營改增前，有不少建筑企業(yè)的項目部在索取各種成本發(fā)票時，往往存在成本發(fā)票上的抬頭是“某某項目部”的名字的現(xiàn)象。
營改增后，由于抵扣增值稅進項稅必須符合“合同流、資金流、票流和物流（勞務(wù)流）四流合一的關(guān)鍵要件，絕對不能索取發(fā)票抬頭是“某某項目部”名字的增值稅專用發(fā)票。
具體的發(fā)票開具和管理如下：
1、發(fā)票開具的原則。在真實交易的情況下，所有的增值稅專用發(fā)票必須與合同相匹配。
在真實交易的情況下，增值稅專用發(fā)票與合同相匹配，是合同流與票流相統(tǒng)一的重要體現(xiàn)。如果增值稅專用發(fā)票與合同不相匹配，則要么是不符合發(fā)票開具要求的合規(guī)發(fā)票；要么是虛開增值稅專用發(fā)票；要么是假的增值稅發(fā)票。
由于項目部的所有交易事項都是總公司隊外簽訂的合同，所以營改增后的所有成本發(fā)票，必須開具發(fā)票抬頭是總公司的名字，絕對不能開具發(fā)票抬頭為“某某項目部”名字的增值稅專用發(fā)票或增值稅普通發(fā)票。
2、發(fā)票開具管理要點：必須在合同中有發(fā)票開具條款加以約束
營改增后，為了更好的管理發(fā)票開具，必須在所有的合同中都必須增加發(fā)票開具條款。該條款主要約定以下內(nèi)容：
（1）發(fā)票開具的時間；
（2）發(fā)票開具的內(nèi)型：增值稅專用發(fā)票還是增值稅普通發(fā)票；
（3）發(fā)票開具方開具假票或虛開發(fā)票承擔的責任。
3、一般計稅方法項目、簡易計稅方法項目混用材料的發(fā)票開具。
如果建筑企業(yè)采購建筑材料既用于一般計稅方法計征增值稅的項目又用于簡易計稅方法計征增值稅的項目，則必須在采購合同中分別約定材料供應(yīng)商供應(yīng)一般計稅方法項目、簡易計稅方法項目的建筑材料數(shù)量、價格。并在合同中約定一般計稅方法項目的建筑材料開增值稅專用發(fā)票，簡易計稅方法項目的建筑材料開增值稅普通發(fā)票。
4、采購機械設(shè)備和周轉(zhuǎn)材料既用于一般計稅項目也用于簡易計稅項目的發(fā)票開具。
根據(jù)[2016]36號文件附件1：《營業(yè)稅改征增值稅試點實施辦法》第二十七條第（一）項的規(guī)定用于簡易計稅方法計稅項目、免征增值稅項目、集體福利或者個人消費的購進貨物、加工修理修配勞務(wù)、服務(wù)、無形資產(chǎn)和不動產(chǎn)的進項稅額不得從銷項稅額中抵扣。其中涉及的固定資產(chǎn)、無形資產(chǎn)、不動產(chǎn)，僅指專用于上述項目的固定資產(chǎn)、無形資產(chǎn)（不包括其他權(quán)益性無形資產(chǎn)）、不動產(chǎn)。
特別要注意的是，本條規(guī)定涉及的固定資產(chǎn)、無形資產(chǎn)、不動產(chǎn)的進項稅額不得從銷項稅額中抵扣的重要關(guān)鍵條件是“專用于”簡易計稅方法計稅項目、免征增值稅項目、集體福利或者個人消費的進項稅額才不得從銷項稅額中抵扣。
換句話說，如果施工企業(yè)購買的固定資產(chǎn)、無形資產(chǎn)（不包括其他權(quán)益性無形資產(chǎn)）、不動產(chǎn)既用于一般計稅方法計征增值稅的項目也用于簡易計稅方法計征增值稅的項目，就不屬于“專用于”的情形，就可以抵扣增值稅進項稅額?；谝陨隙愂照叩姆治?，建筑企業(yè)采購既用于一般計稅項目也用于簡易計稅項目的機械設(shè)備和其他周轉(zhuǎn)材料，則要求供應(yīng)商開具17%稅率的增值稅專用發(fā)票。
5、簡易計稅項目的成本發(fā)票的開具
由于建筑企業(yè)簡易計稅方法計征增值稅的項目不可以抵扣增值稅進項稅額，所以建筑企業(yè)簡易計稅方法計征增值稅的項目，所發(fā)生的所有成本，在簽訂采購合同時，必須在采購合同中明確發(fā)票開具條款：供應(yīng)商必須開具增值稅普通發(fā)票。
6、匯總開具材料發(fā)票、運輸發(fā)票、辦公用品和勞保用品發(fā)票的要求
國稅發(fā)[2006]156號第十二條規(guī)定：一般納稅人銷售貨物或者提供應(yīng)稅勞務(wù)可匯總開具專用發(fā)票。匯總開具專用發(fā)票的，同時使用防偽稅控系統(tǒng)開具《銷售貨物或者提供應(yīng)稅勞務(wù)清單》，并加蓋發(fā)票專用章。
基于此規(guī)定，沒有供應(yīng)商開具銷售清單的開具“材料一批”、匯總運輸發(fā)票、辦公用品和勞動保護用品的發(fā)票，不可以抵扣增值稅進項稅金。
因此，建筑企業(yè)在采購建筑材料、設(shè)備、辦公用品和勞保用品和運輸勞務(wù)時，如果供應(yīng)商在開具增值稅專用發(fā)票，在增值稅專用發(fā)票的摘要里填寫“材料一批”、“設(shè)備一批”、“辦公用品”、“勞保用品”和“匯總運輸”時，必須在合同中發(fā)票條款一項中約定：供應(yīng)商和運輸方必須提供其防偽稅控系統(tǒng)開具的《銷售貨物或者提供應(yīng)稅勞務(wù)清單》，并加蓋發(fā)票專用章。
7、運輸費用“一票制”和“二票制”的開具
運輸費用發(fā)票的“一票制”是指運輸費用與材料采購費用開在一張增值稅發(fā)票里，運輸費用含在材料價格里，按照稅率17%開具的一種開票方法。而“二票制”是指運輸費用和材料采購費用各開一張增值稅發(fā)票，運輸費用按照11%開具，材料費用按照17%開具的一種開票方法。
如果建筑企業(yè)期望材料供應(yīng)商開具運輸費用“一票制”的運輸費用發(fā)票，則必須在采購合同中的價格條款中約定：價格含運輸費用。
