Export Graphs” 這樣的命令。那么，該如何導(dǎo)出圖片呢？ “可以截屏啊”，朋友告訴我。 但是由于電腦屏幕的分辨率一般較低，截圖獲得的圖片太小，品質(zhì)達不到雜志要求。今天就以Chromas（版本2.6.4）為例，介紹一種高質(zhì)量峰圖導(dǎo)出的方法（BioEdit和SnapGene的方法完全一樣）。 嗯，Chromas為免費的軟件，可在官網(wǎng)http:///wp/chromas/下載。
1. ab1格式文件的準備 送樣測序后，測序公司一般會給兩個格式的文件，seq格式的文件是單純的堿基序列，另一個ab1格式的文件就是這里我們所需的峰圖文件（見下圖）。
2. 峰圖的顯示與導(dǎo)出 首先，通過Open按鈕打開ab1文件，峰圖的顯示如下圖。
接下來，點擊Print按鈕或File\Print（快捷鍵：Ctrl+P），打開打印對話框，如下圖，Printer: Name選Adobe PDF（1），接著點擊Propeities按鈕（2），設(shè)置打印屬性。
在布局選項卡將頁面的方向改為橫向（3）。
頁面大小為A4即可（注意也可以選A3或更大，使目標序列片段不出現(xiàn)中間”換行“，以便后期截取目標片段），其他選項默認。
回到Print窗口，點擊“OK”按鈕，選擇導(dǎo)出PDF到桌面，下圖為部分峰圖。
等一下，這里導(dǎo)出的文件是PDF，可是我想要JPG或tif格式的圖片怎么辦？其實，PDF也是一種圖片格式，這里導(dǎo)出的PDF為矢量圖，Adobe 公司的Acrobat 、Photoshop、illustrator都可以用來另存為所需格式的圖片或者進行編輯處理。 3. 可能遇到的問題 在點擊Print命令后，遇到彈出安裝打印機的提示框，如下圖所示，說明本地打印后臺處理程序服務(wù)沒有開啟（一般開機自啟動）。
本地打印后臺處理程序服務(wù)一般開機自啟動，可手動開啟或者重啟電腦。手動開啟的方法見下圖：
小結(jié) 主要通過序列查看軟件的print命令，生成PDF格式的矢量圖。PDF文件可用Adobe acrobat 、Ps、Ai等編輯或轉(zhuǎn)化所需的圖片格式。此外，Chromas每種堿基對應(yīng)的峰都位于單獨的圖層，可編輯
|
|
|
